Sequenciamento de transcriptoma completo baseado em nanoporos
O sequenciamento Nanopore se distingue de outras plataformas de sequenciamento, pois os nucleotídeos são lidos diretamente sem síntese de DNA e geram leituras longas em dezenas de quilobases.Isso permite a leitura direta de transcrições completas e enfrenta os desafios dos estudos transcriptômicos.
√ Baixo viés específico de sequência
√ Leitura completa de cDNA para estudos de estrutura genética
√ Menos dados necessários para cobrir o mesmo número de transcrições
√ Identificação de múltiplas isoformas por gene
√ Quantificação de expressão em nível de isoforma
Pipeline típico de bioinformática
Últimos casos de sucesso com tecnologias de biomarcadores
1. Análises comparativas de transcriptomas completos revelam a dinâmica de desenvolvimento do caule Gnetum luofuense
Jornal: Fronteiras na Genética
Publicado: março de 2021
Palavras-chave: MinION |Emenda alternativa |APA |lncRNA |Transcrições diferencialmente expressas
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2. Movimento unidirecional de pequenos RNAs dos brotos às raízes em heteroenxertos interespecíficos
Diário: Plantas da Natureza
Publicado: janeiro de 2021
Palavras-chave: Nanoporo |Iluminar |detecção de mRNA móvel completo
3. A análise completa do transcriptoma de raízes de aspargos revela o mecanismo molecular de tolerância ao sal induzida por fungos micorrízicos arbusculares
Revista: Botânica Ambiental e Experimental
Publicado: janeiro de 2021
Palavras-chave: MinION |Transcrições expressas diferencialmente |Fatores de transcrição |Emenda alternativa
4. Mudanças características fisiológicas e transcriptoma completo de raízes e folhas de rosa (Rosa chinensis) em resposta ao estresse hídrico
Revista: Fisiologia Vegetal e Celular
Publicado: outubro de 2020
Palavras-chave: PromethION |Transcrições expressas diferencialmente |Previsão funcional |Isoformas emendadas |TF e lncRNA
5. Análise e comparação abrangente do sequenciamento de RNA baseado em PacBio e nanoporos do transcriptoma de Arabidopsis
Diário: Método Planta
Publicado: abril de 2020
Palavras-chave: GridION |PromethION |Sequela PacBio |Illumina NovaSeq |Alinhamento do genoma |Identificação da transcrição |Emenda alternativa |RSS |LncRNA |Quantificação de isoformas
Notícias e Destaques visa compartilhar os últimos casos de sucesso com Biomarker Technologies, capturando novas conquistas científicas, bem como técnicas proeminentes aplicadas durante o estudo.
Horário da postagem: 08 de janeiro de 2022