● एक संदर्भ जीनोम की आवश्यकता है।
● लैम्ब्डा डीएनए का उपयोग बाइसल्फाइट रूपांतरण दक्षता की निगरानी के लिए किया जाता है।
● एमएसपीआई पाचन दक्षता की भी निगरानी की जाती है।
● पौधों के नमूनों के लिए दोहरा एंजाइम पाचन।
● इलुमिना नोवासेक पर अनुक्रमण।
●WGBS का लागत प्रभावी और कुशल विकल्प: कम लागत पर और कम नमूना आवश्यकताओं के साथ विश्लेषण को सक्षम बनाना।
●पूरा प्लेटफार्म:नमूना प्रसंस्करण, पुस्तकालय निर्माण और अनुक्रमण से लेकर जैव सूचना विज्ञान विश्लेषण तक वन-स्टॉप उत्कृष्ट सेवा प्रदान करें।
●व्यापक विशेषज्ञता: विभिन्न प्रकार की प्रजातियों में आरआरबीएस अनुक्रमण परियोजनाओं को सफलतापूर्वक पूरा करने के साथ, बीएमकेजीईएन एक दशक से अधिक का अनुभव, एक उच्च कुशल विश्लेषण टीम, व्यापक सामग्री और बिक्री के बाद उत्कृष्ट समर्थन लाता है।
पुस्तकालय | अनुक्रमण रणनीति | अनुशंसित डेटा आउटपुट | गुणवत्ता नियंत्रण |
एमएसपीआई पचा और बिसल्फाइट उपचारित पुस्तकालय | इलुमिना PE150 | 8 जीबी | Q30 ≥ 85% बिसल्फाइट रूपांतरण > 99% एमएसपीआई काटने की दक्षता > 95% |
एकाग्रता (एनजी/μL) | कुल मात्रा (µg) |
| |
जीनोमिक डीएनए | ≥ 30 | ≥ 1 | सीमित क्षरण या संदूषण |
निम्नलिखित विश्लेषण शामिल है:
● कच्चा अनुक्रमण गुणवत्ता नियंत्रण;
● संदर्भ जीनोम का मानचित्रण;
● 5mC मिथाइलेटेड बेस और मोटिफ की पहचान का पता लगाना;
● मिथाइलेशन वितरण और नमूना तुलना का विश्लेषण;
● विभेदित मिथाइलेटेड क्षेत्रों (डीएमआर) का विश्लेषण;
● डीएमआर से जुड़े जीनों का कार्यात्मक एनोटेशन।
गुणवत्ता नियंत्रण: पाचन दक्षता (जीनोम मैपिंग में)
गुणवत्ता नियंत्रण: बाइसल्फाइट रूपांतरण (मिथाइलेशन जानकारी निष्कर्षण में)
मिथाइलेशन मानचित्र: 5mC मिथाइलेशन जीनोम-व्यापक वितरण
नमूना तुलना: प्रमुख घटक विश्लेषण
विभेदक रूप से मिथाइलेटेड क्षेत्र (डीएमआर) विश्लेषण: हीटमैप
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ली, जेड एट अल. (2022) 'सीआरआईएसपीआर सक्रियण और पैराक्राइन कारकों द्वारा लेडिग-जैसी कोशिकाओं में उच्च-निष्ठा रिप्रोग्रामिंग',पीएनएएस नेक्सस, 1(4). doi: 10.1093/PNASNEXUS/PGAC179.
तियान, एच. एट अल. (2023) 'चीनी मोनोज़ायगोटिक जुड़वाँ में शरीर संरचना का जीनोम-वाइड डीएनए मिथाइलेशन विश्लेषण',क्लिनिकल जांच के यूरोपीय जर्नल, 53(11), पृ. e14055. डीओआई: 10.1111/ईसीआई.14055।
वू, वाई. एट अल. (2022) 'डीएनए मेथिलिकरण और कमर से कूल्हे का अनुपात: चीनी मोनोज़ायगोटिक जुड़वाँ में एक एपिजेनोम-वाइड एसोसिएशन अध्ययन',जर्नल ऑफ एंडोक्रिनोलॉजिकल इन्वेस्टिगेशन, 45(12), पृ. 2365-2376। डीओआई: 10.1007/एस40618-022-01878-4।