ØСилен опит: Над 200 000 проби са обработени в BMK, обхващащи различни типове проби, включително клетъчна култура, тъкан, телесна течност и т.н. и над 7 000 mRNA-Seq проекта, затворени, обхващащи различни изследователски области.
ØСтрога система за контрол на качеството: Основните точки за контрол на качеството през всички стъпки, включително подготовка на проби, подготовка на библиотеката, секвениране и биоинформатика са под строг мониторинг, за да се осигурят висококачествени резултати.
ØНалични множество бази данни за анотиране на функции и проучвания за обогатяване за изпълнение на различни изследователски цели.
ØСледпродажбени услуги: Следпродажбени услуги са валидни за 3 месеца след завършване на проекта, включително проследяване на проекти, отстраняване на проблеми, въпроси и отговори на резултатите и др.
Библиотека | Стратегия за секвениране | Препоръчителни данни | Контрол на качеството |
Поли А обогатен | Illumina PE150 | 6 Gb | Q30≥85% |
нуклеотиди:
чистота | Интегритет | Количество |
OD260/280≥1,7-2,5 OD260/230≥0,5-2,5Ограничено или никакво замърсяване с протеин или ДНК, показано върху гела. | За растения: RIN≥6,5;За животни: RIN≥7;28S/18S≥1,0;ограничена или никаква изходна височина | Конц.≥30 ng/μl;Обем ≥ 10 μl;Общо ≥ 1,5 μg |
Тъкан: Тегло (суха):≥1 g
*За тъкани, по-малки от 5 mg, препоръчваме да изпратите бързо замразена (в течен азот) тъканна проба.
Клетъчна суспензия:Брой клетки = 3×106- 1×107
* Препоръчваме да изпратите замразен клетъчен лизат.В случай, че броят на тази клетка е по-малък от 5×105, се препоръчва бързо замразяване в течен азот, което е за предпочитане за микро екстракция.
Кръвни проби:Обем≥1 ml
микроорганизъм:Маса ≥ 1 g
Контейнер: 2 ml епруветка за центрофуга (не се препоръчва калайено фолио)
Етикетиране на пробата: група+реплика, напр. A1, A2, A3;B1, B2, B3 ... ...
пратка:
Биоинформатика
еукариотни работен процес за анализ на секвениране на иРНК
Биоинформатика
ØКонтрол на качеството на необработените данни
ØРеферентно подравняване на генома
ØАнализ на структурата на транскрипта
ØКоличествено определяне на експресията
ØАнализ на диференциалния израз
ØФункционално анотиране и обогатяване
1.Крива на насищане на данни за иРНК
2.Анализ на диференциална експресия-Вулкан график
3.KEGG анотация върху DEG
4.GO класификация на DEG