एलएनसीआरएनए
लंबे गैर-कोडिंग आरएनए (एलएनसीआरएनए) कम कोडिंग क्षमता वाले लेकिन महत्वपूर्ण नियामक कार्यों के साथ 200 न्यूक्लियोटाइड से अधिक लंबे आरएनए हैं। बीएमकेक्लाउड एलएनसीआरएनए पाइपलाइन को एलएनसीआरएनए और एमआरएनए अभिव्यक्ति का एक साथ विश्लेषण करके उच्च गुणवत्ता, अच्छी तरह से एनोटेटेड संदर्भ जीनोम के साथ आरआरएनए क्षीण पुस्तकालयों का विश्लेषण करने के लिए डिज़ाइन किया गया है। रीड ट्रिमिंग और गुणवत्ता नियंत्रण के बाद, ट्रांसक्रिप्ट को इकट्ठा करने के लिए रीड्स को संदर्भ जीनोम से जोड़ा जाता है, और बाद में जीन संरचना विश्लेषण से वैकल्पिक स्प्लिसिंग और उपन्यास जीन का पता चलता है। प्रतिलेखों को mRNAs या lncRNAs के रूप में पहचाना जाता है, और विभेदक अभिव्यक्ति विश्लेषण विभेदित रूप से व्यक्त lncRNAs, उनके लक्ष्य और विभेदित रूप से व्यक्त जीन (DEGS) की पहचान करता है। डीईजी और विभेदित रूप से व्यक्त एलएनसीआरएनए लक्ष्य दोनों को समृद्ध कार्यात्मक श्रेणियों को खोजने के लिए कार्यात्मक रूप से एनोटेट किया गया है।
बायोइनफॉरमैटिक्स
