संपूर्ण ट्रांसक्रिप्टोम अनुक्रमण – इलुमिना
विशेषताएँ
● संपूर्ण ट्रांसक्रिप्टोम को अनुक्रमित करने के लिए दोहरी लाइब्रेरी निर्माण: rRNA क्षीणन लाइब्रेरी और लघु RNA लाइब्रेरी की तैयारी।
● अलग-अलग बायोइन्फॉर्मेटिक रिपोर्टों में mRNA, lncRNA, circRNA और miRNA का संपूर्ण बायोइन्फॉर्मेटिक विश्लेषण, साथ ही सभी RNA अभिव्यक्ति का संयुक्त विश्लेषण, जिसमें ceRNA नेटवर्क विश्लेषण भी शामिल है।
सेवा के लाभ
●व्यापक विशेषज्ञताहमने विविध प्रकार के नमूनों पर आधारित 2100 से अधिक संपूर्ण ट्रांसक्रिप्टोम परियोजनाओं को संसाधित किया है। हम प्रत्येक परियोजना में अपनी विशेषज्ञता का भरपूर उपयोग करते हैं।
●कठोर गुणवत्ता नियंत्रणहम नमूना तैयार करने से लेकर लाइब्रेरी तैयार करने, अनुक्रमण और जैवसूचना विज्ञान तक, सभी चरणों में मुख्य नियंत्रण बिंदुओं को लागू करते हैं। हमारी सावधानीपूर्वक निगरानी से लगातार उच्च गुणवत्ता वाले परिणाम सुनिश्चित होते हैं।
●व्यापक व्याख्याहम विभेदक रूप से व्यक्त जीनों (DEGs) को कार्यात्मक रूप से एनोटेट करने और संबंधित संवर्धन विश्लेषण करने के लिए कई डेटाबेस का उपयोग करते हैं। यह व्यापक दृष्टिकोण ट्रांसक्रिप्टोम प्रतिक्रिया के अंतर्निहित कोशिकीय और आणविक प्रक्रियाओं की जानकारी प्रदान करता है, जिससे यह सुनिश्चित होता है कि आपको अपने प्रयोग के डेटा के बारे में सभी संभावित जानकारी प्राप्त हो।
●नियामक नेटवर्कों का गहन विश्लेषणceRNA नेटवर्क विश्लेषण mRNA, lncRNA, circRNA और miRNA के संयुक्त अनुक्रमण और एक व्यापक जैव सूचना विज्ञान कार्यप्रणाली द्वारा सक्षम किया गया है।
●बिक्री के बाद सहायताहम समझते हैं कि उपस्थित रहना कितना महत्वपूर्ण है, इसीलिए हमारी प्रतिबद्धता परियोजना पूर्ण होने के बाद भी 3 महीने की बिक्रीोत्तर सेवा अवधि तक विस्तारित है। इस दौरान, हम परियोजना का फॉलो-अप, समस्या निवारण सहायता और परिणामों से संबंधित किसी भी प्रश्न के समाधान के लिए प्रश्नोत्तर सत्र प्रदान करते हैं।
नमूना संबंधी आवश्यकताएँ और वितरण
| पुस्तकालय | अनुक्रमण रणनीति | डेटा की अनुशंसा की गई | गुणवत्ता नियंत्रण |
| rRNA की कमी | इलुमिना PE150 | 16 जीबी | Q30≥85% |
| चयनित आकार | इलुमिना SE50 | 10-20 मिलियन रीड्स |
नमूना आवश्यकताएँ:
न्यूक्लियोटाइड:
| सांद्रता (एनजी/एमएल) | मात्रा (मिग्रा) | पवित्रता | अखंडता |
| ≥ 80 | ≥ 1.6 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 जेल पर प्रोटीन या डीएनए की संदूषण की मात्रा बहुत कम या न के बराबर दिखाई दी। | आरआईएन≥6.0 5.0≥28S/18S≥1.0; सीमित या कोई आधारभूत उन्नयन नहीं |
अनुशंसित नमूना वितरण
कंटेनर: 2 मिलीलीटर सेंट्रीफ्यूज ट्यूब (टिन फॉयल का उपयोग करने की सलाह नहीं दी जाती है)
