-
Single-nucleus RNA Sequencing
Ang pag-uswag sa usa ka cell capturing ug indibidwal nga teknik sa pagtukod sa librarya nga naghiusa sa high-throughput sequencing nagtugot sa mga pagtuon sa ekspresyon sa gene sa cell-by-cell nga basehan.Gitugotan niini ang usa ka mas lawom ug kompleto nga pagtuki sa sistema sa mga komplikado nga populasyon sa cell, diin labi nga gilikayan niini ang pagtago sa ilang heterogeneity pinaagi sa pagkuha sa kasagaran sa tanan nga mga selula.
Bisan pa, ang pipila ka mga selyula dili angay nga himuon nga usa ka cell suspension, mao nga ang uban nga mga pamaagi sa pag-andam sa sample - ang pagkuha sa nucleus gikan sa mga tisyu gikinahanglan, nga mao, ang nucleus direkta nga gikuha gikan sa mga tisyu o cell ug giandam sa usa ka-nucleus nga suspensyon alang sa usa ka- pagkasunodsunod sa selula.
Naghatag ang BMK og 10× Genomics ChromiumTM base sa single-cell RNA sequencing service.Kini nga serbisyo kaylap nga gigamit sa mga pagtuon sa mga pagtuon nga may kalabotan sa sakit, sama sa pagkalainlain sa immune cell, heterogeneity sa tumor, pag-uswag sa tisyu, ug uban pa.
Spatial transcriptome chip: 10 × Genomics
Plataporma: Illumina NovaSeq Platform
-
BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome
Ang spatial transcriptomics nag-una sa siyentipikong kabag-ohan, nga naghatag gahum sa mga tigdukiduki sa pagsusi sa makuti nga mga pattern sa ekspresyon sa gene sulod sa mga tisyu samtang gipreserbar ang ilang spatial nga konteksto.Taliwala sa lain-laing mga plataporma, ang BMKGene nagpalambo sa BMKManu S1000 Spatial Transcriptome Chip, nga nanghambog uggipauswag nga resolusyonsa 5µM, pagkab-ot sa subcellular range, ug pagpaganamulti-level nga mga setting sa resolusyon.Ang S1000 chip, nga adunay gibana-bana nga 2 ka milyon nga mga spot, naggamit sa mga microwell nga gipatong sa mga beads nga puno sa mga spatially barcoded capture probes.Usa ka librarya sa cDNA, nga gipadato sa mga spatial barcode, giandam gikan sa S1000 chip ug pagkahuman gisunod sa plataporma sa Illumina NovaSeq.Ang kombinasyon sa spatially barcoded samples ug UMIs nagsiguro sa katukma ug specificity sa datos nga namugna.Ang talagsaon nga hiyas sa BMKManu S1000 chip anaa sa iyang versatility, nga nagtanyag sa multi-level nga mga setting sa resolusyon nga mahimong maayong pagkahan-ay sa lain-laing mga tisyu ug lebel sa detalye.Kini nga adaptability nagbutang sa chip isip usa ka talagsaon nga pagpili alang sa nagkalain-laing spatial transcriptomics nga mga pagtuon, pagsiguro sa tukma nga spatial clustering nga adunay gamay nga kasaba.
Gamit ang BMKManu S1000 chip ug uban pang mga spatial transcriptomics nga mga teknolohiya, ang mga tigdukiduki makakuha og mas maayo nga pagsabot sa spatial nga organisasyon sa mga selula ug sa komplikadong mga interaksyon sa molekula nga mahitabo sulod sa mga tisyu, nga naghatag ug bililhong mga pagsabot sa mga mekanismo nga nagpahiping biological nga mga proseso sa usa ka halapad nga natad, lakip ang oncology, neuroscience, developmental biology, immunology ug botanical studies.
