-
جينوم وسيع ايسوسيئيشن تجزيو
جينوم-وائڊ ايسوسيئيشن اسٽڊي (GWAS) جو مقصد جينياتي مختلف قسمن (جينوٽائپ) کي سڃاڻڻ جو مقصد آهي جيڪو مخصوص خاصيتن (فينوٽائپ) سان لاڳاپيل آهي.GWAS مطالعو تحقيق ڪري ٿو جينياتي نشانن کي ماڻهن جي وڏي تعداد جي پوري جينوم کي پار ڪري ٿو ۽ آبادي جي سطح تي شمارياتي تجزيي ذريعي جينوٽائپ-فينوٽائپ ايسوسيئيشن جي اڳڪٿي ڪري ٿو.اهو وڏي پيماني تي انساني بيمارين تي تحقيق ۽ جانورن يا ٻوٽن جي پيچيده خاصيتن تي فنڪشنل جين کان کني ۾ لاڳو ڪيو ويو آهي.
-
سنگل نيوڪليس آر اين اي جي ترتيب
سنگل سيل ڪيپچرنگ ۾ اڳڀرائي ۽ انفرادي لائبريري جي تعمير جي ٽيڪنڪ کي گڏ ڪرڻ سان گڏ اعليٰ ذريعي جي ترتيب سان جيني اظهار جي مطالعي جي اجازت ڏئي ٿي سيل جي بنياد تي.اهو پيچيده سيل جي آبادي تي هڪ گہرے ۽ مڪمل نظام جي تجزيي کي قابل بنائي ٿو، جنهن ۾ اهو گهڻو ڪري سڀني سيلن جي اوسط وٺڻ سان انهن جي هيٽروجنيٽي کي ڇڪڻ کان بچائيندو آهي.
تنهن هوندي به، ڪجهه سيلن کي واحد-سيل معطل ڪرڻ لاء مناسب نه آهي، تنهنڪري ٻين نموني تيار ڪرڻ جا طريقا - بافتن مان نيوڪليس ڪڍڻ جي ضرورت آهي، اهو آهي، نيوڪليس سڌو سنئون ٽشوز يا سيل مان ڪڍيو وڃي ٿو ۽ اڪيلو-نيوڪليس معطلي ۾ تيار ڪيو وڃي ٿو. سيل جي ترتيب.
BMK مهيا ڪري ٿي 10× جينوميڪس ChromiumTM تي ٻڌل سنگل سيل RNA ترتيب ڏيڻ جي خدمت.هن خدمت کي وڏي پيماني تي استعمال ڪيو ويو آهي مطالعي ۾ بيمارين سان لاڳاپيل مطالعي، جهڙوڪ مدافعتي سيل جي فرق، طومار جي فرق، ٽائيسو جي ترقي، وغيره.
مقامي ٽرانسڪرپٽ چپ: 10 × جينومڪس
پليٽ فارم: Illumina NovaSeq 6000
-
ٻوٽن/جانورن جي پوري جينوم جي ترتيب
مڪمل جينوم جي ٻيهر ترتيب، WGS جي نالي سان پڻ مشهور آهي، سڄي جينوم تي عام ۽ نادر ميوٽيشنز کي ظاهر ڪرڻ جي قابل بنائي ٿي، جنهن ۾ سنگل نيوڪليوٽائيڊ پوليمورفيزم (SNP)، انسرشن ڊيليشن (InDel)، ساخت جي تبديلي (SV)، ۽ ڪاپي نمبر ويريشن (CNV) شامل آهن. ).SVs SNPs جي ڀيٽ ۾ مختلف قسم جي بنياد جو هڪ وڏو حصو ٺاهيندا آهن ۽ جينوم تي وڏو اثر آهي، جيڪو جاندارن تي هڪ اهم اثر آهي.ڊگھي پڙھڻ واري ريزڪينسنگ جي اجازت ڏئي ٿي وڌيڪ صحيح سڃاڻپ لاءِ وڏن ٽڪرن ۽ پيچيدگي وارين تبديلين جي ڇاڪاڻ ته ڊگھي پڙھڻ سان ڪروموزومل پار ڪرڻ کي پيچيده علائقن جھڙوڪ ٽينڊم ريپٽس، GC/AT-rich علائقن، ۽ ھائيپر-متغير علائقن کي وڌيڪ آسان بڻائي ٿو.
