Nanopore-based Full-length Transcriptome Sequencing
နျူကလီးအိုတဒ်များကို DNA ပေါင်းစပ်ခြင်းမရှိဘဲ တိုက်ရိုက်ဖတ်နိုင်ပြီး ကီလိုဘေ့စ်ဆယ်နှင့်ချီသော ရှည်လျားသောစာဖတ်ခြင်းကို ထုတ်ပေးသောကြောင့် နာနိုပရီဆက်ခြင်းလုပ်ငန်းသည် အခြား sequencing platform များနှင့် ကွဲပြားသည်။၎င်းသည် အစအဆုံး စာသားမှတ်တမ်းများကို တိုက်ရိုက်ဖတ်ရှုနိုင်စေပြီး စာသားမှတ်တမ်းလေ့လာမှုများတွင် စိန်ခေါ်မှုများကို ကိုင်တွယ်ဖြေရှင်းနိုင်စေပါသည်။
√ အစီအစဥ်အလိုက် ဘက်လိုက်မှု နည်းပါးသည်။
√ မျိုးရိုးဗီဇတည်ဆောက်ပုံလေ့လာမှုအတွက် cDNA ၏ အစအဆုံးဖတ်ခြင်း။
√ တူညီသော စာသားမှတ်တမ်းများကို ဖုံးအုပ်ရန် ဒေတာနည်းပါးသည်။
√ မျိုးဗီဇတစ်ခုစီတွင် များပြားသော isoforms များကို ဖော်ထုတ်ခြင်း။
√ isoform-level တွင် ဖော်ပြချက် ပမာဏ
ရိုးရိုးဇီဝနည်းပညာ ပိုက်လိုင်း
Biomarker Technologies ဖြင့် နောက်ဆုံးအောင်မြင်သော ကိစ္စများ
1. အစအဆုံး စာသားမှတ်တမ်းများ၏ နှိုင်းယှဉ်ပိုင်းခြားစိတ်ဖြာချက်များသည် Gnetum luofuense ပင်စည်ဖွံ့ဖြိုးမှုဆိုင်ရာ ဒိုင်းနမစ်များကို ဖော်ပြသည်
ဂျာနယ်- မျိုးရိုးဗီဇဆိုင်ရာ Frontiers
ထုတ်ဝေသည်- မတ်လ ၂၀၂၁
သော့ချက်စာလုံးများ- MinION |အစားထိုး splicing |APA |lncRNA |ကွဲပြားစွာ ဖော်ပြထားသော စာသားမှတ်တမ်းများ
စာသားအပြည့်အစုံဖတ်ပါ။
2. သီးခြားမျိုးကွဲမျိုးကွဲများတွင် အညွန့်များမှ အမြစ်များအထိ သေးငယ်သော RNA များ၏ တစ်ဖက်သတ်ရွေ့လျားမှု
ဂျာနယ်- သဘာဝအပင်များ
ထုတ်ဝေခဲ့သည်- ဇန်န၀ါရီလ 2021
Keywords: Nanopore |Illumina |မိုဘိုင်း mRNA အစအဆုံး ထောက်လှမ်းခြင်း။
3. ကညွှတ်အမြစ်များ၏ အရှည်ကို သရုပ်ဖော်ပုံ ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်းသည် arbuscular mycorrhizal မှိုကြောင့် ဖြစ်ပေါ်လာသော ဆားခံနိုင်ရည်၏ မော်လီကျူးယန္တရားကို ဖော်ပြသည်
ဂျာနယ်- ပတ်ဝန်းကျင်နှင့် စမ်းသပ် ရုက္ခဗေဒ
ထုတ်ဝေခဲ့သည်- ဇန်န၀ါရီလ 2021
သော့ချက်စာလုံးများ- MinION |ကွဲပြားစွာ ဖော်ပြထားသော စာသားမှတ်တမ်းများ |စာသားမှတ်တမ်းများ |အစားထိုး ပေါင်းစပ်ခြင်း။
4. ဇီဝကမ္မသွင်ပြင်လက္ခဏာ ပြောင်းလဲမှုများနှင့် နှင်းဆီ (Rosa chinensis) ၏ အမြစ်များနှင့် အရွက်များ မိုးခေါင်မှုဒဏ်ကို တုံ့ပြန်သည့်အနေဖြင့်
ဂျာနယ်- အပင်နှင့် ဆဲလ်ဇီဝကမ္မဗေဒ
ထုတ်ဝေသည်- အောက်တိုဘာ၊ 2020
သော့ချက်စာလုံးများ- PromethION |ကွဲပြားစွာ ဖော်ပြထားသော စာသားမှတ်တမ်းများ |လုပ်ဆောင်နိုင်သော ခန့်မှန်းချက် |Spliced isoforms |TF နှင့် lncRNA
5. PacBio နှင့် Arabidopsis transcriptome ၏ နာနိုပရီအခြေခံ RNA စီတန်းခြင်းကို ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်းနှင့် ပြည့်စုံသော နှိုင်းယှဉ်ခြင်း
ဂျာနယ်- အပင်နည်းလမ်း
ထုတ်ဝေခဲ့သည်- ဧပြီလ 2020 ခုနှစ်
သော့ချက်စာလုံးများ- GridION |PromethION |PacBio နောက်ဆက်တွဲ |Illumina NovaSeq |ဂျီနိုမ် ချိန်ညှိမှု |စာသားအထောက်အထား အထောက်အထား |အစားထိုး splicing |SSR |LncRNA |Isoform ပမာဏ
သတင်းများနှင့် ပေါ်လွင်ချက်များ Biomarker Technologies နှင့် နောက်ဆုံးအောင်မြင်သော ကိစ္စများကို မျှဝေရန် ရည်ရွယ်ပြီး၊ ဆန်းသစ်သော သိပ္ပံနည်းကျ အောင်မြင်မှုများကို ဖမ်းယူကာ လေ့လာမှုအတွင်း အသုံးပြုသည့် ထင်ရှားသော နည်းပညာများကို ဖမ်းယူရန် ရည်ရွယ်သည်။
စာတိုက်အချိန်- Jan-08-2022