-
جينوم وسيع ايسوسيئيشن تجزيو
جينوم-وائڊ ايسوسيئيشن اسٽڊي (GWAS) جو مقصد جينياتي مختلف قسمن (جينوٽائپ) کي سڃاڻڻ جو مقصد آهي جيڪو مخصوص خاصيتن (فينوٽائپ) سان لاڳاپيل آهي.GWAS مطالعو تحقيق ڪري ٿو جينياتي نشانن کي ماڻهن جي وڏي تعداد جي پوري جينوم کي پار ڪري ٿو ۽ آبادي جي سطح تي شمارياتي تجزيي ذريعي جينوٽائپ-فينوٽائپ ايسوسيئيشن جي اڳڪٿي ڪري ٿو.اهو وڏي پيماني تي انساني بيمارين تي تحقيق ۽ جانورن يا ٻوٽن جي پيچيده خاصيتن تي فنڪشنل جين کان کني ۾ لاڳو ڪيو ويو آهي.
-
ٻوٽن/جانورن جي پوري جينوم جي ترتيب
مڪمل جينوم جي ٻيهر ترتيب، WGS جي نالي سان پڻ مشهور آهي، سڄي جينوم تي عام ۽ نادر ميوٽيشنز کي ظاهر ڪرڻ جي قابل بنائي ٿي، جنهن ۾ سنگل نيوڪليوٽائيڊ پوليمورفيزم (SNP)، انسرشن ڊيليشن (InDel)، ساخت جي تبديلي (SV)، ۽ ڪاپي نمبر ويريشن (CNV) شامل آهن. ).SVs SNPs جي ڀيٽ ۾ مختلف قسم جي بنياد جو هڪ وڏو حصو ٺاهيندا آهن ۽ جينوم تي وڏو اثر آهي، جيڪو جاندارن تي هڪ اهم اثر آهي.ڊگھي پڙھڻ واري ريزڪينسنگ جي اجازت ڏئي ٿي وڌيڪ صحيح سڃاڻپ لاءِ وڏن ٽڪرن ۽ پيچيدگي وارين تبديلين جي ڇاڪاڻ ته ڊگھي پڙھڻ سان ڪروموزومل پار ڪرڻ کي پيچيده علائقن جھڙوڪ ٽينڊم ريپٽس، GC/AT-rich علائقن، ۽ ھائيپر-متغير علائقن کي وڌيڪ آسان بڻائي ٿو.
پليٽ فارم: Illumina، PacBio، نانوپور
-
ارتقائي جينياتي
ارتقائي جينياتي هڪ ڀريل ترتيب واري خدمت آهي جيڪا ڏنل مواد جي ارتقائي معلومات تي هڪ جامع تشريح مهيا ڪرڻ لاءِ تيار ڪئي وئي آهي جن ۾ جينياتي تغيرات جي بنياد تي، بشمول SNPs، InDels، SVs ۽ CNVs.اهو ارتقائي تبديلين ۽ آباديءَ جي جينياتي خصوصيتن کي بيان ڪرڻ لاءِ گهربل سڀ بنيادي تجزيا مهيا ڪري ٿو، جهڙوڪ آبادي جي جوڙجڪ، جينياتي تنوع، فيلوجني رشتا، وغيره. ان ۾ جين جي وهڪري تي پڻ مطالعو شامل آهي، جيڪو اثرائتو آباديءَ جي اندازي، انحراف جي وقت جو اندازو لڳائي ٿو.
-
تقابلي جينومڪس
تقابلي جينومڪس لفظي معني آهي مڪمل جينوم جي ترتيبن ۽ مختلف قسمن جي جوڙجڪ جو مقابلو ڪرڻ.هن نظم و ضبط جو مقصد نسلن جي ارتقا، جيني فنڪشن، جين ريگيوليٽري ميڪانيزم کي جينوم سطح تي ظاهر ڪرڻ آهي ترتيب جي جوڙجڪ ۽ عنصرن جي سڃاڻپ ڪندي جيڪي مختلف نسلن ۾ محفوظ يا مختلف آهن.عام تقابلي جينومڪس مطالعي ۾ جين خاندان ۾ تجزيا شامل آهن، ارتقائي ترقي، سڄو جينوم نقل، چونڊ دٻاء، وغيره.
