●प्लेटफ़ॉर्म:इलुमिना नोवासेक 6000 और नोवासेक एक्स प्लस
●अनुक्रमण मोड:पीई150 और पीई250
●अनुक्रमण से पहले पुस्तकालयों का गुणवत्ता नियंत्रण
●सीक्वेंसिंग डेटा की गुणवत्ता नियंत्रण और वितरण:Q30 रीड्स के डीमल्टीप्लेक्सिंग और फ़िल्टरिंग के बाद फास्टक्यू प्रारूप में QC रिपोर्ट और कच्चे डेटा की डिलीवरी।
●सीक्वेंसिंग सेवाओं की बहुमुखी प्रतिभा:ग्राहक लेन, फ्लो सेल या आवश्यक डेटा की मात्रा (आंशिक लेन अनुक्रमण) के आधार पर अनुक्रमण का विकल्प चुन सकता है।
●इलुमिना सीक्वेंसिंग प्लेटफॉर्म पर व्यापक अनुभव:विभिन्न प्रजातियों से संबंधित हजारों बंद परियोजनाओं के साथ।
●सीक्वेंसिंग क्यूसी रिपोर्ट की डिलीवरी:गुणवत्ता मानकों, डेटा सटीकता और अनुक्रमण परियोजना के समग्र प्रदर्शन के साथ।
●परिपक्व अनुक्रमण प्रक्रिया:कम समय में काम पूरा करना।
●कठोर गुणवत्ता नियंत्रणहम उच्च गुणवत्ता वाले परिणामों की निरंतर प्राप्ति सुनिश्चित करने के लिए सख्त गुणवत्ता नियंत्रण आवश्यकताओं को लागू करते हैं।
| प्लैटफ़ॉर्म | प्रवाह कोशिका | अनुक्रमण मोड | इकाई | अनुमानित उत्पादन |
| नोवासेक एक्स | 10बी (8 लेन) | पीई150 | एकल लेन आंशिक लेन | 375 जीबी / लेन |
| 25बी (8 लेन) | पीई150 | एकल लेन आंशिक लेन | 1000 जीबी/लेन | |
| नोवासेक 6000 | एसपी फ्लो सेल (2 लेन) | पीई250 | प्रवाह कोशिका एकल लेन आंशिक लेन | 325-400 एम रीड्स / लेन |
| एस4 फ्लो सेल (4 लेन) | पीई150 | प्रवाह कोशिका एकल लेन आंशिक लेन | लगभग 800 जीबी / लेन |
| डेटा की मात्रा (जीबी) | सांद्रता (qPCR) PE150 | सांद्रता (qPCR) PE250 | आयतन | |
| आंशिक लेन
| जी ≤ 10 | ≥ 1 एनएम | ≥ 2 एनएम | ≥ 25 μl |
| 10 < G ≤ 50 | ≥ 2 एनएम | ≥ 3 एनएम | ≥ 25 μl | |
| 50 < G ≤ 100 | ≥ 3 एनएम | ≥ 4 एनएम | ≥ 25 μl | |
| जी > 100 | ≥ 4 एनएम | ≥ 4 एनएम | ≥ 25 μl | |
| एकल लेन | प्रति लेन | ≥ 1.5 nM/लाइब्रेरी पूल | ≥ 2 nM/लाइब्रेरी पूल | ≥ 25 µL/लाइब्रेरी पूल |
सांद्रता और कुल मात्रा के अलावा, एक उपयुक्त शिखर पैटर्न भी आवश्यक है।
नोट: कम विविधता वाली लाइब्रेरी की लेन सीक्वेंसिंग के लिए मजबूत बेस कॉलिंग सुनिश्चित करने के लिए PhiX स्पाइक-इन की आवश्यकता होती है।
हम लेन सीक्वेंसिंग के लिए प्री-पूल्ड लाइब्रेरी को सैंपल के रूप में सबमिट करने की सलाह देते हैं। यदि आपको BMKGENE द्वारा लाइब्रेरी पूलिंग की आवश्यकता है, तो कृपया आंशिक लेन सीक्वेंसिंग के लिए लाइब्रेरी संबंधी आवश्यकताओं को देखें।
PE150 सीक्वेंसिंग के लिए, इंसर्ट का आकार 300-400 bp (एडेप्टर को छोड़कर) होना चाहिए; PE250 सीक्वेंसिंग के लिए, इंसर्ट का आकार 150-500 bp (एडेप्टर को छोड़कर) होना चाहिए।
लाइब्रेरी में एक ही मुख्य शिखर होना चाहिए, कोई एडेप्टर संदूषण नहीं होना चाहिए और कोई प्राइमर डाइमर नहीं होना चाहिए।
सीक्वेंसिंग से पहले लाइब्रेरी की गुणवत्ता पर एक रिपोर्ट प्रदान की जाती है, जिसमें लाइब्रेरी की मात्रा और विखंडन का आकलन किया जाता है।
तालिका 1. अनुक्रमण डेटा पर सांख्यिकी।
| नमूना आईडी | बीएमकिड | रॉ रीड्स | कच्चा डेटा (बीपी) | साफ़ पठन (%) | Q20(%) | Q30(%) | जीसी(%) |
| सी_01 | बीएमके_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| सी_02 | बीएमके_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
चित्र 1. प्रत्येक नमूने में रीड्स के साथ गुणवत्ता वितरण
चित्र 2. आधार सामग्री वितरण
चित्र 3. अनुक्रमण डेटा में रीड सामग्री का वितरण