16S/18S/ITS Amplikon Ardıcıllığı-NGS
Xidmət Xüsusiyyətləri
● Ardıcıllıq platforması: Illumina NovaSeq.
● Digər gücləndirmə hədəfləri ilə yanaşı, 16S, 18S və ITS-in qısa bölgələrinin gücləndirilməsi.
● Amplikonun çevik seçimləri.
● Birdən çox gücləndirmə hədəfi ilə əvvəlki layihə təcrübəsi.
Xidmət Üstünlükləri
●İzolyasiyasız:Ətraf mühit nümunələrində mikrob tərkibinin sürətli müəyyən edilməsi.
●Yüksək ÇözünürlükƏtraf mühit nümunələrində az miqdarda komponentlərdə.
●Geniş tətbiq olunurMüxtəlif mikrob icması tədqiqatları.
●Hərtərəfli Bioinformativ TəhlilVerilənlər bazası, annotasiya, OTU/ASV baxımından müxtəlif təhlillərlə ən son QIIME2 paketi (mikrob ekologiyasına kəmiyyət baxımından baxış).
●Geniş EkspertizaHər il həyata keçirilən 150 min amplikon ardıcıllıq layihəsi ilə BMKGENE, on ildən artıq təcrübə, yüksək ixtisaslı təhlil qrupu, hərtərəfli məzmun və əla satış sonrası dəstək təklif edir.
Xidmət Xüsusiyyətləri
| Kitabxana | Ardıcıllıq Strategiyası | Tövsiyə olunan məlumatlar |
| Amplikon | Illumina PE250 | 50/100/300K etiketlər (Oxu Cütləri) |
Xidmət Tələbləri
| Konsentrasiya (ng/µL) | Ümumi məbləğ (ng) | Həcm (µL) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● Torpaq/çamur: 1-2 q
● Bağırsaq tərkibi - heyvan mənşəli: 0.5-2 q
● Bağırsaq tərkibi - həşərat: 0.1-0.25 q
● Bitki səthi (zənginləşdirilmiş çöküntü): 0.1-0.5 q
● Fermentasiya bulyonu ilə zənginləşdirilmiş çöküntü): 0.1-0.5 q
● Nəcis (böyük heyvanlar): 0,5-2 q
● Nəcis (siçan): 3-5 dənə
● Ağciyər alveolyar lavaj mayesi: filtr kağızı
● Vaginal tampon: 5-6 tampon
● Dəri/genital yaxma/tüpürcək/ağız boşluğunun yumşaq toxuması/udlaq yaxması/rektal yaxma: 2-3 yaxma
● Səth mikroorqanizmləri: filtr kağızı
● Su hövzəsi/hava/biofilm: filtr kağızı
● Endofitlər: 1-2 q
● Diş lövhəsi: 0.5-1 q
Xidmət İş Axını
Nümunə çatdırılması
Kitabxana tikintisi
Ardıcıllıq
Məlumatların təhlili
Satış sonrası xidmətlər
Aşağıdakı təhlili əhatə edir:
- Xam məlumatların keyfiyyətinə nəzarət
- OTU klasterləşdirməsi / Səs-küyün azaldılması (ASV)
- OTU annotasiyası
- Alfa müxtəlifliyinin təhlili: Şennon, Simpson və ACE daxil olmaqla çoxsaylı indekslər.
- Beta müxtəliflik təhlili
- Qruplararası təhlil
- Korrelyasiya təhlili: ətraf mühit amilləri ilə OUT tərkibi və müxtəlifliyi arasında
- 16S funksional gen proqnozu
Taksonomik paylanmanın histoqramı
taksonomik bolluq klasterləşmə istilik xəritəsi
Alfa müxtəlifliyinin təhlili: nadirləşmə əyrisi
beta müxtəliflik təhlili: NMDS
Qruplararası analiz: LEFSE biomarkerinin kəşfi
BMKGene-nin Illumina ilə birlikdə amplikon ardıcıllıq xidmətləri tərəfindən təmin edilən irəliləyişləri seçilmiş nəşrlər kolleksiyası vasitəsilə araşdırın.
Dong, C. və b. (2022) 'Eucommia ulmoides-də Rizosfer Torpağı və Qabıq Mikrobiotasının Yığıncağı, Əsas Mikrobiotası və Funksiyası', Mikrobiologiyada Sərhədlər, 13. doi: 10.3389/FMICB.2022.855317/FULL.
Li, Y. və b. (2023) 'Siçanlarda Gardnerella vaginalis tərəfindən induksiya edilən bakterial vaginozun müalicəsi üçün sintetik bakterial konsorsium transplantasiyası', Microbiome, 11(1), səh. 1–14. doi: 10.1186/s40168-023-01497-y
Yang, J., Fu, Y. və Liu, H. (2022) 'Yerüstü qapalı bioregenerativ həyat dəstəyi təcrübəsi “Ay Sarayı 365” zamanı toplanan hava tozunun mikrobiomları', Environmental Microbiomes, 17(1), səh. 1–20. doi: 10.1186/S40793-022-00399-0/FIGURES/8.
Yin, S. və b. (2022) 'Kompostlaşdırmada azotun transformasiyası ilə əlaqəli funksional genlərin yemdən asılı bolluğu nəzarət altında olan azot itkisi', Bioresource Technology, 361, səh. 127678. doi: 10.1016/J.BIORTECH.2022.127678.
