条形 Банер-03

Продукти

ДНК/РНК секвениране - нанопор секвенсор

ONT секвенирането е еднократна технология за секвениране на електрически сигнал в реално време, базирана на нанопори, принципът на секвениране на всяка платформа е един и същ. Double-stranded DNA/RNA will bind to nanoporous protein embedded in the biofilm and unwinding under the lead of motor protein, under the action of voltage difference from both sides of the biofilm, DNA/RNA strands pass through the nanopore channel protein at a certain процент. Поради разликите в химичните свойства на различните основи на нишката на ДНК/РНК, когато една основа или ДНК молекула преминава през канала на нанопор, това ще доведе до промяна на различни електрически сигнали. Чрез откриване и съответствие на тези сигнали, съответните базови типове могат да бъдат изчислени и може да бъде завършено откриването в реално време на последователността.


Подробности за услугата

Демо резултат

Функции за подробности за услугата

Платформа

Размер на библиотеката

Теоретични данни добив (на клетка)

Точност на едно база

Приложения

Нанопор

8kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR

70-90GB/клетка

85-92%

SV извикване, de novo, секвениране в пълна дължина, ISO-сек, генно анотация, откриване на метилиране на ДНК

Предимства на услугата

● Над 5 -годишен опит в платформата за секвениране на PacBio с хиляди затворени проекти с различни видове.
● BMKGene е официален партньор на Oxford Nanopore, с двойна платформа РНК/ДНК сертифициране.
● Съществуват основни модели на секвенсори с пълно оборудване и достатъчна пропускателна способност.
● Въз основа на платформата Nanopore, повече от 10 изследвания за животни и растения Denovo са публикувани в международно известни списания.

Изисквания за извадка


Тип проба

Сума

Концентрация (Qubit ®)

Обем

Чистота

Други

Геномна ДНК

Зависи от изискването за данни

 ≥20ng/μl

≥15 μl

OD260/280 = 1.7-2.2;

OD260/230≥1.5 ;

Ясен връх при 260 nm , Без замърсявания

Концентрацията трябва да бъде измерена чрез Кубит и Кубит/Нанопор ≤ 2

Обща РНК

≥1.2μg

≥100 μg/μl

≥15 μl

OD260/280 = 1,7-2,5;

OD260/230 = 0,5-2,5 ; Без замърсяване

Стойност на RIN ≥7.5

 

Работен процес на обслужване

Подготовка на пробата

Подготовка на пробата

Подготовка на библиотеката

Библиотечно строителство

Секвениране

Секвениране

Анализ на данните

Анализ на данните

Проба QC

Доставка на проекта


  • Предишни:
  • Следваща:

  • Оценка на качеството на данните на ДНК пробата

    Таблица 1. Статистика за чисти данни.

    BMKID

    rawseqnum

    Rawsumbase

    cleanseqnum

    CleanSumbase

    CleanN50Len

    Cleann90Len

    CleanMeanlen

    CleanMaxlen

    CleanMeanQual

    DNA_BMK01

    1,218,239

    26.37

    1,121,736

    25.90

    28,014

    15 764

    23,090

    143,181

    9

    Оценка на качеството на данните на пробата на РНК

    Таблица 1. Статистика за чисти данни.

    Име на файл

    ClientId

    Readnum

    Basenum

    N50

    Средна дължина

    Maxlength

    MeanQScore

    RNA_BMK001

    C2

    8 947 708

    4,047,230,083

    398

    452

    129,227

    Q12

    Фигура 1. Разпределение на дължината на четене

    A3

    Фигура 2. Качествено разпределение на оценките на чисти данни

    A4

    Фигура 3. Дължина и качествено разпределение на оценките на чисти данни

    A5

    Вземете оферта

    Напишете съобщението си тук и ни го изпратете

    Изпратете вашето съобщение до нас: