Продукти

BMKMANU S1000 пространствен транскриптом

Пространствената организация на клетките играе жизненоважна роля в различни биологични процеси, като имунна инфилтрация, развитие на ембриони и т.н. Пространственото транскриптомно секвениране, което показва профилиране на генната експресия, като същевременно запазва информация за пространствена позиция, предоставя страхотни прозрения в тъканната архитектура на ниво транскриптом.С развитието на технологията ултра-ясната морфология на тъканите и реалната структурна разлика на пространствената молекулна експресия трябва да се изучават с по-висока разделителна способност.BMKGENE предоставя цялостна услуга за пространствено секвениране на транскриптоми на едно гише от проби до биологични прозрения.

Технологиите за пространствена транскриптомия дадоха възможност за нови перспективи в разнообразна изследователска сфера чрез разрешаване на профила на генна експресия с пространствено съдържание в хетерогенни проби.

Чип за пространствен транскриптом: BMKMANU S1000

Платформа: Платформа Illumina NovaSeq

Свържете се с нас

Подробности за услугата

Биоинформатика

Демо резултати

BMKMANU S1000 Техническа схема на пространствен транскриптом

Предимства на BMKMANU S1000

1) Субклетъчна разделителна способност: Всяка област на улавяне съдържа >2 милиона пространствени баркодирани петна с диаметър 2,5 µm и разстояние от 5 µm между центровете на петна, което позволява пространствен анализ на транскриптоми с субклетъчна разделителна способност (5 µm).

2) Многостепенен анализ на разделителната способност: Гъвкав многостепенен анализ, вариращ от 100 μm до 5 μm за разрешаване на различни тъканни характеристики при оптимална разделителна способност.

3) Изчерпателно профилиране на транскриптоми: Транскриптите, уловени от целия тъканен слайд, могат да бъдат анализирани, без ограничение на броя на целевите гени и целевата област.

Сервизни спецификации

Библиотека	Стратегия за последователност	Препоръчва се извеждане на данни
S1000 cDNA библиотека	BMKMANU S1000-Illumina PE150	60Gb/проба

Примерни изисквания

проба	Номер	Размер	Качество на РНК
OCT вграден тъканен блок	2-3 блока/мостра	Прибл.6.8x6.8x6.8 mm³	RIN≥7

За повече подробности относно насоките за подготовка на проби и работния процес на обслужване, моля, не се колебайте да говорите с aBMKGENE експерт

Работен поток на услугата

Дизайн на експеримента

Доставка на мостри

Предварителен експеримент

Пространствено баркодиране

Изграждане на библиотека

Секвениране

Анализ на данни

Следпродажбени услуги

Предишен: 10x пространствен транскриптом на Genomics Visium

Следващия: Секвениране на целия геном на растение/животно

Данните, генерирани от BMKMANU S1000, се анализират с помощта на софтуера “BSTMatrix”, който е независимо проектиран от BMKGENE, включително:

1) Генериране на матрица за генна експресия
2) HE обработка на изображения
3) Съвместим с последващ софтуер на трети страни за анализ
4) Онлайн “BSTViewer” помага за получаване на резултати от визуализация при различни разделителни способности.

1.Клъстериране на място

s1000 (4)