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*यहां दिखाए गए सभी डेमो परिणाम बायोमार्कर टेक्नोलॉजीज के साथ प्रकाशित जीनोम से हैं

1.एलटीआर सम्मिलन समय अनुमान: चित्र में अन्य प्रजातियों की तुलना में वेनिंग राई जीनोम में एलटीआर-आरटी सम्मिलन समय में एक अद्वितीय द्विमोडल वितरण दिखाया गया है।सबसे हालिया शिखर लगभग 0.5 मिलियन वर्ष पहले दिखाई दिया था।

ली गुआंग एट अल.,प्रकृति आनुवंशिकी, 2021

2. चायोट (सेचियम एडुले) पर फ़ाइलोजेनी और जीन परिवार का विश्लेषण: चायोट और जीन परिवार में अन्य 13 संबंधित प्रजातियों का विश्लेषण करके, चायोट को स्नेक गार्ड (ट्राइकोसैंथेस एंगुइना) से सबसे अधिक निकटता से संबंधित पाया गया।लगभग 27-45 Mya में सर्पगंधा से प्राप्त चायोट और 25±4 Mya में चायोट में संपूर्ण जीनोम दोहराव (WGD) देखा गया, जो कुकुइबिटेसी में तीसरी WGD घटना है।

फू ए एट अल.,बागवानी अनुसंधान, 2021

3.सिंटेनी विश्लेषण: फलों के विकास में फाइटोहोर्मोन से संबंधित कुछ जीन चायोट, स्नेक लौकी और स्क्वैश में पाए गए।चायोट और स्क्वैश के बीच सहसंबंध चायोट और स्नेक लौकी की तुलना में थोड़ा अधिक है।

फू ए एट अल.,बागवानी अनुसंधान, 2021

4.जीन परिवार विश्लेषण: जी.थर्बरी और जी.डेविडसोनी जीनोम में जीन परिवार के विस्तार और संकुचन पर केईजीजी संवर्धन से पता चला कि स्टेरॉयड बायोसिंथेसिस और ब्रैसिनोस्टेरॉइड बायोसिंथेसिस से संबंधित जीन का विस्तार हुआ था।

यांग ज़ेड एट अल.,बीएमसी जीवविज्ञान, 2021

5.संपूर्ण जीनोम दोहराव विश्लेषण: 4DTV और Ks वितरण विश्लेषण ने संपूर्ण जीनोम दोहराव घटना को दिखाया।अंतःप्रजाति की चोटियों में दोहराव की घटनाएँ दिखाई गईं।अंतर-प्रजाति की चोटियों में प्रजाति-प्रजाति की घटनाओं को दर्शाया गया है।विश्लेषण से संकेत मिलता है कि अन्य तीन निकट संबंधी प्रजातियों की तुलना में, ओ. यूरोपिया हाल ही में बड़े पैमाने पर जीन दोहराव से गुजरा है।

राव जी एट अल.,बागवानी अनुसंधान, 2021

बीएमके मामला

कांटेदार बिना गुलाब: नमी अनुकूलन से जुड़ी जीनोमिक अंतर्दृष्टि

प्रकाशित: राष्ट्रीय विज्ञान समीक्षा, 2021

अनुक्रमण रणनीति:

'बसये'कॉटे से रहित' (आर।विचुरैनन) जीनोम:
लगभग।93 एक्स पैकबायो + लगभग।90 एक्स नैनोपोर + 267 एक्स इलुमिना

मुख्य परिणाम

1. उच्च गुणवत्ता वाले आर.विचुरियाना जीनोम का निर्माण लंबे समय से पढ़ी जाने वाली अनुक्रमण तकनीकों का उपयोग करके किया गया था, जिससे 530.07 एमबी की असेंबली प्राप्त हुई (अनुमानित जीनोम का आकार फ्लो साइटोमेट्री द्वारा लगभग 525.9 एमबी और जीनोम सर्वेक्षण द्वारा 525.5 था; हेटेरोज़ीगोसिटी लगभग 1.03% थी)।BUSCO का अनुमानित स्कोर 93.9% था।"ओल्ड ब्लश" (हैप्लोओबी) के साथ तुलना करने पर, इस जीनोम की गुणवत्ता और पूर्णता की पुष्टि बेस सिंगल-बेस सटीकता और एलटीआर असेंबली इंडेक्स (एलएआई = 20.03) द्वारा की गई थी।आर.विचुराइआना जीनोम में 32,674 प्रोटीन कोडिंग जीन होते हैं।

2. मल्टी-ओमिक्स संयुक्त विश्लेषण, जिसमें तुलनात्मक जीनोमिक्स, ट्रांसक्रिपटॉमिक्स, आनुवंशिक आबादी का क्यूटीएल विश्लेषण शामिल है, ने आर. विचुरियाना और रोजा चिनेंसिस के बीच महत्वपूर्ण प्रजाति का खुलासा किया।इसके अलावा, क्यूटीएल में संबंधित जीन की अभिव्यक्ति भिन्नता स्टेम प्रिकल पैटर्निंग से जुड़ी होने की संभावना थी।

सिन्टेनी विश्लेषण, जीन परिवार क्लस्टर, विस्तार और संकुचन विश्लेषण सहित बस्सी थॉर्नलेस और रोजा चिनेंसिस के बीच तुलनात्मक जीनोमिक्स विश्लेषण से बड़ी संख्या में विविधताएं सामने आईं, जो गुलाब में महत्वपूर्ण लक्षणों से संबंधित थीं।एनएसी और एफएआर1/एफआरएस जीन परिवार में अद्वितीय विस्तार ब्लैक स्पॉट के प्रतिरोध से जुड़ा होने की बहुत संभावना थी।

झोंग, एम., एट अल."कांटों के बिना गुलाब: नमी अनुकूलन से जुड़ी जीनोमिक अंतर्दृष्टि"राष्ट्रीय विज्ञान समीक्षा, 2021;, nwab092।