Plataporma: BMKManu S1000 chip ug Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Ang spatial transcriptomics usa ka cutting-edge nga teknolohiya nga nagtugot sa mga tigdukiduki sa pag-imbestigar sa mga pattern sa ekspresyon sa gene sulod sa mga tisyu samtang gipreserbar ang ilang spatial nga konteksto.Usa ka kusgan nga plataporma sa kini nga domain mao ang 10x Genomics Visium inubanan sa pagsunud sa Illumina.Ang prinsipyo sa 10X Visium naa sa usa ka espesyal nga chip nga adunay gitudlo nga lugar nga makuha kung diin gibutang ang mga seksyon sa tisyu.Kini nga lugar sa pagkuha adunay mga barcoded spot, ang matag usa katumbas sa usa ka talagsaon nga spatial nga lokasyon sa sulod sa tisyu.Ang nakuha nga mga molekula sa RNA gikan sa tisyu dayon gimarkahan nga adunay talagsaon nga mga molekular nga identifier (UMI) sa panahon sa proseso sa reverse transcription.Kini nga mga barcoded spots ug UMIs makahimo sa tukma nga spatial mapping ug quantification sa gene expression sa usa ka single-cell nga resolusyon.Ang kombinasyon sa spatially barcoded samples ug UMIs nagsiguro sa katukma ug specificity sa datos nga namugna.Pinaagi sa paggamit niining Spatial Transcriptomics nga teknolohiya, ang mga tigdukiduki makaangkon og mas lawom nga pagsabot sa spatial nga organisasyon sa mga selula ug sa komplikadong mga interaksyon sa molekula nga nahitabo sulod sa mga tisyu, nga naghatag ug bililhong mga pagsabot sa mga mekanismo nga nagpahiping biological nga mga proseso sa daghang natad, lakip na ang oncology, neuroscience, developmental biology, immunology. , ug botanikal nga pagtuon.
Plataporma: 10X Genomics Visium ug Illumina NovaSeq
-
Full-Length mRNA Sequencing-Nanopore
Samtang ang pagsunud sa mRNA nga nakabase sa NGS nagsilbing usa ka daghang gamit nga himan alang sa pag-ihap sa ekspresyon sa gene, ang pagsalig niini sa mubu nga mga pagbasa nagpugong sa pagkaepektibo niini sa komplikado nga pag-analisar sa transcriptomic.Ang nanopore sequencing, sa laing bahin, naggamit sa dugay nga pagbasa nga teknolohiya, nga makapahimo sa pagkasunod-sunod sa bug-os nga gitas-on nga mRNA transcript.Kini nga pamaagi nagpadali sa usa ka komprehensibo nga eksplorasyon sa alternatibong splicing, gene fusions, poly-adenylation, ug ang quantification sa mRNA isoforms.
Ang pagsunud sa nanopore nagsalig sa nanopore nga usa ka molekula nga real-time nga mga signal sa kuryente.Gigiyahan sa mga protina sa motor, ang double-stranded nga DNA mogapos sa nanopore nga mga protina nga nasulod sa usa ka biofilm, nga mopahuway samtang kini moagi sa nanopore channel ubos sa kalainan sa boltahe.Ang lahi nga electrical signal nga namugna sa lain-laing mga base sa DNA strand namatikdan ug giklasipikar sa tinuod nga panahon, nga nagpadali sa tukma ug padayon nga nucleotide sequencing.Kini nga bag-ong pamaagi nakabuntog sa mubo nga pagbasa nga mga limitasyon ug naghatag usa ka dinamikong plataporma alang sa makuti nga pagtuki sa genomic, naglakip sa komplikado nga mga pagtuon sa transcriptomic.
Plataporma: Nanopore Promethion P48
-
Full-length mRNA sequencing -PacBio
Samtang ang pagsunud sa mRNA nga nakabase sa NGS usa ka daghang gamit nga himan alang sa pag-ihap sa ekspresyon sa gene, ang pagsalig niini sa mubu nga mga pagbasa nagpugong sa paggamit niini sa komplikado nga pag-analisar sa transcriptomic.Ang PacBio sequencing (Iso-Seq), sa laing bahin, naggamit sa dugay nga pagbasa nga teknolohiya, nga makapahimo sa pagkasunod-sunod sa mga full-length nga mRNA transcript.Kini nga pamaagi nagpadali sa usa ka komprehensibo nga pagsuhid sa alternatibong splicing, gene fusions ug poly-adenylation bisan kung dili kini ang panguna nga kapilian alang sa pag-quantification sa ekspresyon sa gene, tungod sa taas nga kantidad sa datos nga gikinahanglan.
