Circrna

Sirkulære RNA (circRNA) er ikke-kodende RNA som danner sirkulære strukturer og har flere regulatoriske roller, inkludert å konkurrere med miRNA om målgener og proteinbinding. BMKCloud circRNA-rørledningen er designet for analyse av rRNA-utarmet biblioteker med et godt annotert og referansegenom av høy kvalitet. Analysen starter med lest trimming og kvalitetskontroll, etterfulgt av lesetilpasning til referansegenomet og prediksjon av nye circRNA, kombinert med identifisering av kjente circRNAer fra databaser. De tilsvarende miRNA -målene og circRNA -vertene identifiseres deretter. Differensialuttrykksanalyse avslører differensialt uttrykte circRNA, og de tilsvarende vertene er funksjonelt merket for å trekke ut berikede biologiske funksjoner.