Секвениране на транскриптоми с пълна дължина на базата на нанопори
Секвенирането на нанопори се отличава от другите платформи за секвениране по това, че нуклеотидите се четат директно без ДНК синтез и генерира дълги четения при десетки килобази.Това дава възможност за директно четене на транскрипти с пълна дължина и справяне с предизвикателствата в транскриптомичните изследвания.
√ Ниско отклонение, специфично за последователността
√ Отчитане на пълна дължина на cDNA за изследвания на генната структура
√ Необходими са по-малко данни за покриване на същия брой преписи
√ Идентифициране на множество изоформи на ген
√ Количествено определяне на експресия на ниво изоформа
Типичен тръбопровод за биоинформатика
Последни успешни случаи с биомаркерни технологии
1. Сравнителни анализи на транскриптоми с пълна дължина разкриват динамиката на развитие на стъблото на Gnetum luofuense
Вестник: Граници в генетиката
Публикувано: март 2021 г
Ключови думи: MinION |Алтернативно снаждане |APA |lncRNA |Диференциално изразени транскрипти
Прочетете пълния текст
2. Еднопосочно движение на малки РНК от издънки към корени в междувидови хетерографти
Вестник: Природни растения
Публикувано: януари 2021 г
Ключови думи: Нанопор |Илюмина |откриване на мобилна иРНК в пълна дължина
3. Пълен транскриптомен анализ на корени от аспержи разкрива молекулярния механизъм на солева толерантност, предизвикана от арбускуларни микоризни гъбички
Вестник: Екологична и експериментална ботаника
Публикувано: януари 2021 г
Ключови думи: MinION |Диференциално изразени транскрипти |Транскрипционни фактори |Алтернативно снаждане
4. Промени в физиологичните характеристики и транскриптом с пълна дължина на корените и листата на роза (Rosa chinensis) в отговор на стреса от суша
Вестник: Физиология на растенията и клетките
Публикувано: октомври 2020 г
Ключови думи: PromethION |Диференциално изразени транскрипти |Функционална прогноза |Сплайсирани изоформи |TF и lncRNA
5. Анализ и цялостно сравнение на PacBio и базирано на нанопори РНК секвениране на транскриптома на Arabidopsis
Вестник: Растителен метод
Публикувано: април 2020 г
Ключови думи: GridION |PromethION |Продължение на PacBio |Illumina NovaSeq |Подреждане на генома |Идентификация на препис |Алтернативно снаждане |SSR |LncRNA |Количествено определяне на изоформата
Новини и Акценти има за цел да сподели най-новите успешни случаи с Biomarker Technologies, да улови нови научни постижения, както и видни техники, приложени по време на проучването.
Време на публикуване: 8 януари 2022 г