Ang teknolohiya sa pagsunud sa PacBio nagsalig sa usa ka molekula, tinuod nga oras (SMRT) nga pagkasunud, nga naghatag usa ka lahi nga bentaha sa pagkuha sa tibuuk nga mga transkrip sa mRNA.Kini nga bag-ong pamaagi naglakip sa paggamit sa zero-mode waveguides (ZMWs), microfabricated atabay nga makahimo sa tinuod nga-time nga obserbasyon sa DNA polymerase nga kalihokan sa panahon sa sequencing.Sulod niini nga mga ZMW, ang DNA polymerase sa PacBio nag-synthesize sa usa ka komplementaryong strand sa DNA, nga nagmugna og taas nga mga pagbasa nga naglangkob sa kinatibuk-an nga mga transcript sa mRNA.Ang operasyon sa PacBio sa Circular Consensus sequencing (CCS) mode nagpauswag sa katukma pinaagi sa balik-balik nga pagsunud sa parehas nga molekula.Ang namugna nga HiFi reads adunay tukma nga ikatandi sa NGS, dugang nga nakatampo sa usa ka komprehensibo ug kasaligan nga pagtuki sa komplikadong transcriptomic nga mga bahin.Plataporma: PacBio Sequel II
-
Eukaryotic mRNA Sequencing-Illumina
Ang pagsunud sa mRNA naghatag gahum sa komprehensibo nga profiling sa tanan nga mga transcript sa mRNA sa sulod sa mga selyula sa ilawom sa piho nga mga kondisyon.Kining pinakabag-o nga teknolohiya nagsilbi nga usa ka kusgan nga himan, nagpadayag sa makuti nga mga profile sa ekspresyon sa gene, mga istruktura sa gene, ug mga mekanismo sa molekula nga may kalabutan sa lainlaing mga proseso sa biolohikal.Kaylap nga gisagop sa pundamental nga panukiduki, clinical diagnostics, ug drug development, ang mRNA sequencing nagtanyag og mga pagsabot sa mga intricacies sa cellular dynamics ug genetic regulation.
Plataporma: Illumina NovaSeq X
-
Non-Reference based mRNA Sequencing-Illumina
Ang pagsunud sa mRNA naghatag gahum sa komprehensibo nga profiling sa tanan nga mga transcript sa mRNA sa sulod sa mga selyula sa ilawom sa piho nga mga kondisyon.Kining pinakabag-o nga teknolohiya nagsilbi nga usa ka kusgan nga himan, nagpadayag sa makuti nga mga profile sa ekspresyon sa gene, mga istruktura sa gene, ug mga mekanismo sa molekula nga may kalabutan sa lainlaing mga proseso sa biolohikal.Kaylap nga gisagop sa pundamental nga panukiduki, clinical diagnostics, ug drug development, ang mRNA sequencing nagtanyag og mga pagsabot sa mga intricacies sa cellular dynamics ug genetic regulation.
Plataporma: Illumina NovaSeq X
-
Taas nga non-coding sequencing-Illumina
Ang mga long non-coding RNAs (lncRNAs) mao ang mga RNA nga mas taas pa sa 200 ka nucleotides nga adunay gamay nga potensyal sa pag-coding ug mga importanteng elemento sulod sa non-coding nga RNA.Makit-an sa nucleus ug cytoplasm, kini nga mga RNA adunay hinungdanon nga papel sa epigenetic, transcriptional, ug post-transcriptional nga regulasyon, nga nagpasiugda sa ilang kamahinungdanon sa pagporma sa mga proseso sa cellular ug molekular.Ang LncRNA sequencing usa ka gamhanan nga himan sa Cell differentiation, Ontogenesis, ug Human nga mga sakit.
