उत्पादों

*यहां दिखाए गए सभी डेमो परिणाम बायोमार्कर टेक्नोलॉजीज द्वारा प्रकाशित जीनोम से हैं

1. गुणसूत्र-स्तरीय जीनोम असेंबली पर सर्कसजी. रोटुन्डिफोलियमनैनोपोर अनुक्रमण मंच द्वारा

वांग एम एट अल.,आण्विक जीवविज्ञान और विकास, 2021 

2. वेनिंग राई जीनोम असेंबली और एनोटेशन के आँकड़े

ली जी एट अल.,प्रकृति आनुवंशिकी, 2021

3.जीन की भविष्यवाणीसेचियम एडुलेजीनोम, तीन भविष्यवाणी विधियों से प्राप्त:दे नोवोभविष्यवाणी, होमोलॉजी-आधारित भविष्यवाणी और आरएनए-सेक डेटा आधारित भविष्यवाणी

फू ए एट अल.,बागवानी अनुसंधान, 2021

4. तीन कपास जीनोम में अक्षुण्ण लंबे टर्मिनल दोहराव की पहचान

वांग एम एट अल.,आण्विक जीवविज्ञान और विकास, 2021

5. हाई-सी हीट मैपसी. एक्युमिनटाजीनोम जीनोम-व्यापी सभी-दर-सभी इंटरैक्शन दिखा रहा है।हाई-सी इंटरैक्शन की तीव्रता कंटिग्स के बीच रैखिक दूरी के समानुपाती होती है।इस हीट मैप पर एक साफ सीधी रेखा गुणसूत्रों पर कंटिग्स की अत्यधिक सटीक एंकरिंग का संकेत देती है।(कॉन्टिग एंकरिंग अनुपात: 96.03%)

कांग एम एट अल.,प्रकृति संचार,2021

बीएमके मामला

एक उच्च गुणवत्ता वाली जीनोम असेंबली राई जीनोमिक विशेषताओं और कृषि संबंधी महत्वपूर्ण जीनों पर प्रकाश डालती है

प्रकाशित: प्रकृति आनुवंशिकी, 2021

अनुक्रमण रणनीति:

जीनोम असेंबली: 20 केबी लाइब्रेरी के साथ पैकबायो सीएलआर मोड (497 जीबी, लगभग 63×)
अनुक्रम सुधार: इलुमिना प्लेटफॉर्म पर 270 बीपी डीएनए लाइब्रेरी (430 जीबी, लगभग 54×) के साथ एनजीएस
कॉन्टिग्स एंकरिंग: इलुमिना प्लेटफॉर्म पर हाई-सी लाइब्रेरी (560 जीबी, लगभग 71×)
ऑप्टिकल मानचित्र: (779.55 जीबी, लगभग 99×) बियोनानो आइरिस पर

मुख्य परिणाम

1. वेनिंग राई जीनोम की एक असेंबली को 7.74 जीबी के कुल जीनोम आकार (फ्लो साइटोमेट्री द्वारा अनुमानित जीनोम आकार का 98.74%) के साथ प्रकाशित किया गया था।इस असेंबली के मचान N50 ने 1.04 जीबी हासिल किया।93.67% कंटिग्स को 7 छद्म गुणसूत्रों पर सफलतापूर्वक स्थापित किया गया।इस असेंबली का मूल्यांकन लिंकेज मैप, एलएआई और बुस्को द्वारा किया गया था, जिसके परिणामस्वरूप सभी मूल्यांकनों में उच्च अंक प्राप्त हुए।

2. इस जीनोम के आधार पर तुलनात्मक जीनोमिक्स, जेनेटिक लिंकेज मैप, ट्रांसक्रिपटॉमिक्स अध्ययन पर आगे के अध्ययन किए गए।जीनोमिक विशेषताओं से संबंधित लक्षणों की एक श्रृंखला सामने आई जिसमें जीनोम-वाइड जीन दोहराव और स्टार्च जैवसंश्लेषण जीन पर उनका प्रभाव शामिल था;जटिल प्रोलामिन लोकी का भौतिक संगठन, जीन अभिव्यक्ति में अंतर्निहित प्रारंभिक शीर्षक लक्षण और राई में कल्पित पालतू-संबद्ध गुणसूत्र क्षेत्र और लोकी शामिल हैं।

वेनिंग राई जीनोम की जीनोमिक विशेषताओं पर सर्कोस आरेख

राई जीनोम का विकासवादी और गुणसूत्र सिन्टेनी विश्लेषण