ميٽاجينومڪ سيڪوئنسنگ - اين جي ايس
ميٽاجينوم جاندارن جي هڪ مخلوط برادري جي ڪل جينياتي مواد جو هڪ مجموعو آهي، جهڙوڪ ماحولياتي ۽ انساني ميٽاجينومز. ان ۾ پوکي لائق ۽ غير پوکي لائق مائڪروجنزم ٻنهي جا جينوم شامل آهن. اين جي ايس سان شاٽگن ميٽاجينومڪ سيڪوئنسنگ انهن پيچيده جينومڪ منظرنامن جي مطالعي کي قابل بڻائي ٿو جيڪي ٽيڪسونومڪ پروفائلنگ کان وڌيڪ مهيا ڪندي ماحولياتي نمونن ۾ شامل آهن، نسلن جي تنوع، ڪثرت جي حرڪيات، ۽ پيچيده آبادي جي جوڙجڪ ۾ پڻ گرينولر بصيرت فراهم ڪن ٿا. ٽيڪسونومڪ مطالعي کان ٻاهر، شاٽگن ميٽاجينومڪس هڪ فنڪشنل جينومڪس نقطه نظر پڻ پيش ڪري ٿو، انڪوڊ ٿيل جينز جي ڳولا ۽ ماحولياتي عملن ۾ انهن جي پوٽيٽو ڪردارن کي فعال بڻائي ٿو. آخرڪار، جينياتي عنصرن ۽ ماحولياتي عنصرن جي وچ ۾ رابطي جي نيٽ ورڪن جو قيام مائڪروبيل برادرين ۽ انهن جي ماحولياتي پس منظر جي وچ ۾ پيچيده رابطي جي جامع سمجھ ۾ حصو وٺندو آهي. نتيجي ۾، ميٽاجينومڪ سيڪوئنسنگ متنوع مائڪروبيل برادرين جي جينومڪ پيچيدگين کي حل ڪرڻ لاءِ هڪ اهم اوزار طور بيٺو آهي، انهن پيچيده ماحولياتي نظام اندر جينياتي ۽ ماحوليات جي وچ ۾ گهڻ رخي لاڳاپن کي روشن ڪري ٿو.
پليٽ فارم: Illumina NovaSeq ۽ DNBSEQ-T7
خدمت جا فائدا
●مائڪروبيل ڪميونٽي پروفائلنگ لاءِ آئسوليشن ۽ ڪلٽيويشن فري طريقو: غير پوکيل جاندارن مان جينياتي مواد جي ترتيب کي فعال ڪرڻ.
●هاءِ ريزوليوشن: ماحولياتي نمونن ۾ گهٽ ڪثرت واري جنسن جي سڃاڻپ ڪريو.
●جامع بايو انفارميٽڪس تجزيو:نه رڳو ٽيڪسونومڪ تنوع تي پر برادري جي فنڪشنل تنوع تي پڻ ڌيان ڏنو ويو.
●وسيع تجربو:مختلف ريسرچ ڊومينز ۾ ڪيترن ئي ميٽاجينومڪس منصوبن کي ڪاميابي سان بند ڪرڻ ۽ 200,000 کان وڌيڪ نمونن جي پروسيسنگ جي ٽريڪ رڪارڊ سان، اسان جي ٽيم هر منصوبي ۾ تجربي جو خزانو آڻيندي آهي.
