Metagenomika (NGS)

Illumina ilə ov tüfəngi metagenomikası, mürəkkəb nümunələrdən DNT-ni birbaşa ardıcıllıqla təyin etməklə mikrobiomları öyrənmək üçün məşhur bir vasitədir və həm taksonomik, həm də funksional müxtəlifliyin öyrənilməsinə imkan verir. BMKCloud metagenomik (NGS) boru kəməri keyfiyyətə nəzarət və metagenom yığımı ilə başlayır, buradan genlər proqnozlaşdırılır və çoxsaylı verilənlər bazalarından istifadə edərək funksiya və taksonomiya üçün qeyd edilmiş artıq olmayan məlumat dəstlərinə qruplaşdırılır. Bu məlumat nümunədaxili taksonomik müxtəlifliyi (alfa müxtəlifliyi) və nümunələrarası müxtəlifliyi (beta müxtəlifliyi) təhlil etmək üçün istifadə olunur. Qruplar arasında diferensial analiz həm parametrik, həm də qeyri-parametrik testlərdən istifadə edərək iki qrup arasında fərqlənən OTU-ları və bioloji funksiyaları tapır, korrelyasiya təhlili isə bu fərqləri ətraf mühit amilləri ilə əlaqələndirir.