-
Pagtuki sa Genome-wide Association
Ang Genome-wide association study (GWAS) nagtumong sa pag-ila sa mga variant sa genetic (genotype) nga may kalabutan sa piho nga mga kinaiya (phenotype).Gisusi sa pagtuon sa GWAS ang mga genetic marker nga nagtabok sa tibuuk nga genome sa daghang mga indibidwal ug nagtagna sa mga asosasyon sa genotype-phenotype pinaagi sa pagtuki sa istatistika sa lebel sa populasyon.Kini kaylap nga gigamit sa panukiduki bahin sa mga sakit sa tawo ug functional nga pagmina sa gene sa mga komplikadong kinaiya sa mga mananap o tanom.
-
Single-nucleus RNA Sequencing
Ang pag-uswag sa usa ka cell capturing ug indibidwal nga teknik sa pagtukod sa librarya nga naghiusa sa high-throughput sequencing nagtugot sa mga pagtuon sa ekspresyon sa gene sa cell-by-cell nga basehan.Gitugotan niini ang usa ka mas lawom ug kompleto nga pagtuki sa sistema sa mga komplikado nga populasyon sa cell, diin labi nga gilikayan niini ang pagtago sa ilang heterogeneity pinaagi sa pagkuha sa kasagaran sa tanan nga mga selula.
Bisan pa, ang pipila ka mga selyula dili angay nga himuon nga usa ka cell suspension, mao nga ang uban nga mga pamaagi sa pag-andam sa sample - ang pagkuha sa nucleus gikan sa mga tisyu gikinahanglan, nga mao, ang nucleus direkta nga gikuha gikan sa mga tisyu o cell ug giandam sa usa ka-nucleus nga suspensyon alang sa usa ka- pagkasunodsunod sa selula.
Naghatag ang BMK og 10× Genomics ChromiumTM base sa single-cell RNA sequencing service.Kini nga serbisyo kaylap nga gigamit sa mga pagtuon sa mga pagtuon nga may kalabotan sa sakit, sama sa pagkalainlain sa immune cell, heterogeneity sa tumor, pag-uswag sa tisyu, ug uban pa.
Spatial transcriptome chip: 10 × Genomics
Plataporma: Illumina NovaSeq 6000
-
Tanum/Animal Tibuok Genome Sequencing
Ang tibuok genome re-sequencing, nailhan usab nga WGS, makahimo sa pagpadayag sa komon ug talagsaon nga mutasyon sa tibuok genome lakip na ang Single Nucleotide Polymorphism (SNP), Insertion Deletion (InDel), Structure variation (SV), ug Copy Number Variation (CNV). ).Ang mga SV naglangkob sa mas dako nga bahin sa variation base kay sa mga SNP ug adunay mas dako nga epekto sa genome, nga adunay dakong epekto sa buhi nga mga organismo.Ang dugay nga pagbasa nga resequencing nagtugot alang sa mas tukma nga pag-ila sa dagkong mga tipik ug komplikado nga mga kalainan tungod kay ang taas nga pagbasa naghimo nga mas sayon sa pagtabok sa chromosomal sa mga komplikadong rehiyon sama sa tandem repeats, GC/AT-rich nga mga rehiyon, ug hyper-variable nga mga rehiyon.
Plataporma: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome
Ang spatial nga organisasyon sa mga selula adunay importante nga papel sa nagkalain-laing biological nga proseso, sama sa immune infiltration, embryo development, ug uban pa.Uban sa pag-uswag sa teknolohiya, ang ultra-clear nga tissue morphology ug ang tinuod nga structural nga kalainan sa spatial molecular expression kinahanglan nga tun-an nga adunay mas taas nga resolusyon.Ang BMKGENE naghatag og komprehensibo, one-stop nga spatial transcriptome sequencing nga serbisyo gikan sa mga sample ngadto sa biolohikal nga mga insight.
Ang mga teknolohiya sa spatial transcriptomics naghatag gahum sa mga panan-aw sa nobela sa lainlaing arena sa panukiduki pinaagi sa pagsulbad sa profile sa ekspresyon sa gene nga adunay sulud nga spatial sa mga heterogenous nga sample.
Spatial transcriptome chip: BMKMANU S1000
Plataporma: Illumina NovaSeq 6000
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Ang Visium Spatial Gene Expression usa ka mainstream nga spatial transcriptome sequencing nga teknolohiya alang sa pagklasipikar sa tisyu base sa kinatibuk-ang mRNA.Mapa ang tibuuk nga transcriptome nga adunay konteksto sa morphological aron mahibal-an ang mga nobela nga panan-aw sa normal nga pag-uswag, patolohiya sa sakit, ug panukiduki sa paghubad sa klinika.Ang BMKGENE naghatag og komprehensibo, one-stop nga spatial transcriptome sequencing nga serbisyo gikan sa mga sample ngadto sa biolohikal nga mga insight.
Ang mga teknolohiya sa spatial transcriptomics naghatag gahum sa mga nobela nga panan-aw sa lainlain nga arena sa panukiduki pinaagi sa pagsulbad sa profile sa ekspresyon sa gene nga adunay sulud nga spatial sa mga heterogenous nga sample.
