Продукти

Секвениране на ДНК/РНК – нанопорен секвенатор

Секвениране на ДНК/РНК – Представено изображение на нанопорен секвенатор

ONT секвенирането е технология за секвениране на електрически сигнал в реално време с една молекула, базирана на нанопори, принципът на секвениране на всяка платформа е един и същ.Двуверижната ДНК/РНК ще се свърже с нанопорест протеин, вграден в биофилма и се развива под ръководството на моторния протеин, под действието на разликата в напрежението от двете страни на биофилма, ДНК/РНК нишките преминават през протеина на нанопорния канал при определено скорост.Поради разликите в химичните свойства на различните бази на ДНК/РНК веригата, когато една единствена база или ДНК молекула преминава през нанопорния канал, това ще предизвика промяна на различни електрически сигнали.Чрез откриване и съпоставяне на тези сигнали могат да бъдат изчислени съответните основни типове и откриването в реално време на последователността може да бъде завършено.

Свържете се с нас

Подробности за услугата

Демо резултат

Подробности за услугата Характеристики

Платформа	Размер на библиотеката	Теоретичен добив на данни (на клетка)	Точност на една база	Приложения
Нанопора	8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR	70-90Gb/клетка	85-92%	SV извикване, De novo, Секвениране в пълна дължина, Iso-Seq, Генна анотация, Откриване на ДНК метилиране

Предимства на услугата

● Над 5 години опит в платформата за секвениране на PacBio с хиляди затворени проекти с различни видове.
● BMKGENE е официален партньор на Oxford Nanopore, с двойно платформено РНК/ДНК сертифициране.
● Има масови модели секвенсери с пълно оборудване и достатъчна производителност на секвениране.
● Въз основа на платформата Nanopore, повече от 10 изследвания на Denovo върху животни и растения са публикувани в международно признати списания.

Примерни изисквания

Тип проба

Количество

Концентрация (Qubit®)

Сила на звука

Чистота

други

Геномна ДНК

Зависи от изискването за данни

≥20 ng/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.2;

OD260/230≥1,5;

Ясен пик при 260 nm, без замърсявания

Концентрацията трябва да се измерва чрез Qubit и Qubit/Nanopore ≤ 2

Обща РНК

≥1.2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.5;

OD260/230=0,5-2,5；без замърсявания

RIN стойност ≥7,5

Работен процес на услугата

приготвяне на пробата

Изграждане на библиотека

Секвениране

Анализ на данни

Доставка на проект

Предишен: Секвениране на ДНК/РНК – Illumina Sequencer

Следващия: Секвениране на усилен фрагмент със специфичен локус (SLAF-Seq)

Оценка на качеството на данните на ДНК проба

Таблица 1. Статистика за чисти данни.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	cleanN50Len	cleanN90Len	cleanMeanLen	cleanMaxLen	cleanMeanQual
ДНК_BMK01	1,218,239	26.37	1,121,736	25,90	28,014	15,764	23 090	143,181	9

Оценка на качеството на данните на РНК проба

Таблица 1. Статистика за чисти данни.

Име на файл	ClientID	ReadNum	BaseNum	N50	Средна дължина	Максимална дължина	MeanQscore
РНК_BMK001	C2	8,947,708	4,047,230,083	398	452	129,227	В12