هيٽ ميپ
هيٽ ميپ ٽول هڪ ميٽرڪس ڊيٽا فائل کي ان پٽ طور قبول ڪري ٿو ۽ صارفين کي ڊيٽا کي فلٽر ڪرڻ، نارمل ڪرڻ ۽ ڪلسٽر ڪرڻ جي اجازت ڏئي ٿو. هيٽ ميپس لاءِ بنيادي استعمال ڪيس مختلف نمونن جي وچ ۾ جين ايڪسپريشن ليول جو ڪلسٽر تجزيو آهي.
جين تشريح
جين اينوٽيشن ٽول مختلف ڊيٽابيسز جي خلاف ان پٽ FASTA فائلن جي ترتيب جي بنياد تي جين اينوٽيشن انجام ڏئي ٿو.
بنيادي مقامي ترتيب ڳولا وارو اوزار (BLAST)
BLAST ٽول NCBI BLAST جو هڪ BMKCloud ضم ٿيل نسخو آهي ۽ BMKCloud اڪائونٽ تي اپ لوڊ ڪيل ڊيٽا استعمال ڪندي ساڳيا ڪم ڪرڻ لاءِ استعمال ڪري سگهجي ٿو.
CDS_UTR جي اڳڪٿي
CDS_UTR اڳڪٿي وارو اوزار ڄاڻايل پروٽين ڊيٽابيس ۽ ORF اڳڪٿي جي نتيجن جي خلاف BLAST نتيجن جي بنياد تي ڏنل ٽرانسڪرپٽ ترتيبن ۾ ڪوڊنگ علائقن (CDS) ۽ نان ڪوڊنگ علائقن (UTR) جي اڳڪٿي ڪرڻ لاءِ ٺاهيو ويو آهي.
مين هٽن پلاٽ
مين هٽن پلاٽ ٽول اعليٰ نموني تجربن جي نمائش کي فعال بڻائي ٿو ۽ عام طور تي جينوم-وائڊ ايسوسيئيشن اسٽڊيز (GWAS) ۾ استعمال ٿيندو آهي.
سرڪوس ڊاگرام
CIRCOS ڊاگرام ٽول جينوم ۾ جينومڪ خصوصيتن کي ڪيئن ورهايو ويندو آهي ان جو موثر تصور مهيا ڪري ٿو. عام خاصيتن ۾ مقداري لوڪي، SNPs، InDels، structural ۽ ڪاپي نمبر مختلف قسم شامل آهن.
جين آنٽولوجي (GO) افزودگي
GO Enrichment ٽول فنڪشنل اينوريچمينٽ تجزيو مهيا ڪري ٿو. هن ٽول ۾ بنيادي سافٽ ويئر TopGO-Bioconductor پيڪيج آهي، جنهن ۾ ڊفرنشل ايڪسپريشن تجزيو، GO Enrichment تجزيو ۽ نتيجن جو تصور شامل آهي.
وزني جين ڪو-ايڪسپريشن نيٽ ورڪ تجزيو (WGCNA)
WGCNA هڪ وڏي پيماني تي استعمال ٿيندڙ ڊيٽا مائننگ طريقو آهي جيڪو جين ڪو-ايڪسپريشن ماڊيولز کي دريافت ڪرڻ لاءِ آهي. اهو مختلف ايڪسپريشن ڊيٽا سيٽ تي لاڳو ٿئي ٿو جنهن ۾ مائڪرو ايري ۽ اين جي ايس جين ايڪسپريشن ڊيٽا شامل آهن.
انٽر پرو اسڪين
انٽرپرو اسڪين ٽول انٽرپرو پروٽين جي ترتيب جو تجزيو ۽ درجه بندي فراهم ڪري ٿو.
GO KEGG افزودگي
GO KEGG Enrichment ٽول هڪ مهيا ڪيل جين سيٽ ۽ لاڳاپيل تشريح جي بنياد تي GO Enrichment هسٽوگرام، KEGG Enrichment هسٽوگرام ۽ KEGG Enrichment pathway پيدا ڪرڻ لاءِ ٺهيل آهي.