Spatial transcriptome chip: 10x Genomics Visium
Plataporma:Illumina NovaSeq 6000
-
Full-Length mRNA Sequencing-Nanopore
Ang pagsunud sa RNA usa ka hinungdanon nga himan alang sa komprehensibo nga pagtuki sa transcriptome.Sa walay duhaduha, ang tradisyonal nga mubo nga pagbasa nga pagkasunodsunod nakab-ot ang daghang hinungdanon nga pag-uswag dinhi.Bisan pa niana, kini kasagarang makasugat og mga limitasyon sa bug-os nga gitas-on nga isoform identifications, quantification, PCR bias.
Ang pagsunud sa Nanopore nagpalahi sa kaugalingon gikan sa ubang mga platform sa pagsunud, tungod kay ang mga nucleotide direkta nga gibasa nga wala’y synthesis sa DNA ug nagpatunghag taas nga pagbasa sa napulo ka kilobases.Kini naghatag gahum sa direkta nga pagbasa sa pagtabok sa tibuuk nga mga transcript ug pag-atubang sa mga hagit sa mga pagtuon sa lebel sa isoform.
Plataporma:Nanopore PromethION
Library:cDNA-PCR
-
Full-length mRNA sequencing -PacBio
De novofull-length transcriptome sequencing, nailhan usab ngaDe novoGikuha sa Iso-Seq ang mga bentaha sa PacBio sequencer sa gitas-on sa pagbasa, nga makapahimo sa pagsunud sa tibuuk nga mga molekula sa cDNA nga wala’y bisan unsang mga pahulay.Kini hingpit nga naglikay sa bisan unsang mga sayup nga nahimo sa transcript assembly nga mga lakang ug nagtukod og mga unigene set nga adunay resolusyon nga lebel sa isoform.Kini nga unigene sets naghatag kusog nga genetic nga impormasyon isip "reference genome" sa transcriptome-level.Dugang pa, ang paghiusa sa sunod nga henerasyon nga sequencing data, kini nga serbisyo naghatag gahum sa usa ka tukma nga pag-ihap sa isoform-level nga ekspresyon.
Plataporma: PacBio Sequel IILibrary: SMRT bell library -
Eukaryotic mRNA Sequencing-Illumina
Ang pagsunud sa mRNA makahimo sa pag-profile sa tanan nga mga mRNA nga na-transcript gikan sa mga selyula sa ilawom sa piho nga mga kondisyon.Kini usa ka gamhanan nga teknolohiya alang sa pagpadayag sa profile sa ekspresyon sa gene, mga istruktura sa gene ug mga mekanismo sa molekula sa pipila ka biolohikal nga proseso.Hangtod karon, ang pagsunud-sunod sa mRNA kaylap nga gigamit sa sukaranan nga panukiduki, mga diagnostic sa klinika, pag-uswag sa tambal, ug uban pa.
Plataporma: Illumina NovaSeq 6000
-
Non-Reference based mRNA Sequencing-Illumina
Ang pagsunud sa mRNA nagsagop sa sunod nga henerasyon nga teknik sa pagsunud (NGS) aron makuha ang messenger nga RNA (mRNA) nga porma sa Eukaryote sa piho nga panahon nga gipalihok ang pipila nga mga espesyal nga gimbuhaton.Ang pinakataas nga transcript spliced gitawag nga 'Unigene' ug gigamit isip reference sequence para sa sunod nga pagtuki, nga usa ka epektibong paagi sa pagtuon sa molekular nga mekanismo ug regulatory network sa species nga walay reference.
Pagkahuman sa transcriptome data assembly ug unigene functional annotation
(1)SSR analysis, CDS prediction ug gene structure maporma na.
(2) Pag-ihap sa unigene nga ekspresyon sa matag sample ipahigayon.
(3) Ang lahi nga gipahayag nga mga unigenes tali sa mga sample (o mga grupo) madiskobrehan base sa unigene nga ekspresyon
(4) Pag-clustering, functional annotation ug enrichment analysis sa differentially expressed unigenes ipahigayon
-
Taas nga non-coding sequencing-Illumina
Ang mga long non-coding RNAs (lncRNAs) maoy usa ka matang sa mga molekula sa RNA nga adunay gitas-on nga labaw sa 200 nt, nga gihulagway pinaagi sa hilabihan ka ubos nga potensyal sa coding.Ang LncRNA, isip usa ka importanteng miyembro sa non-coding RNAs, kasagarang makita sa nucleus ug plasma.Ang pag-uswag sa teknolohiya sa pagsunud-sunod ug bioinformtics makahimo sa pag-ila sa daghang mga bag-ong lncRNAs ug pag-asoy sa mga adunay biolohikal nga gimbuhaton.Ang mga accumulative nga ebidensya nagsugyot nga ang lncRNA kaylap nga nalambigit sa epigenetic regulation, transcription regulation ug post-transcription regulation.
