-
Xromatin İmmunoprecipitation Sequencing (ChIP-seq)
ChIP-Seq histon modifikasiyası, transkripsiya faktorları və digər DNT ilə əlaqəli zülallar üçün DNT hədəflərinin genom geniş profilini təmin edir.O, xüsusi zülal-DNT komplekslərini bərpa etmək üçün xromatin immuno-çökmənin (ChIP) seçiciliyini, bərpa edilmiş DNT-nin yüksək məhsuldarlıqlı ardıcıllığı üçün yeni nəsil ardıcıllığın (NGS) gücü ilə birləşdirir.Bundan əlavə, zülal-DNT kompleksləri canlı hüceyrələrdən bərpa olunduğu üçün bağlanma yerləri müxtəlif hüceyrə tiplərində və toxumalarında və ya müxtəlif şəraitdə müqayisə oluna bilər.Tətbiqlər transkripsiya tənzimləməsindən tutmuş inkişaf yollarına, xəstəlik mexanizmlərinə və ondan kənara qədərdir.
Platforma: Illumina NovaSeq Platforması
-
Bütün genom bisulfit ardıcıllığı
Sitozində (5-mC) beşinci mövqedə olan DNT metilasiyası gen ifadəsinə və hüceyrə aktivliyinə əsaslı təsir göstərir.Anormal metilasiya nümunələri xərçəng kimi bir sıra vəziyyət və xəstəliklərlə əlaqələndirilmişdir.WGBS, tək əsas rezolyusiyada genom boyu metilasiyanı öyrənmək üçün qızıl standart halına gəldi.
Platforma: Illumina NovaSeq Platforması
-
Yüksək Ötürmə Ardıcıllığı ilə Transposaza Əlçatan Xromatinin Təhlili (ATAC-seq)
ATAC-seq, gen ifadəsinin qlobal epigenetik nəzarəti üçün vacib olan genom-geniş xromatin əlçatanlığının təhlili üçün yüksək məhsuldarlıqlı ardıcıllıq metodudur.Sequencing adapterləri hiperaktiv Tn5 transposazası ilə açıq xromatin bölgələrinə daxil edilir.PCR gücləndirilməsindən sonra ardıcıllıq kitabxanası qurulur.Bütün açıq xromatin bölgələri yalnız bir transkripsiya faktorunun və ya müəyyən histon dəyişdirilmiş bölgənin bağlanma yerləri ilə məhdudlaşmır, müəyyən bir məkan-zaman şəraitində əldə edilə bilər.
-
Azaldılmış təmsil bisulfit ardıcıllığı (RRBS)
DNT metilasiyası tədqiqatı həmişə xəstəlik tədqiqatlarında aktual mövzu olmuşdur və gen ifadəsi və feno-tipik əlamətlərlə sıx bağlıdır.RRBS DNT metilasiyası tədqiqatı üçün dəqiq, səmərəli və qənaətcil bir üsuldur.Promotor və CpG ada bölgələrinin enzimatik parçalanma (Msp I) ilə zənginləşdirilməsi, Bisulfit ardıcıllığı ilə birlikdə yüksək dəqiqlikli DNT metilasiyasının aşkarlanmasını təmin edir.
Platforma: Illumina NovaSeq Platforması