Plataporma: Illumina NovaSeq
-
Gamay nga RNA sequencing-Illumina
Ang gagmay nga mga molekula sa RNA (sRNA), kasagaran ubos sa 200 ka nucleotides ang gitas-on, naglakip sa microRNAs (miRNAs), gagmay nga interfering RNAs (siRNAs), ug piwi-interacting RNAs (piRNAs).Taliwala niini, ang mga miRNA, mga 20-24 ang gitas-on sa mga nucleotide, labi nga hinungdanon alang sa ilang hinungdanon nga mga papel sa regulasyon sa lainlaing mga proseso sa cellular.Uban sa piho nga tisyu ug piho nga yugto sa ekspresyon nga mga pattern, ang mga miRNA nagpakita sa taas nga konserbasyon sa lainlaing mga espisye.
Plataporma: Illumina NovaSeq
-
circRNA sequencing-Illumina
Ang circular RNA sequencing (circRNA-seq) mao ang pag-profile ug pag-analisa sa mga circular RNA, usa ka klase sa mga molekula sa RNA nga nagporma og closed loops tungod sa non-canonical splicing nga mga panghitabo, nga naghatag niini nga RNA og dugang nga kalig-on.Samtang ang pipila ka mga circRNAs gipakita nga molihok isip mga microRNA nga espongha, nag-sequest sa mga microRNA ug nagpugong kanila sa pag-regulate sa ilang mga target nga mRNA, ang ubang mga circRNAs mahimong makig-uban sa mga protina, modulate sa gene expression, o adunay mga papel sa mga proseso sa cellular.Ang pag-analisa sa ekspresyon sa circRNA naghatag mga panan-aw sa mga papel sa regulasyon sa kini nga mga molekula ug ang ilang kamahinungdanon sa lainlaing mga proseso sa cellular, yugto sa pag-uswag, ug mga kondisyon sa sakit, nga nakatampo sa usa ka mas lawom nga pagsabut sa pagkakomplikado sa regulasyon sa RNA sa konteksto sa ekspresyon sa gene.
-
Tibuok nga transcriptome sequencing - Illumina
Ang tibuuk nga pagsunud sa transcriptome nagtanyag usa ka komprehensibo nga pamaagi sa pag-profile sa lainlaing mga molekula sa RNA, nga naglangkob sa parehong coding (mRNA) ug non-coding RNAs (lncRNA, circRNA, ug miRNA).Gikuha sa kini nga teknik ang tibuuk nga transcriptome sa piho nga mga selula sa usa ka gihatag nga higayon, nga nagtugot alang sa usa ka holistic nga pagsabut sa mga proseso sa cellular.Nailhan usab nga "total RNA sequencing," kini nagtumong sa pag-unveil sa makuti nga mga regulatory network sa transcriptome level, nga makapahimo sa lawom nga pag-analisar sama sa kompetisyon nga endogenous RNA (ceRNA) ug joint RNA analysis.Kini nagtimaan sa inisyal nga lakang padulong sa functional characterization, labi na sa pag-unrave sa mga regulatory network nga naglambigit sa circRNA-miRNA-mRNA-based ceRNA interactions.
-
Prokaryotic mRNA sequencing
Ang pagsunud sa mRNA naghatag gahum sa komprehensibo nga profiling sa tanan nga mga transcript sa mRNA sa sulod sa mga selyula sa ilawom sa piho nga mga kondisyon.Kining pinakabag-o nga teknolohiya nagsilbi nga usa ka kusgan nga himan, nagpadayag sa makuti nga mga profile sa ekspresyon sa gene, mga istruktura sa gene, ug mga mekanismo sa molekula nga may kalabutan sa lainlaing mga proseso sa biolohikal.Kaylap nga gisagop sa pundamental nga panukiduki, clinical diagnostics, ug drug development, ang mRNA sequencing nagtanyag og mga pagsabot sa mga intricacies sa cellular dynamics ug genetic regulation.Ang among prokaryotic mRNA sample nga pagproseso gipahaom alang sa prokaryotic transcriptomes, nga naglambigit sa rRNA depletion ug directional library preparation.
Plataporma: Illumina NovaSeq X
