Produkty

Gotowe biblioteki Illumina

Biblioteki gotowe Illumina Obraz wyróżniony

Technologia sekwencjonowania Illumina, oparta na Sekwencjonowaniu przez Syntezę (SBS), to globalnie przyjęta innowacja NGS, odpowiadająca za generowanie ponad 90% światowych danych sekwencjonowania. Zasada SBS polega na obrazowaniu znakowanych fluorescencyjnie odwracalnych terminatorów podczas dodawania każdego dNTP, a następnie ich rozszczepianiu, co umożliwia włączenie kolejnej zasady. Dzięki obecności wszystkich czterech dNTP związanych z odwracalnym terminatorem w każdym cyklu sekwencjonowania, naturalna konkurencja minimalizuje stronniczość włączenia. Ta wszechstronna technologia obsługuje zarówno biblioteki pojedynczego odczytu, jak i biblioteki z parzystymi końcami, zaspokajając potrzeby szeregu zastosowań genomicznych. Wysoka przepustowość i precyzja sekwencjonowania Illumina czynią je kamieniem węgielnym badań genomicznych, umożliwiając naukowcom zgłębianie zawiłości genomów z niezrównaną szczegółowością i wydajnością.

Nasza usługa sekwencjonowania gotowych bibliotek umożliwia klientom przygotowanie bibliotek sekwencyjnych z różnych źródeł (mRNA, całego genomu, amplikonów, bibliotek 10x i innych). Następnie biblioteki te mogą zostać wysłane do naszych centrów sekwencjonowania w celu przeprowadzenia kontroli jakości i sekwencjonowania na platformach Illumina.

Skontaktuj się z nami

Szczegóły usługi

Wynik demonstracyjny

Cechy

●Platformy:Illumina NovaSeq 6000 i NovaSeq X Plus

●Tryby sekwencjonowania:PE150 i PE250

●Kontrola jakości bibliotek przed sekwencjonowaniem

●Kontrola jakości i dostarczanie danych sekwencjonowania:dostarczanie raportu kontroli jakości i surowych danych w formacie fastq po demultipleksowaniu i filtrowaniu odczytów Q30

Zalety usługi

●Wszechstronność usług sekwencjonowania:Klient może wybrać sekwencjonowanie według toru, komórki przepływowej lub według ilości wymaganych danych (częściowe sekwencjonowanie torów).

●Bogate doświadczenie w zakresie platformy sekwencjonowania Illumina:z tysiącami zamkniętych projektów o różnym profilu.

●Dostarczenie raportu kontroli jakości sekwencjonowania:z metrykami jakości, dokładnością danych i ogólną wydajnością projektu sekwencjonowania.

●Proces sekwencjonowania dojrzałego:z krótkim czasem realizacji.

●Rygorystyczna kontrola jakości:stosujemy surowe wymogi kontroli jakości, aby zagwarantować dostarczanie wyników o niezmiennie wysokiej jakości.

Przykładowe platformy

Platforma	Komórka przepływowa	Tryb sekwencjonowania	Jednostka	Szacowany wynik
NovaSeq X	10B (8 pasów)	PE150	Pojedynczy pas ruchu Częściowy pas ruchu	375 Gb/pasmo
NovaSeq X	25B (8 pasów)	PE150	Pojedynczy pas ruchu Częściowy pas ruchu	1000 Gb/pasmo
NovaSeq 6000	Komórka przepływowa SP (2 ścieżki)	PE250	Komórka przepływowa Pojedynczy pas ruchu Częściowy pas ruchu	325-400 M odczytów / Pas
NovaSeq 6000	Komórka przepływowa S4 (4 tory)	PE150	Komórka przepływowa Pojedynczy pas ruchu Częściowy pas ruchu	~800 Gb/pasmo

Przykładowe wymagania

	Ilość danych (Gb)	Stężenie (qPCR) PE150	Stężenie (qPCR) PE250	Tom
Częściowy pas ruchu	G ≤ 10	≥ 1 nM	≥ 2nM	≥ 25 μl
	10 < G ≤ 50	≥ 2 nM	≥ 3nM	≥ 25 μl
	50 < G ≤ 100	≥ 3 nM	≥ 4nM	≥ 25 μl
	G > 100	≥ 4 nM	≥ 4nM	≥ 25 μl
Pojedynczy pas ruchu	Na pas ruchu	≥ 1,5 nM/pula biblioteczna	≥ 2 nM/pula biblioteczna	≥ 25 µL/pula biblioteczna

Oprócz stężenia i całkowitej ilości, wymagany jest także odpowiedni wzór szczytowy.

Uwaga: Sekwencjonowanie ścieżek w bibliotekach o niskiej różnorodności wymaga wprowadzenia impulsu PhiX w celu zapewnienia niezawodnego wywoływania zasad.

Zalecamy przesłanie wstępnie skompletowanych bibliotek jako próbek do sekwencjonowania ścieżek. Jeśli chcesz, aby BMKGENE przeprowadził skompletowanie bibliotek, zapoznaj się z wymaganiami dotyczącymi bibliotek dla częściowego sekwencjonowania ścieżek.

Rozmiar biblioteki (mapa szczytowa)

W przypadku sekwencjonowania PE150 rozmiar wstawki powinien wynosić 300–400 pb (bez adapterów); w przypadku sekwencjonowania PE250 rozmiar wstawki powinien wynosić 150–500 pb (bez adapterów).
Biblioteki powinny mieć pojedynczy główny pik, nie powinny zawierać zanieczyszczeń adaptera ani dimerów starterów.

Skontaktuj się z nami, jeśli Twoje próbki nie spełniają wymagań dotyczących materiałów wyjściowych.

Skontaktuj się z nami

Przepływ pracy serwisowej

Kontrola jakości biblioteki

Sekwencjonowanie

Kontrola jakości danych

Realizacja projektu

Poprzedni: Sekwencjonowanie DNA/RNA - sekwencer PacBio

Następny: Sekwencjonowanie DNA/RNA – sekwencer nanoporowy

Raport kontroli jakości biblioteki

Przed sekwencjonowaniem sporządzany jest raport na temat jakości biblioteki, oceniający ilość biblioteki i stopień fragmentacji.

Raport kontroli jakości sekwencjonowania

Tabela 1. Statystyki danych sekwencjonowania.

Identyfikator próbki	BMKID	Surowe odczyty	Surowe dane (bp)	Czyste odczyty (%)	Q20(%)	Q30(%)	GC(%)
C_01	BMK_01	22 870 120	6 861 036 000	96,48	99,14	94,85	36,67
C_02	BMK_02	14 717 867	4 415 360 100	96,00	98,95	93,89	37.08