-
هاء-سي جي بنياد تي جينوم اسيمبلي
هاءِ-سي هڪ طريقو آهي جيڪو ڪروموزوم جي ترتيب کي پڪڙڻ لاءِ تيار ڪيو ويو آهي پروبنگ پروڪسميٽي تي ٻڌل رابطي ۽ اعليٰ ذريعي جي ترتيب کي گڏ ڪري.انهن ڳالهين جي شدت کي مڃيو وڃي ٿو منفي طور تي ڪروموزوم تي جسماني فاصلي سان لاڳاپو.تنهن ڪري، هاء-سي ڊيٽا هڪ مسودو جينوم ۾ گڏ ڪيل ترتيبن جي ڪلسٽرنگ، ترتيب ۽ ترتيب ڏيڻ جي هدايت ڪري سگهي ٿي ۽ انهن کي ڪروموزوم جي هڪ خاص تعداد تي لنگرائڻ.هي ٽيڪنالاجي آبادي جي بنياد تي جينياتي نقشي جي غير موجودگي ۾ ڪروموزوم-سطح جي جينوم اسيمبلي کي طاقت ڏئي ٿي.هر هڪ جينوم کي هاء-سي جي ضرورت آهي.
پليٽ فارم: Illumina NovaSeq پليٽ فارم / DNBSEQ
-
ٻوٽو/جانور ڊي نوو جينوم جي ترتيب
ڊي نووترتيب ڏيڻ جو مطلب آھي ھڪڙي نسل جي پوري جينوم جي تعمير کي ترتيب ڏيڻ واري ٽيڪنالاجي استعمال ڪندي، مثال طور PacBio، Nanopore، NGS، وغيره، ھڪڙي ريفرنس جينوم جي غير موجودگي ۾.ٽين نسل جي ترتيب واري ٽيڪنالاجيز جي پڙهڻ جي ڊيگهه ۾ قابل ذڪر بهتري پيچيده جينومز کي گڏ ڪرڻ ۾ نوان موقعا آڻيا آهن، جهڙوڪ اهي جيڪي اعلي هيٽرروزائيگوسٽي، اعلي ريپيٽيوٽ علائقن جو تناسب، پوليپلائيڊ وغيره وغيره. بار بار عناصر کي حل ڪرڻ، غير معمولي GC مواد ۽ ٻين انتهائي پيچيده علائقن سان علائقا.
پليٽ فارم: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq پليٽ فارم
-
انسان جي مڪمل Exome تسلسل
مڪمل exome تسلسل (WES) کي هڪ قيمتي اثرائتي ترتيب واري حڪمت عملي جي طور تي سڃاتو وڃي ٿو بيماري سبب ميوٽيشنز کي سڃاڻڻ لاءِ.جيتوڻيڪ Exons صرف سڄي جينوم جو تقريبا 1.7٪ کڻندو آهي، اهو سڌو سنئون پروٽين جي مجموعي ڪارڪردگي جي نمائندگي ڪري ٿو.انساني جينوم ۾، اهو ٻڌايو ويو آهي ته 85 سيڪڙو کان وڌيڪ بيمارين سان لاڳاپيل ميوٽيشنز پروٽين ڪوڊنگ واري علائقي ۾ ٿينديون آهن.
BMKGENE پيش ڪري ٿو جامع ۽ لچڪدار انساني پوري exome ترتيب ڏيڻ واريون خدمتون مختلف Exon ڪيپچرنگ حڪمت عملين سان گڏ مختلف تحقيقي مقصدن کي پورا ڪرڻ لاءِ موجود آهن.
پليٽ فارم: Illumina NovaSeq پليٽ فارم
-
مخصوص-لوڪس ايمپليفائيڊ فريگمينٽ تسلسل (SLAF-Seq)
وڏي پيماني تي جين ٽائپنگ، خاص طور تي وڏي پئماني تي آبادي تي، جينياتي انجمن جي مطالعي ۾ هڪ بنيادي قدم آهي، جيڪو جينياتي بنياد مهيا ڪري ٿو فنڪشنل جين دريافت، ارتقائي تجزيي وغيره لاءِ. ) متعارف ڪرايو ويو آهي ترتيب ڏيڻ جي قيمت کي گھٽائڻ لاءِ في نمونو، جڏهن ته جينياتي مارڪر دريافت تي مناسب ڪارڪردگي برقرار رکڻ.اهو عام طور تي ڏنل سائيز جي حد اندر پابندي واري ٽڪري کي ڪڍڻ سان حاصل ڪيو ويندو آهي، جنهن جو نالو آهي گھٽ نمائندگي لائبريري (RRL).Specific-locus amplified fragment sequencing (SLAF-Seq) هڪ خود ترقي يافته حڪمت عملي آهي SNP جينوٽائپنگ لاءِ ريفرنس جينوم سان يا بغير.
پليٽ فارم: Illumina NovaSeq پليٽ فارم