नमूना लेबलिंग: समूह + प्रतिकृति जैसे A1, A2, A3; B1, B2, B3।
शिपमेंट:
1. ड्राई आइस: नमूनों को बैग में पैक करके ड्राई आइस में दबा देना चाहिए।
2. आरएनएस्टेबल ट्यूब: आरएनए के नमूनों को आरएनए स्थिरीकरण ट्यूब (जैसे आरएनएस्टेबल®) में सुखाया जा सकता है और कमरे के तापमान पर भेजा जा सकता है।
सेवा कार्य प्रवाह
प्रयोग डिजाइन
नमूना वितरण
आरएनए निष्कर्षण
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
डेटा विश्लेषण
बिक्री पश्चात सेवाएं
बायोइनफॉरमैटिक्स
प्रत्येक अलग-अलग प्रकार के विश्लेषण के अलावा, आरएनए के 4 प्रकारों को हमारे संयुक्त विश्लेषण में शामिल किया गया है:
- सभी विभिन्न प्रकार के आरएनए डेटा के बीच सह-अभिव्यक्ति विश्लेषण
- आरएनए अभिव्यक्ति का अवलोकन
- विभेदक अभिव्यक्ति अवलोकन
- सीईआरएनए नेटवर्क
- मार्ग में एकीकृत प्रमुख जीन
- संरक्षण विश्लेषण
- संबंधों को लक्षित करना
आरएनए अभिव्यक्ति का अवलोकन
भिन्न रूप से व्यक्त जीन
ceRNA विश्लेषण
भिन्न रूप से व्यक्त होने वाले माइक्रोआरएनए और संबंधित आरएनए
बीएमकेजीन की संपूर्ण ट्रांसक्रिप्टोम अनुक्रमण सेवाओं द्वारा सुगम बनाए गए अनुसंधान संबंधी प्रगति का पता लगाने के लिए प्रकाशनों के एक सुनियोजित संग्रह का उपयोग करें।
दाई, वाई. एट अल. (2022) 'आरएनए अनुक्रमण द्वारा पहचाने गए काशिन-बेक रोग में एमआरएनए, एलएनसीआरएन और एमआईआरएन के व्यापक अभिव्यक्ति प्रोफाइल'आणविक ओमिक्स, 18(2), पृ. 154-166। doi: 10.1039/D1MO00370D.
लियू, एन. नान एट अल. (2022) 'शीतकालीन अवधि के दौरान चांगबाई पर्वत में एपिस सेराना की शीत-प्रतिरोधकता का पूर्ण लंबाई ट्रांसक्रिप्टोम विश्लेषण।'जीन, 830, पृ. 146503–146503. doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
वांग, एक्सजे एट अल. (2022) 'स्मॉल सेल लंग कैंसर में प्रतिस्पर्धी अंतर्जात आरएनए विनियमन नेटवर्क का मल्टी-ओमिक्स एकीकरण-आधारित प्राथमिकताकरण: आणविक विशेषताएँ और दवा उम्मीदवार',फ्रंटियर्स इन ऑन्कोलॉजी, 12, पृ. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX।
जू, पी. एट अल. (2022) 'एलएनसीआरएनए/सर्क आरएनए-एमआईआरएनए-एमआरएनए अभिव्यक्ति प्रोफाइल का एकीकृत विश्लेषण मूंगफली में रूट-नॉट नेमाटोड के प्रति प्रतिक्रिया में संभावित तंत्रों में नई अंतर्दृष्टि प्रकट करता है'बीएमसी जीनोमिक्स, 23(1), पृ. 1–12. doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7.
यान, जेड. एट अल. (2022) 'संपूर्ण-ट्रांसक्रिप्टोम आरएनए अनुक्रमण लाल एलईडी विकिरण द्वारा ब्रोकोली में कटाई के बाद की गुणवत्ता के रखरखाव से जुड़े आणविक तंत्रों को उजागर करता है',कटाईोत्तर जीवविज्ञान और प्रौद्योगिकी, 188, पृ. 111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
