Продукти

Гъбичен геном

Biomarker Technologies осигурява изследване на генома, фин геном и пълен геном на гъбички в зависимост от конкретната изследователска цел.Секвениране на генома, сглобяване и функционална анотация могат да бъдат постигнати чрез комбиниране на секвениране от следващо поколение + секвениране от трето поколение за постигане на сглобяване на геном на високо ниво.Технологията Hi-C може също да се използва за улесняване на сглобяването на генома на ниво хромозома.

Платформа:PacBio Продължение II

Нанопора PromethION P48

Платформа Illumina NovaSeq

Свържете се с нас

Подробности за услугата

Демо резултати

Предимства на услугата

● Налични са множество стратегии за последователност за различни изследователски цели

● Голям опит в сглобяването на генома на гъбите с над 10 000 сглобени генома с пълна пене.

● Професионален екип за техническа поддръжка след продажба, отговарящ на по-специфични изследователски нужди.

Сервизни спецификации

Обслужване	Стратегия за последователност	Гарантирано качество	Очаквано време за изпълнение
Гъбична фина карта	Illumina 50X+Nanopore 100X	Contig N50≥2 Mb	35 работни дни
Гъбична фина карта	PacBio HiFi 30X	Contig N50≥2 Mb	35 работни дни
Пълна карта на гъбичките	Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X	Коефициент на закотвяне на хромозома >90%	45 работни дни

Биоинформатични анализи

● Контрол на качеството на необработените данни

● Сглобяване на генома

● Анализ на геномни компоненти

● Анотация на функцията на гена

● Сравнителен геномен анализ

Примерни изисквания и доставка

Примерни изисквания:

ЗаДНК екстракти:

Тип проба	Количество	Концентрация	Чистота
ДНК екстракти	> 1,2 μg	> 20 ng/μl	OD260/280= 1.6-2.5

За тъканни проби:

Примерен тип

Препоръчителна обработка на пробата

Съхранение и транспортиране на проби

Едноклетъчна гъба

Наблюдавайте дрождите под микроскоп и ги събирайте в тяхната експоненциална фаза

Прехвърлете културата (съдържаща приблизително 3-4,5e9 клетки) в епендорф от 1,5 или 2 ml.(Запази на лед)

Центрофугирайте епруветката за 1 минута при 14000 g, за да съберете бактерии и внимателно отстранете супернатантата

Затворете епруветката и замразете бактериите в течен азот за поне 1-3 часа.Съхранявайте епруветката в хладилник -80 ℃.

Замразете пробите в течен азот за 3-4 часа и ги съхранявайте в течен азот или -80 градуса за дългосрочно съхранение.Изисква се мостра за доставка със сух лед.

Макро гъбички

Препоръчва се тъкан във фаза на активен растеж.

Изплакнете тъканта с вода без ендотоксини, след това със 70% етонал.

Запазете пробата в криоепруветки.