Seqüenciació de transcriptoma de longitud completa basada en nanopors
La seqüenciació de nanopores es distingeix d'altres plataformes de seqüenciació, ja que els nucleòtids es llegeixen directament sense síntesi d'ADN i genera lectures llargues a desenes de quilobases.Això permet la lectura directa de transcripcions completes i abordar els reptes dels estudis transcriptòmics.
√ Baix biaix específic de la seqüència
√ Lectura completa de l'ADNc per a estudis d'estructura gènica
√ Menys dades necessàries per cobrir el mateix nombre de transcripcions
√ Identificació de múltiples isoformes per gen
√ Quantificació de l'expressió a nivell d'isoforma
Gasoducte bioinformàtic típic
Últims casos d'èxit amb tecnologies de biomarcadors
1. Les anàlisis comparatives de transcriptomes de longitud completa revelen la dinàmica de desenvolupament de la tija de Gnetum luofuense
Revista: Fronteres en Genètica
Publicació: març de 2021
Paraules clau: MinION |Empalmament alternatiu |APA |lncRNA |Transcripcions expressades de manera diferenciada
Llegir el text complet
2. Moviment unidireccional de petits ARN de brots a arrels en heteroempelts interespecífiques
Revista: Nature Plants
Publicat: gener de 2021
Paraules clau: Nanopore |Il·lumina |detecció d'ARNm mòbil de longitud completa
3. L'anàlisi del transcriptoma de llarga durada de les arrels d'espàrrecs revela el mecanisme molecular de la tolerància a la sal induïda pels fongs micorrízics arbusculars.
Revista: Botànica Ambiental i Experimental
Publicat: gener de 2021
Paraules clau: MinION |Transcripcions expressades de manera diferenciada |Factors de transcripció |Empalmament alternatiu
4. Canvis de característiques fisiològiques i transcriptoma de longitud completa de les arrels i fulles de rosa (Rosa chinensis) en resposta a l'estrès per sequera
Revista: Plant and Cell Physiology
Publicat: Octubre de 2020
Paraules clau: PromethION |Transcripcions expressades de manera diferenciada |Predicció funcional |Isoformes empalmades |TF i lncRNA
5. Anàlisi i comparació integral de PacBio i seqüenciació d'ARN basada en nanopors del transcriptoma Arabidopsis
Revista: Plant Method
Publicat: abril de 2020
Paraules clau: GridION |PromethION |PacBio Seqüela |Illumina NovaSeq |Alineació del genoma |Identificació de la transcripció |Empalmament alternatiu |SSR |LncRNA |Quantificació isoforme
Notícies i més destacats té com a objectiu compartir els últims casos d'èxit amb Biomarker Technologies, capturant nous èxits científics així com tècniques destacades aplicades durant l'estudi.
Hora de publicació: 08-gen-2022