ڊي اين اي / آر اين اي ترتيب ڏيڻ - نانوپور ترتيب ڏيڻ وارو
سروس تفصيلات خاصيتون
| پليٽ فارم | لائبريري سائيز | نظرياتي ڊيٽا جي پيداوار (في سيل) | سنگل بنياد جي درستگي | درخواستون |
| نانوپور | 8Kb، 10kb، 20kb، الٽرا لانگ، سي ڊي اين اي-پي سي آر | 70-90 جي بي / سيل | 85-92% | SV ڪالنگ، ڊي نوو، مڪمل ڊگھائي ترتيب، Iso-Seq، جيني تشريح، ڊي اين اي ميٿيليشن جي چڪاس |
سروس فائدا
● PacBio ترتيب ڏيڻ واري پليٽ فارم تي 5 سالن کان وڌيڪ تجربو، مختلف قسمن سان گڏ هزارين بند منصوبن سان.
● BMKGENE دوئي پليٽ فارم RNA/DNA سرٽيفڪيشن سان، آڪسفورڊ نانوپور جو آفيشل پارٽنر آهي.
● هتي مڪمل سامان ۽ ڪافي ترتيب ڏيڻ جي ذريعي sequencers جا مکيه اسٽريم ماڊل آهن.
● نانوپور پليٽ فارم جي بنياد تي، 10 کان وڌيڪ جانورن ۽ ٻوٽن جي Denovo تحقيقن کي بين الاقوامي معروف جرنلز ۾ شايع ڪيو ويو آهي.
نموني جي گهرج
| نموني جو قسم | رقم | ڪنسنٽريشن (Qubit®) | حجم | پاڪائي | ٻيا |
| جينوميڪ ڊي اين اي | ڊيٽا جي گهرج تي دارومدار | ≥20ng/μl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.2؛ OD260/230≥1.5 260 nm تي صاف چوٽي، ڪو به آلودگي ناهي | ڪنسنٽريشن کي Qubit ۽ Qubit/Nanopore ≤ 2 ذريعي ماپڻ جي ضرورت آهي |
| ڪل RNA | ≥1.2μg | ≥100μg/μl | ≥15μl | OD260/280 = 1.7-2.5؛ OD260/230=0.5-2.5؛ ڪا به آلودگي ناهي | RIN قدر ≥7.5 |
خدمت جو ڪم فلو
نموني تيار ڪرڻ
لائبريري جي تعمير
تسلسل
ڊيٽا جو تجزيو
پروجيڪٽ پهچائڻ
ڊي اين اي نموني جي ڊيٽا جي معيار جو جائزو
جدول 1. صاف ڊيٽا تي شماريات.
| BMKID | rawSeqNum | rawSumBase | cleanSeqNum | cleanSumBase | صاف اين 50 لين | صاف اين 90 لين | صاف مين لين | صاف ميڪس لين | صاف مينڪوال |
| DNA_BMK01 | 1,218,239 | 26.37 | 1,121,736 | 25.90 | 28,014 | 15,764 | 23,090 | 143,181 | 9 |
آر اين اي نموني جي ڊيٽا جي معيار جو جائزو
جدول 1. صاف ڊيٽا تي شماريات.
| فائل جو نالو | ڪلائنٽ ID | پڙهو نمبر | BaseNum | N50 | مين ڊگھائي | وڌ ۾ وڌ ڊگھائي | MeanQscore |
| RNA_BMK001 | C2 | 8,947,708 | 4,047,230,083 | 398 | 452 | 129,227 | سوال 12 |
شڪل 1. پڙهو ڊگھائي تقسيم
شڪل 2. صاف ڊيٽا جي معيار جي سکور جي تقسيم
شڪل 3. صاف ڊيٽا جي ڊگھائي ۽ معيار جي سکور جي ورڇ
