●Ang pag-inusara ug pagpananom nga libre alang sa microbial community profiling: Pag-andam sa pagkasunud sa genetic nga materyal gikan sa mga dili tino nga mga organismo.
●Taas nga resolusyon: Namatikdan ang mga espisye sa ubos nga kadagaya sa mga sample sa kalikopan.
●Ang komprehensibo nga pag-analisar sa Bioinformatics:Nakatuon dili lamang sa lainlain nga buhis sa taxonomic apan usab sa functional nga pagkalainlain sa komunidad.
●Daghang Kasinatian:Uban sa usa ka track record sa malampuson nga pagsira sa daghang mga proyekto sa metagenomics sa lainlaing mga domain sa panukiduki ug pagproseso sa kapin sa 200 ka mga sample, ang among koponan nagdala usa ka bahandi sa matag proyekto.
SEQUEENCECT Platform | SEQUENCING SCHATEGY | Girekomenda ang datos | Kinaandan nga Kontrol |
Illlarina Novasq o DNBSEQ-T7 | PE150 | 6-20GB | Q30085% |
Konsentrasyon (NG / μl) | Total nga kantidad (ng) | Tomo (μL) |
≥1 | ≥30 | ≥50 |
● Yuta / Sludge: 2-3g
● Sulud sa sulud sa sulud sa sulud: 0.5-2g
● Mga sulud sa tinai - Insekto: 0.1-0.25g
● Ang sulud sa tanum (gipauswag nga sediment): 0.5-1G
● Ang sabaw sa fermentation nagpauswag sa sediment): 0.2-0.5g
● Faeces (Daghang mga hayop): 0.5-2g
● Faeces (mouse): 3-5GIINS
● Putusary Alveolar Lavage Fluid: Filter Paper
● Vaginal swab: 5-6 swab
● Skin / genital swab / laway / oral humok nga tisyu / Pharyngeal Swab / Rectal Swab: 2-3 Swabs
● Ibutang ang microorganism: 5-6 swab
● Water-ondody / Air / Biofilm: Filter Paper
● Mga endophytes: 2-3g
● Dental plque: 0.5-1G
Naglakip sa mosunod nga pag-analisar:
● Pag-ila sa Data nga Kontrol sa Kinaiyahan
● Minidenome Assembly ug Prediksyon sa Gen
● Annotation Geneotation
● Balitonomicic nga pag-analisar sa Alpha sa Alphaic
● Pag-analisar sa Functional sa Komunidad: Biological Function, Metabolic, Anibibiotiko nga Pagsukol
● Pag-analisar sa parehong functional ug taxonomic nagkalainlain:
Ang pag-analisar sa Beta Diversity
Pagtuki sa inter-group
Pag-analisar sa Correlation: tali sa mga hinungdan sa kalikopan ug pag-composit ug pagkalainlain
Pag-analisar sa Functional: Supakan sa kard nga Antibiotic
Pagkalainlain nga pag-analisar sa mga metaboliko nga metaboliko nga metaboliko: Heatmap sa mga mahinungdanong mga agianan
Ang Diversity sa Alpha sa Pagbalhin sa Taxonomic: Ace Index
Beta Diversity sa Pagbalhin sa Taxonomic: PCOA
Susihon ang mga kauswagan nga gipadali sa mga serbisyo sa metagenome sa BMKGENE SEQUENCE nga adunay Illadina pinaagi sa usa ka curate nga koleksyon sa mga publikasyon.
Hai, Q. et al. .Mga Fronties sa Microbiology, 14, p. 1275649. DOI: 10.3389 / FMICM.2023.1275649.
Mao, C. et al. .Pag-uswag sa Journal sa mga Makadaot nga mga Materyal, 9, p. 100233. DOI: 10.1016 / J.HAZADV.2023.100233.
Su, m. at al. .Mga Fronties sa Microbiology, 13, p. 851567. DOI: 10.3389 / FMICMB.2022.851567.
Yin, j. et al. .Ang kabag-ohan, 4 (5), p. 100486. DOI: 10.1016 / J.XINN.2023.100486.
Zhao, X. et al. .Science sa kinatibuk-ang palibot, 887, p. 164026. DOI: 10.1016 / J.SCITOTNENV.2023.164026.