istinad genomu ilə mRNA-seq (NGS)
RNA-seq, genomlar və proteomlar arasındakı boşluğu aradan qaldıran həyat və bitkiçilik elmləri üzrə standart bir vasitədir. Onun gücü yeni transkriptlərin kəşf edilməsində və onların ifadəsinin bir analizdə kəmiyyətləndirilməsindədir. Müqayisəli transkriptomik tədqiqatlar üçün geniş istifadə olunur, mutantları vəhşi növlərlə müqayisə etmək və ya müəyyən şərtlər altında gen ifadəsini aşkar etmək kimi müxtəlif əlamətlərə və ya fenotiplərə aid genlərə işıq salır. BMKCloud mRNA (Referans) APP ifadə kəmiyyətləndirməsini, diferensial ifadə təhlilini (DEG) və ardıcıllıq strukturu təhlillərini mRNA-seq (NGS) bioinformatika boru kəmərinə inteqrasiya edir və oxşar proqram təminatının güclü tərəflərini birləşdirərək rahatlığı və istifadəçi dostuluğu təmin edir. İstifadəçilər RNA-seq məlumatlarını buluda yükləyə bilərlər və Tətbiq hərtərəfli, birdəfəlik bioinformatik analiz həlli təklif edir. Bundan əlavə, o, müştəri təcrübəsinə üstünlük verir və istifadəçilərin xüsusi ehtiyaclarına uyğun fərdiləşdirilmiş əməliyyatlar təklif edir. İstifadəçilər parametrləri təyin edə və boru kəməri missiyasını özləri təqdim edə, interaktiv hesabatı yoxlaya, məlumatları/diaqramları görə və hədəf geninin seçilməsi, funksional klasterləşmə, diaqramlaşdırma və s. kimi məlumatların çıxarılması işlərini tamamlaya bilərlər.
Platforma:İllumina, MGI
Strategiya:RNT-Seq
Düzən: Parçalanmış, təmiz məlumatlar.
Kitabxana növü:fr-telsiz, fr-firsttel və ya fr-ikincitel
Oxuma müddəti:150 bp
Fayl növü:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz və ya *.fq.gz. Sistem.fastq fayllarını fayl adlarına uyğun olaraq avtomatik olaraq cütləşdirir,məs., *_1.fastq *._2.fastq ilə cütləşmiş.
Nümunələrin sayı:Say məhdudiyyəti yoxdurnümunələrin sayı artdıqca analiz müddəti də artacaqnümunələr böyüyür.
Tövsiyə olunan Məlumat Miqdari:Nümunə başına 6G
