मेटागेनोमिक्स (एनजीएस)

इल्लुमिना के साथ शॉटगन मेटागेनोमिक्स जटिल नमूनों से डीएनए को सीधे अनुक्रमित करके माइक्रोबायोम का अध्ययन करने के लिए एक लोकप्रिय उपकरण है, जो टैक्सोनोमिक और कार्यात्मक विविधता दोनों के अध्ययन को सक्षम बनाता है। बीएमकेक्लाउड मेटागेनोमिक (एनजीएस) पाइपलाइन गुणवत्ता नियंत्रण और मेटाजेनोम असेंबली से शुरू होती है, जहां से जीन की भविष्यवाणी की जाती है और गैर-अनावश्यक डेटासेट में क्लस्टर किया जाता है जिन्हें कई डेटाबेस का उपयोग करके फ़ंक्शन और वर्गीकरण के लिए एनोटेट किया जाता है। इस जानकारी का उपयोग नमूना वर्गीकरण विविधता (अल्फा विविधता) और नमूना विविधता (बीटा विविधता) के बीच विश्लेषण करने के लिए किया जाता है। समूहों के बीच विभेदक विश्लेषण ओटीयू और जैविक कार्यों का पता लगाता है जो पैरामीट्रिक और गैर-पैरामीट्रिक दोनों परीक्षणों का उपयोग करके दो समूहों के बीच भिन्न होते हैं, जबकि सहसंबंध विश्लेषण इन अंतरों को पर्यावरणीय कारकों से जोड़ता है।