Nanoporoetan oinarritutako luzera osoko transkriptomaren sekuentziazioa
Nanoporoen sekuentziazioa beste sekuentziazio plataformetatik bereizten da, izan ere, nukleotidoak zuzenean irakurtzen dira DNA sintesirik gabe eta irakurketa luzeak sortzen ditu hamarnaka kilobasetan.Honek transkripzio luzeen irakurketa zuzena ahalbidetzen du eta ikasketa transkriptomikoen erronkei aurre egiteko.
√ Sekuentziaren alborapen espezifiko baxua
√ cDNAren irakurketa luzea geneen egitura aztertzeko
√ Datu gutxiago behar dira transkripzio kopuru bera estaltzeko
√ Gene bakoitzeko isoforma anitz identifikatzea
√ Adierazpenen kuantifikazioa isoforma mailan
Bioinformatikako kanalizazio tipikoa
Azken kasu arrakastatsuak Biomarker Teknologiekin
1. Luzera osoko transkriptomoen analisi konparatiboak Gnetum luofuense zurtoinaren garapen-dinamika agerian uzten du
Aldizkaria: Frontiers in Genetics
Argitalpena: 2021eko martxoa
Gako-hitzak: MinION |Ejuntura alternatiboa |APA |lncRNA |Adierazitako transkripzioak ezberdinetan
Irakurri testu osoa
2. RNA txikien norabide bakarreko mugimendua kimuetatik sustraietara heteroinjerto interespezifikoetan
Aldizkaria: Natura Landareak
Argitalpena: 2021eko urtarrila
Gako-hitzak: Nanopore |Illumina |luzera osoko mRNA mugikorraren detekzioa
3. Zainzurien sustraien transkriptoma luzeko azterketak onddo mikorriziko arbuskularrek eragindako gatz tolerantziaren mekanismo molekularra erakusten du.
Aldizkaria: Ingurumen eta Botanika Esperimentala
Argitalpena: 2021eko urtarrila
Gako-hitzak: MinION |Diferentzialki adierazitako transkripzioak |Transkripzio-faktoreak |Ejuntura alternatiboa
4. Ezaugarri Fisiologikoen Aldaketa eta Arrosaren (Rosa chinensis) Sustraiak eta Hostoak Lehortearen Estresari Erantzun
Aldizkaria: Landare eta Zelulen Fisiologia
Argitalpena: 2020ko urria
Gako-hitzak: PromethION |Diferentzialki adierazitako transkripzioak |Iragarpen funtzionala |Isoforma elkartuak |TF eta lncRNA
5. Arabidopsis transkriptomaren PacBio eta nanoporoetan oinarritutako RNA sekuentziazioaren analisia eta konparaketa integrala
Aldizkaria: Landare Metodoa
Argitalpena: 2020ko apirila
Gako-hitzak: GridION |PromethION |PacBio Sequel |Illumina NovaSeq |Genomaren lerrokatzea |Transkripzioaren identifikazioa |Ejuntura alternatiboa |SSR |LncRNA |Isoforma kuantifikazioa
Albisteak eta Nabarmenak Biomarker Technologiesekin azken kasu arrakastatsuak partekatzea du helburu, lorpen zientifiko berriak eta ikerketan zehar aplikatutako teknika nabarmenak jasoz.
Argitalpenaren ordua: 2022-08-08