-
बीएमकेएमएएनयू एस3000_स्पेशियल ट्रांसक्रिप्टोम
स्पेशियल ट्रांसक्रिप्टोमिक्स एक ऐसी तकनीक है जो हमें ऊतकों के भीतर जीन अभिव्यक्ति को कैप्चर और विज़ुअलाइज़ करने की अनुमति देती है। यह कोशिकाओं की परस्पर क्रिया को समझने के लिए महत्वपूर्ण हो सकता है।
इस तकनीक के लिए विभिन्न प्लेटफॉर्म उपलब्ध हैं। इस संदर्भ में, BMKGene ने BMKManu 3000 स्पेशल ट्रांसक्रिप्टोम चिप विकसित की है, जो तकनीक के प्रदर्शन को बेहतर बनाती है, उपकोशिकीय स्तर तक पहुंचती है और बहु-स्तरीय रिज़ॉल्यूशन सेटिंग को सक्षम बनाती है।
इस चिप में पेटेंट तकनीक का उपयोग करके 4.2 मिलियन स्पॉट समाहित किए गए हैं, जिसमें स्थानिक रूप से बारकोडित प्रोब से भरी हुई मोतियों की परतों वाले माइक्रोवेल शामिल हैं। इस विधि से, कैप्चर और एम्प्लीफिकेशन के बाद, हमें बारकोडित नमूनों से समृद्ध सीडीएनए लाइब्रेरी प्राप्त होती है जो इलुमिना के अनुकूल है।
डेटा के संदर्भ में, स्थानिक बारकोड और यूएमआई का संयोजन उत्पन्न डेटा की सटीकता और विशिष्टता सुनिश्चित करता है। उपरोक्त सभी को मिलाकर, बीएमकेमैनू एक अत्यंत बहुमुखी डेटा सेटिंग प्रदान करता है।
-
एकल-नाभिकीय आरएनए अनुक्रमण
सिंगल-सेल कैप्चर और कस्टम लाइब्रेरी निर्माण तकनीकों के विकास, साथ ही हाई-थ्रूपुट सीक्वेंसिंग ने कोशिका स्तर पर जीन अभिव्यक्ति के अध्ययन में क्रांतिकारी बदलाव ला दिया है। इस अभूतपूर्व प्रगति से जटिल कोशिका समूहों का गहन और व्यापक विश्लेषण संभव हो पाता है, जिससे सभी कोशिकाओं में जीन अभिव्यक्ति का औसत निकालने से जुड़ी सीमाएं दूर हो जाती हैं और इन समूहों के भीतर वास्तविक विविधता संरक्षित रहती है। हालांकि सिंगल-सेल आरएनए सीक्वेंसिंग (scRNA-seq) के निर्विवाद लाभ हैं, लेकिन कुछ ऊतकों में इसमें चुनौतियां आती हैं जहां सिंगल-सेल सस्पेंशन बनाना मुश्किल होता है और ताजे नमूनों की आवश्यकता होती है। BMKGene में, हम अत्याधुनिक 10X Genomics Chromium तकनीक का उपयोग करके सिंगल-न्यूक्लियस आरएनए सीक्वेंसिंग (snRNA-seq) की पेशकश करके इस बाधा का समाधान करते हैं। यह दृष्टिकोण सिंगल-सेल स्तर पर ट्रांसक्रिप्टोम विश्लेषण के लिए उपयुक्त नमूनों के स्पेक्ट्रम को व्यापक बनाता है।
नाभिकों का पृथक्करण 10X जीनोमिक्स क्रोमियम चिप की नवीन तकनीक के माध्यम से किया जाता है, जिसमें डबल क्रॉसिंग के साथ आठ-चैनल माइक्रोफ्लुइडिक्स प्रणाली मौजूद है। इस प्रणाली में, बारकोड, प्राइमर, एंजाइम और एक एकल नाभिक युक्त जेल बीड्स को नैनोलीटर आकार की तेल की बूंदों में समाहित किया जाता है, जिससे जेल बीड-इन-इमल्शन (GEM) बनता है। GEM बनने के बाद, प्रत्येक GEM के भीतर कोशिका का विघटन और बारकोड का विमोचन होता है। इसके बाद, mRNA अणु रिवर्स ट्रांसक्रिप्शन द्वारा cDNAs में परिवर्तित हो जाते हैं, जिनमें 10X बारकोड और विशिष्ट आणविक पहचानकर्ता (UMI) समाहित होते हैं। फिर इन cDNAs का मानक अनुक्रमण लाइब्रेरी निर्माण किया जाता है, जिससे एकल-कोशिका स्तर पर जीन अभिव्यक्ति प्रोफाइल का व्यापक और गहन अध्ययन संभव हो पाता है।
प्लेटफ़ॉर्म: 10× जीनोमिक्स क्रोमियम और इलुमिना नोवासेक प्लेटफ़ॉर्म