پليٽ فارم: Illumina، PacBio، نانوپور
-
BMKMANU S1000 Spatial Transscriptome
سيلز جي فضائي تنظيم مختلف حياتياتي عملن ۾ اهم ڪردار ادا ڪري ٿي، جهڙوڪ مدافعتي انفلٽريشن، ايمبريو ڊولپمينٽ، وغيره. اسپائيٽل ٽرانسڪرپٽوم سيڪوئنسنگ، جيڪو اشارو ڪري ٿو جين ايڪسپريس پروفائلنگ جڏهن ته مقامي پوزيشن جي معلومات کي برقرار رکندي، ٽرانسڪرپوم-سطح جي ٽشو آرڪيٽيڪچر ۾ وڏي ڄاڻ ڏني آهي.ٽيڪنالاجي جي ترقي سان، الٽرا صاف ٽشو مورفولوجي ۽ مقامي سالماتي اظهار جي حقيقي ساخت جي فرق کي اعلي ريزوليوشن سان مطالعو ڪرڻ جي ضرورت آهي.BMKGENE جامع، ون-اسٽاپ اسپيشل ٽرانسڪرپٽوم سيڪوئنسنگ سروس مهيا ڪري ٿي نمونن کان وٺي حياتياتي بصيرت تائين.
خلائي ٽرانسڪرپٽوميڪس ٽيڪنالاجيز مختلف تحقيقي ميدان ۾ ناول جي نقطه نظر کي بااختيار بڻايو آهي جين ايڪسپريس پروفائل کي حل ڪرڻ سان مقامي مواد سان هيٽروجنس نمونن ۾.
مقامي ٽرانسڪرپٽ چپ: BMKMANU S1000
پليٽ فارم: Illumina NovaSeq 6000
-
10x جينومڪس ويزيم اسپيٽيل ٽرانسڪروم
Visium Spatial Gene Expression is a mainstream spatial transscriptome sequencing technology for tissue classifying based on total mRNA.مڪمل ٽرانسڪرپٽوم کي مورفولوجيڪ حوالي سان نقشو ٺاهيو ته جيئن عام ترقي، بيماري جي پيچيدگي، ۽ ڪلينيڪل ترجمواتي تحقيق ۾ ناول جي بصيرت کي دريافت ڪيو وڃي.BMKGENE جامع، ون-اسٽاپ اسپيشل ٽرانسڪرپٽوم سيڪوئنسنگ سروس مهيا ڪري ٿي نمونن کان وٺي حياتياتي بصيرت تائين.
خلائي ٽرانسڪرپٽوميڪس ٽيڪنالاجيون مختلف تحقيقي ميدان ۾ ناول جي نقطه نظر کي بااختيار بڻائين ٿيون جن جي اظهار جي پروفائل کي حل ڪندي مختلف نمونن ۾ فضائي مواد سان.
مقامي ٽرانسڪرپٽ چپ: 10x جينومڪس ويزيم
پليٽ فارم:Illumina NovaSeq 6000
-
مڪمل ڊگھائي mRNA تسلسل-نانوپور
آر اين اي ترتيب ڏيڻ هڪ انمول اوزار رهيو آهي جامع ٽرانسڪروم تجزيي لاءِ.بلاشڪ، روايتي مختصر-پڙهندڙ ترتيب هتي ڪيترن ئي اهم ترقي حاصل ڪئي.پر ان جي باوجود، اهو اڪثر ڪري مڪمل ڊگھي isoform سڃاڻپ، مقدار، PCR تعصب ۾ حدن کي منهن ڏئي ٿو.
نانوپور جي ترتيب پاڻ کي ٻين ترتيب ڏيڻ واري پليٽ فارمن کان الڳ ڪري ٿي، ان ۾ نيوڪليوٽائڊس سڌو سنئون ڊي اين اي جي ٺاھ جوڙ کان سواء پڙھيا ويندا آھن ۽ ڏھن ڪلو بيسس تي ڊگھي پڙھي پيدا ڪري ٿي.هي مڪمل ڊگھي ٽرانسڪرپٽس کي سڌو سنئون پڙهڻ جي اجازت ڏئي ٿو ۽ isoform سطح جي مطالعي ۾ چئلينج کي منهن ڏيڻ.
