lncrna

Ang mga long non-coding RNAs (lncRNA) mao ang mga RNA nga mas taas pa sa 200 ka nucleotides nga adunay ubos nga potensyal sa coding apan adunay kritikal nga mga gimbuhaton sa regulasyon. Ang BMKCloud lncRNA pipeline gidesinyo sa pag-analisar sa rRNA depleted nga mga librarya nga adunay taas nga kalidad, maayo nga annotated nga reference genome, pinaagi sa pag-analisar sa lncRNA ug mRNA nga ekspresyon nga magkauban. Pagkahuman sa pagbasa sa pagpamutol ug pagkontrol sa kalidad, ang mga pagbasa gipahiangay sa reference genome aron mag-assemble sa mga transcript, ug ang sunod nga pag-analisar sa istruktura sa gene nagpadayag sa alternatibong splicing ug nobela nga mga gene. Ang mga transcript giila nga mRNAs o lncRNAs, ug ang differential expression analysis nagpaila sa differentially expressed lncRNAs, ang ilang mga target ug differentially expressed genes (DEGS). Parehong mga DEG ug lahi nga gipahayag nga mga target sa lncRNA kay functionally annotated aron makit-an ang mga enriched functional nga mga kategorya.