Bütün transkriptomun ardıcıllığı - Illumina
Xüsusiyyətləri
● Tam transkriptomu ardıcıllaşdırmaq üçün ikili kitabxana: rRNT-nin tükənməsi, ardınca PE150 kitabxanasının hazırlanması və ölçü seçimi, ardınca SE50 kitabxanasının hazırlanması
● Ayrı-ayrı bioinformatika hesabatlarında mRNA, lncRNA, circRNA və miRNA-nın tam bioinformatika təhlili
● CeRNA şəbəkələrinin təhlili daxil olmaqla, birləşdirilmiş hesabatda bütün RNT ifadəsinin birgə təhlili.
Xidmət Üstünlükləri
●Tənzimləyici şəbəkələrin dərin təhlili: ceRNA şəbəkə analizi mRNA, lncRNA, circRNA və miRNA-nın birgə ardıcıllığı və hərtərəfli bioinformatik iş axını ilə təmin edilir.
●Hərtərəfli Annotasiya: biz Diferensial İfadə edilmiş Genləri (DEG) funksional olaraq şərh etmək və transkriptom cavabının altında yatan hüceyrə və molekulyar proseslər haqqında anlayışlar təqdim edərək müvafiq zənginləşdirmə analizini həyata keçirmək üçün çoxlu verilənlər bazasından istifadə edirik.
●Geniş Ekspertiza: Müxtəlif tədqiqat sahələrində 2000-dən çox bütöv transkriptom layihəsini müvəffəqiyyətlə bağlamaq təcrübəsi ilə komandamız hər bir layihəyə zəngin təcrübə gətirir.
●Ciddi Keyfiyyətə Nəzarət: biz nümunə və kitabxananın hazırlanmasından tutmuş ardıcıllıq və bioinformatikaya qədər bütün mərhələlərdə əsas nəzarət nöqtələrini həyata keçiririk.Bu dəqiq monitorinq ardıcıl yüksək keyfiyyətli nəticələrin çatdırılmasını təmin edir.
● Hərtərəfli Annotasiya: biz Diferensial İfadə edilmiş Genləri (DEG) funksional olaraq şərh etmək və transkriptom cavabının altında yatan hüceyrə və molekulyar proseslər haqqında anlayışlar təqdim edərək müvafiq zənginləşdirmə analizini həyata keçirmək üçün çoxlu verilənlər bazasından istifadə edirik.
●Satışdan sonra dəstək: Bizim öhdəliyimiz 3 aylıq satış sonrası xidmət müddəti ilə layihənin tamamlanmasından kənara çıxır.Bu müddət ərzində biz nəticələrlə bağlı istənilən sorğuları həll etmək üçün layihənin təqibi, problemlərin aradan qaldırılması yardımı və sual-cavab sessiyaları təklif edirik.
Nümunə Tələbləri və Çatdırılma
| Kitabxana | Ardıcıllıq strategiyası | Məlumat tövsiyə olunur | Keyfiyyətə nəzarət |
| rRNT tükəndi | Illumina PE150 | 16 Gb | Q30≥85% |
| Ölçü seçildi | Illumina SE50 | 10-20 milyon oxunur |
Nümunə tələbləri:
Nukleotidlər:
| Kons.(ng/μl) | Məbləğ (μg) | Saflıq | Dürüstlük |
| ≥ 100 | ≥ 1 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Zülal və ya DNT ilə çirklənmə məhduddur və ya yoxdur. | Bitkilər: RIN≥6.5 Heyvan: RIN≥7.0 5,0≥28S/18S≥1,0; məhdud və ya əsas yüksəklik yoxdur |
Tövsiyə olunan Nümunə Çatdırılması
Konteyner:
2 ml sentrifuqa borusu (qalay folqa tövsiyə edilmir)
Nümunə etiketləmə: Qrup+təkrar məsələn, A1, A2, A3;B1, B2, B3......
Göndərmə:
1.Quru buz: Nümunələr torbalara yığılmalı və quru buzda basdırılmalıdır.
2.RNAstabil borular: RNT nümunələri RNT stabilizasiya borusunda (məsələn, RNAstable®) qurudula və otaq temperaturunda göndərilə bilər.
Xidmət İş Akışı
Təcrübə dizaynı
Nümunə çatdırılması
RNT çıxarılması
Kitabxana tikintisi
Sıralama
Məlumatların təhlili
Satış sonrası xidmətlər
Bioinformatika
RNT ifadəsinə baxış
Diferensial ifadə olunan genlər
ceRNA analizi
Diferensial şəkildə ifadə olunan miRNA-lar və əlaqəli RNT-lər
Nəşrlərin seçilmiş kolleksiyası vasitəsilə BMKGene-nin bütün transkriptom sıralama xidmətləri ilə asanlaşdırılan tədqiqat irəliləyişlərini araşdırın.
Dai, Y. et al.(2022) 'RNT ardıcıllığı ilə müəyyən edilmiş Kashin-Beck xəstəliyində mRNA, lncRNA və miRNA-ların hərtərəfli ifadə profilləri', Molecular Omics, 18(2), s. 154-166.doi: 10.1039/D1MO00370D.
Liu, N. nan və başqaları.(2022) 'Qışlama dövründə Çanbay dağında Apis cerana'nın soyuq müqavimətinin tam uzunluqlu transkriptom analizi.', Gen, 830, səh. 146503–146503.doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
Wang, XJ et al.(2022) 'Kiçik Hüceyrəli Ağciyər Xərçəngində Rəqabət edən Endogen RNT Tənzimləmə Şəbəkələrinin Multi-Omics İnteqrasiya Əsaslı Prioritetləşdirilməsi: Molekulyar Xüsusiyyətlər və Dərman Namizədləri', Onkologiyada Sərhədlər, 12, səh.904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xu, P. et al.(2022) 'LncRNA/circRNA-miRNA-mRNA ifadə profillərinin inteqrasiya olunmuş təhlili fıstıqda kök düyün nematodlarına cavab olaraq potensial mexanizmlər haqqında yeni anlayışları ortaya qoyur', BMC Genomics, 23(1), səh. 1-12.doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7.
Yan, Z. və b.(2022) 'Tam transkriptom RNT ardıcıllığı qırmızı LED şüalanması ilə brokkolinin məhsuldan sonrakı keyfiyyətinin saxlanması ilə əlaqəli molekulyar mexanizmləri vurğulayır', Məhsuldan Sonra Biologiya və Texnologiya, 188, səh.111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