پليٽ فارم:نانوپور PromethION
لائبريري:cDNA-PCR
-
مڪمل ڊگھائي mRNA تسلسل -PacBio
نئونمڪمل ڊگھي ٽرانسڪرپٽم ترتيب، پڻ سڃاتو وڃي ٿونئونIso-Seq پڙهڻ جي ڊيگهه ۾ PacBio sequencer جا فائدا وٺي ٿو، جيڪو بغير ڪنهن وقفي جي مڪمل ڊگھي cDNA ماليڪيولز جي ترتيب کي قابل بڻائي ٿو.هي مڪمل طور تي ٽرانسڪرپٽ اسيمبلي جي مرحلن ۾ پيدا ٿيندڙ ڪنهن به غلطي کان بچي ٿو ۽ يونيگين سيٽ کي isoform-level ريزوليوشن سان ٺاهي ٿو.هي يونيگين سيٽ طاقتور جينياتي معلومات مهيا ڪري ٿو "ريفرنس جينوم" جي طور تي ٽرانسڪرپوم-سطح تي.ان کان علاوه، ايندڙ نسل جي ترتيب واري ڊيٽا سان گڏ، هي خدمت isoform-level expression جي صحيح مقدار کي اختيار ڪري ٿي.
پليٽ فارم: PacBio Sequel IIلائبريري: SMRT بيل لائبريري -
Eukaryotic mRNA تسلسل-Illumina
mRNA جي ترتيب خاص حالتن جي تحت سيلز مان نقل ڪيل سڀني mRNAs جي پروفائلنگ کي قابل بڻائي ٿي.اها جين ايڪسپريس پروفائل، جين جي جوڙجڪ ۽ ڪجهه حياتياتي عملن جي ماليڪيولر ميڪانيزم کي ظاهر ڪرڻ لاءِ هڪ طاقتور ٽيڪنالاجي آهي.اڄ تائين، ايم آر اين اي جي ترتيب کي وڏي پيماني تي استعمال ڪيو ويو آهي بنيادي تحقيق، ڪلينڪل تشخيص، دوا جي ترقي، وغيره.
پليٽ فارم: Illumina NovaSeq 6000
-
غير حوالي سان ٻڌل mRNA تسلسل-Illumina
mRNA ترتيب ڏيڻ ايندڙ نسل جي ترتيب ڏيڻ واري ٽيڪنڪ (NGS) کي اپنائڻ لاءِ ميسينجر RNA (mRNA) فارم Eukaryote کي مخصوص دور ۾ پڪڙيندي آهي ته ڪي خاص فنڪشن فعال ٿي رهيا آهن.ورهايل سڀ کان ڊگھي ٽرانسڪرپٽ کي 'Unigene' سڏيو ويو ۽ بعد ۾ تجزيي لاءِ حوالن جي ترتيب طور استعمال ڪيو ويو، جيڪو هڪ مؤثر وسيلو آهي انوکي ميکانيزم ۽ نسلن جي ريگيوليٽري نيٽ ورڪ کي بغير حوالن جي مطالعي ڪرڻ لاءِ.
ٽرانسڪروم ڊيٽا اسيمبلي ۽ يونيگين فنڪشنل تشريح کان پوء
(1) ايس ايس آر تجزيو، سي ڊي ايس جي اڳڪٿي ۽ جين جي جوڙجڪ کي اڳڀرائي ڪيو ويندو.
(2) هر نموني ۾ يونيجن اظهار جي مقدار کي انجام ڏنو ويندو.
(3) نمونن (يا گروپن) جي وچ ۾ مختلف طور تي ظاهر ڪيل يونيجنز کي دريافت ڪيو ويندو يونيجن اظهار جي بنياد تي
(4) ڪلسٽرنگ، فنڪشنل تشريح ۽ مختلف طور تي ظاهر ڪيل يونيجنز جي افزودگي جو تجزيو ڪيو ويندو.
-
ڊگھو غير ڪوڊنگ تسلسل-Illumina
لانگ نان ڪوڊنگ RNAs (lncRNAs) آر اين اي ماليڪيولز جو ھڪڙو قسم آھي جنھن جي ڊگھائي 200 nt کان وڌيڪ ھوندي آھي، جيڪي انتهائي گھٽ ڪوڊنگ جي صلاحيت جي خصوصيت رکن ٿيون.LncRNA، غير ڪوڊنگ آر اين ايز ۾ هڪ اهم ميمبر جي طور تي، خاص طور تي نيوڪليس ۽ پلازما ۾ مليا آهن.ٽيڪنالوجي ۽ بايو انفارميٽڪس کي ترتيب ڏيڻ ۾ ترقي ڪيترن ئي ناولن lncRNAs جي سڃاڻپ کي قابل بڻائي ٿي ۽ انهن کي حياتياتي ڪمن سان لاڳاپيل ڪري ٿو.مجموعي ثبوتن مان معلوم ٿئي ٿو ته lncRNA وڏي پيماني تي ايپيگينيٽڪ ريگيوليشن، ٽرانسڪرپشن ريگيوليشن ۽ پوسٽ ٽرانسپشن ريگيوليشن ۾ شامل آهي.
