16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
Xidmət Xüsusiyyətləri
● Ardıcıllıq platforması: Illumina NovaSeq.
● Digər gücləndirmə hədəfləri arasında 16S, 18S və ITS-in qısa bölgələrinin gücləndirilməsi.
● Amplikonun çevik seçimləri.
● Çoxlu gücləndirmə hədəfləri ilə əvvəlki layihə təcrübəsi.
Xidmət Üstünlükləri
●İzolyasiyasız:Ətraf mühit nümunələrində mikrob tərkibinin sürətli müəyyən edilməsi.
●Yüksək qətnamə: Ətraf mühit nümunələrində az miqdarda komponentlərdə.
●Geniş tətbiq olunur: Müxtəlif mikrob icma tədqiqatları.
●Hərtərəfli Bioinformatik Analiz: Verilənlər bazası, annotasiya, OTU/ASV baxımından müxtəlif analizlərlə ən son QIIME2 paketi (mikrob ekologiyasına kəmiyyət anlayışı).
●Geniş Ekspertiza: Hər il həyata keçirilən 150 min amplikon ardıcıllığı layihəsi ilə BMKGENE on ildən artıq təcrübə, yüksək ixtisaslı analiz qrupu, hərtərəfli məzmun və əla satış sonrası dəstəyi gətirir.
Xidmət Xüsusiyyətləri
| Kitabxana | Ardıcıllıq Strategiyası | Məlumat tövsiyə olunur |
| Amplikon | Illumina PE250 | 50/100/300K teq (Cütləri Oxu) |
Xidmət Tələbləri
| Konsentrasiya (ng/µL) | Ümumi məbləğ (ng) | Həcm (µL) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● Torpaq/lil: 1-2g
● Bağırsaq məzmunu-heyvan: 0,5-2q
● Bağırsaq tərkibi-həşərat: 0,1-0,25q
● Bitki səthi (zənginləşdirilmiş çöküntü): 0,1-0,5 q
● Fermentasiya bulyonu ilə zənginləşdirilmiş çöküntü): 0,1-0,5 q
● Nəcis (iri heyvanlar): 0,5-2 q
● Nəcis (siçan): 3-5 dənə
● Ağciyər alveolyar yuyulması mayesi: filtr kağızı
● Vaginal tampon: 5-6 tampon
● Dəri/genital tampon/tüpürcək/ağızın yumşaq toxuması/faringeal tampon/rektal tampon: 2-3 tampon
● Səth mikroorqanizmləri: filtr kağızı
● Su hövzəsi/hava/biofilm: filtr kağızı
● Endofitlər: 1-2q
● Diş lövhəsi: 0,5-1 q
Xidmət İş Akışı
Nümunə çatdırılması
Kitabxana tikintisi
Sıralama
Məlumatların təhlili
Satış sonrası xidmətlər
Aşağıdakı təhlili ehtiva edir:
- Xam məlumatların keyfiyyətinə nəzarət
- OTU klasterləşdirmə / De-noise (ASV)
- OTU annotasiyası
- Alpha müxtəliflik təhlili: Shannon, Simpson və ACE daxil olmaqla çoxsaylı indekslər.
- Beta müxtəliflik təhlili
- Qruplararası təhlil
- Korrelyasiya təhlili: ətraf mühit amilləri ilə OUT tərkibi və müxtəlifliyi arasında
- 16S funksional gen proqnozu
Taksonomik paylanma histoqramı
taksonomik bolluğun klasterləşməsi istilik xəritəsi
Alfa müxtəlifliyinin təhlili: seyrəkləşmə əyrisi
beta müxtəliflik təhlili: NMDS
Qruplararası analiz: LEFSE biomarker kəşfi
Seçilmiş nəşrlər toplusu vasitəsilə BMKGene-nin Illumina ilə amplikon sıralama xidmətləri ilə təmin edilən irəliləyişləri araşdırın.
Dong, C. et al. (2022) 'Eucommia ulmoides-də rizosfer torpağının və qabıq mikrobiotasının yığılması, əsas mikrobiotası və funksiyası', Mikrobiologiyada sərhədlər, 13. doi: 10.3389/FMICB.2022.855317/FULL.
Li, Y. və başqaları. (2023) 'Siçanlarda Gardnerella vaginalis tərəfindən törədilən bakterial vaginozun müalicəsi üçün sintetik bakterial konsorsium transplantasiyası', Microbiome, 11(1), səh. 1-14. doi: 10.1186/s40168-023-01497-y
Yang, J., Fu, Y. və Liu, H. (2022) "Lunar Palace 365" yer əsaslı qapalı bioregenerativ həyatı dəstəkləmə təcrübəsi zamanı toplanan hava tozunun mikrobiomları', Ətraf Mühit Mikrobiomları, 17(1), səh. 1-20. doi: 10.1186/S40793-022-00399-0/FIGURES/8.
Yin, S. et al. (2022) 'Azot transformasiyası ilə əlaqəli funksional genlərin xammaldan asılı bolluğu kompostlamada azot itkisini idarə edir', Bioresurs Texnologiyası, 361, səh. 127678. doi: 10.1016/J.BIORTECH.2022.127678.