سروس جون وضاحتون
| ترتيب ڏيڻ وارو پليٽ فارم | تسلسل جي حڪمت عملي | تجويز ڪيل ڊيٽا | معيار تي ضابطو |
| ايلومينا نووا سيڪ يا ڊي اين بي ايس اي ڪيو-ٽي 7 | پي اي 150 | 6-20 جي بي | Q30≥85٪ |
خدمت جون گهرجون
| ڪنسنٽريشن (ng/µL) | ڪُل رقم (ng) | حجم (µL) |
| ≥1 | ≥30 | ≥20 |
● مٽي/ کيچڙ: 2-3 گرام
● جانورن جي آنڊن ۾ مقدار: 0.5-2 گرام
● آنڊن جو مواد - جيت: 0.1-0.25 گرام
● ٻوٽي جي مٿاڇري (ڀريل تلچھٽ): 0.5-1 گرام
● خمير جو شوربو، جيڪو گندگي سان ڀريل آهي): 0.2-0.5 گرام
● پاخانو (وڏا جانور): 0.5-2 گرام
● پاخانو (مائو): 3-5 داڻا
● ڦڦڙن جي اليوولر لواڙ جو پاڻي: فلٽر پيپر
● ويجنل سواب: 5-6 سواب
● چمڙي/جينيٽل سواب/لعاب/منهنجي نرم ٽشو/فرينجيل سواب/مرڪزي سواب: 2-3 سواب
● مٿاڇري جا مائڪرو آرگنزم: 5-6 سواب
● پاڻي جو جسم/هوا/بايو فلم: فلٽر پيپر
● اينڊوفائٽس: 2-3 گرام
● ڏندن جي تختي: 0.5-1 گرام
سروس ڪم جو وهڪرو
نموني پهچائڻ
لائبريري جي تعمير
تسلسل
ڊيٽا جو تجزيو
وڪري کان پوءِ جون خدمتون
هيٺ ڏنل تجزيو شامل آهي:
● ڊيٽا جي معيار جي ضابطي جي ترتيب
● ميٽاجينومي اسيمبلي ۽ جين جي اڳڪٿي
● جين جي تشريح
● ٽيڪسونومڪ الفا ڊائيوورسٽي تجزيو
● برادري جو فنڪشنل تجزيو: حياتياتي ڪم، ميٽابولڪ، اينٽي بايوٽڪ مزاحمت
● فنڪشنل ۽ ٽيڪسونومڪ تنوع ٻنهي تي تجزيو:
بيٽا تنوع جو تجزيو
گروپن جي وچ ۾ تجزيو
باهمي تعلق جو تجزيو: ماحولياتي عنصرن ۽ OUT جي جوڙجڪ ۽ تنوع جي وچ ۾
فنڪشنل تجزيو: ڪارڊ اينٽي بايوٽڪ مزاحمت
KEGG ميٽابولڪ رستن جو فرقي تجزيو: اهم رستن جو گرمي نقشو
ٽيڪسونومڪ ورڇ جي الفا تنوع: ACE انڊيڪس
ٽيڪسونومڪ ورڇ جي بيٽا تنوع: PCoA
بي ايم ڪي جين جي ميٽاجينوم سيڪوئنسنگ سروسز پاران ايلومينا سان گڏ اشاعتن جي هڪ ترتيب ڏنل مجموعي ذريعي سهولت فراهم ڪيل ترقي کي ڳولهيو.
هائي، ڪيو. وغيره (2023) 'مختلف ڪلچر پاڻي جي گرمي پد تي متعدي هيماٽوپوئيٽڪ نڪروسس وائرس سان متاثر ٿيل رينبو ٽرائوٽ (آنڪورهينڪس مائيڪس) جي آنڊن جي مواد ۾ تبديلين جو ميٽاجينومڪ ۽ ميٽابولومڪ تجزيو'،مائڪرو بائيولاجي ۾ سرحدون، 14، صفحو 1275649. doi: 10.3389/FMICB.2023.1275649.
ماؤ، سي. ۽ ٻيا (2023) 'مختلف ٽرافڪ رياستن جي شهري ڍنڍن ۾ مائڪروبيل برادريون، مزاحمتي جين، ۽ مزاحمتي خطرا: اندروني رابطا ۽ ٻاهرين اثر'،خطرناڪ مواد جي ترقي جو جرنل، 9، ص. 100233. doi: 10.1016/J.HAZADV.2023.100233.
ايس يو، ايم ۽ ٻيا (2022) 'ميٽاجينومڪ تجزيو رڍن رومن جي مائع سان لاڳاپيل ۽ مضبوط سان لاڳاپيل مائڪروجنزم جي وچ ۾ ساخت ۽ ڪم ۾ فرق ظاهر ڪيو'،مائڪرو بائيولاجي ۾ سرحدون، 13، صفحو 851567. doi: 10.3389/FMICB.2022.851567.
ين، جي. وغيره (2023) 'موٽي ننگشيانگ سور مان نڪتل مائڪروبيوٽا ڪارنيٽين ميٽابولزم کي ٻيهر وائر ڪري ٿو ته جيئن ٿلهي DLY سورن ۾ عضلاتي فيٽي ايسڊ جمع کي فروغ ڏئي سگهجي'،جدت، 4 (5)، ص. 100486. doi: 10.1016/J.XINN.2023.100486.
زاؤ، ايڪس ۽ ٻيا (2023) 'چين جي هائيهي ايسٽوري جي مٿئين ۽ هيٺين پهچ ۾ نمائندگي ڪندڙ بايو/غير خراب ٿيندڙ پلاسٽڪ ۽ غير پلاسٽڪ ملبے جي امڪاني خطرن ۾ ميٽاجينومڪ بصيرت'،ڪُل ماحول جي سائنس، 887، ص. 164026. doi: 10.1016/J.SCITOTENV.2023.164026.
