Nanopor əsaslı tam uzunluqlu transkriptom ardıcıllığı
Nanopor sekvensiyası özünü digər ardıcıllıq platformalarından fərqləndirir ki, nukleotidlər birbaşa DNT sintezi olmadan oxunur və onlarla kilobazada uzun oxunuşlar yaradır.Bu, tammetrajlı transkriptləri birbaşa oxumağa və transkriptomik tədqiqatlardakı problemləri həll etməyə imkan verir.
√ Aşağı ardıcıllıqla spesifik meyl
√ Gen strukturu tədqiqatları üçün cDNT-nin tam uzunluqda oxunması
√ Eyni sayda transkriptləri əhatə etmək üçün daha az məlumat tələb olunur
√ Hər gen üçün çoxlu izoformların identifikasiyası
√ İzoform səviyyəsində ifadənin kəmiyyəti
Tipik Bioinformatika Boru Kəməri
Biomarker Texnologiyaları ilə Ən Son Uğurlu İşlər
1. Tam uzunluqlu transkriptomların müqayisəli təhlili Gnetum luofuense gövdəsinin inkişaf dinamikasını aşkar edir.
Jurnal: Genetikada sərhədlər
Nəşr olundu: Mart 2021
Açar sözlər: MinION |Alternativ birləşdirmə |APA |lncRNA |Diferensial şəkildə ifadə edilmiş transkriptlər
Tam mətni oxuyun
2. Spesifik heteroqraftlarda kiçik RNT-lərin tumurcuqlardan köklərə qədər bir istiqamətli hərəkəti
Jurnal: Təbiət Bitkiləri
Nəşr olundu: Yanvar 2021
Açar sözlər: Nanopor |Illumina |tam uzunluqlu mobil mRNT aşkarlanması
3. Qulançar köklərinin tam uzunluqlu transkriptom analizi arbuskulyar mikorizal göbələklərin yaratdığı duzlara dözümlülüyün molekulyar mexanizmini ortaya qoyur.
Jurnal: Ətraf Mühit və Eksperimental Botanika
Nəşr olundu: Yanvar 2021
Açar sözlər: MinION |Diferensial ifadə edilmiş transkriptlər |Transkripsiya amilləri |Alternativ bağlama
4. Quraqlıq Stressinə Cavab olaraq Gül (Rosa chinensis) Kökləri və Yarpaqlarının Fizioloji Xarakterik Dəyişiklikləri və Tam Uzunluqlu Transkriptomu
Jurnal: Bitki və Hüceyrə Fiziologiyası
Nəşr olundu: Oktyabr 2020
Açar sözlər: PromethION |Diferensial ifadə edilmiş transkriptlər |Funksional proqnoz |Birləşdirilmiş izoformalar |TF və lncRNA
5. PacBio və Arabidopsis transkriptomunun nanopor əsaslı RNT ardıcıllığının təhlili və hərtərəfli müqayisəsi
Jurnal: Bitki metodu
Nəşr olundu: Aprel 2020
Açar sözlər: GridION |PromethION |PacBio Davamı |Illumina NovaSeq |Genom uyğunlaşdırılması |Transkript identifikasiyası |Alternativ birləşdirmə |SSR |LncRNA |İzoformun kəmiyyəti
Xəbərlər və Mövzular Ən son uğurlu hadisələri Biomarker Technologies ilə bölüşmək, yeni elmi nailiyyətləri, eləcə də tədqiqat zamanı tətbiq olunan görkəmli texnikaları əldə etmək məqsədi daşıyır.
Göndərmə vaxtı: 08 yanvar 2022-ci il