संदर्भ जीनोम के साथ mRNA-seq (NGS)
RNA-seq जीव विज्ञान और फसल विज्ञान में एक मानक उपकरण है, जो जीनोम और प्रोटीओम के बीच की खाई को पाटता है। इसकी ताकत नए ट्रांसक्रिप्ट की खोज करने और एक ही परीक्षण में उनकी अभिव्यक्ति को मापने में निहित है। इसका व्यापक रूप से तुलनात्मक ट्रांसक्रिप्टोमिक अध्ययनों में उपयोग किया जाता है, जो विभिन्न लक्षणों या फेनोटाइप से संबंधित जीनों पर प्रकाश डालता है, जैसे कि उत्परिवर्ती की तुलना जंगली प्रकारों से करना या विशिष्ट परिस्थितियों में जीन अभिव्यक्ति को प्रकट करना। BMKCloud mRNA(Reference) APP अभिव्यक्ति मात्रा निर्धारण, विभेदक अभिव्यक्ति विश्लेषण (DEG) और अनुक्रम संरचना विश्लेषण को mRNA-seq(NGS) जैवसूचना विज्ञान पाइपलाइन में एकीकृत करता है और समान सॉफ़्टवेयर की खूबियों को मिलाकर सुविधा और उपयोगकर्ता-मित्रता सुनिश्चित करता है। उपयोगकर्ता अपने RNA-seq डेटा को क्लाउड पर अपलोड कर सकते हैं, जहाँ ऐप एक व्यापक, वन-स्टॉप जैवसूचना विज्ञान विश्लेषण समाधान प्रदान करता है। इसके अतिरिक्त, यह ग्राहक अनुभव को प्राथमिकता देता है, उपयोगकर्ताओं की विशिष्ट आवश्यकताओं के अनुरूप वैयक्तिकृत संचालन प्रदान करता है। उपयोगकर्ता स्वयं पैरामीटर सेट कर सकते हैं और पाइपलाइन मिशन सबमिट कर सकते हैं, इंटरैक्टिव रिपोर्ट की जांच कर सकते हैं, डेटा/आरेख देख सकते हैं और डेटा माइनिंग को पूरा कर सकते हैं, जैसे: लक्षित जीन चयन, कार्यात्मक क्लस्टरिंग, आरेखण आदि।
प्लैटफ़ॉर्म:इलुमिना, एमजीआई
रणनीति:शाही सेना Seq
लेआउट: संक्षिप्त, स्वच्छ डेटा।
पुस्तकालय का प्रकार:fr-unstranded, fr-firststrand या fr-secondstrand
पढ़ने की अवधि:150 बीपी
फ़ाइल प्रकार:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz या *.fq.gz। सिस्टम.fastq फ़ाइलों को उनके फ़ाइल नामों के अनुसार स्वचालित रूप से युग्मित करें।उदाहरण के लिए *_1.fastq को *._2.fastq के साथ जोड़ा गया है।
नमूनों की संख्या:संख्या पर कोई प्रतिबंध नहीं हैनमूनों की संख्या बढ़ने पर विश्लेषण का समय भी बढ़ जाएगा।नमूने बढ़ते हैं।
अनुशंसित डेटा मात्रा:6 ग्राम प्रति नमूना
