Поўнаметражнае секвеніраванне транскрыптама на аснове нанапор
Секвеніраванне нанапораў адрозніваецца ад іншых платформаў секвеніравання тым, што нуклеатыды счытваюцца непасрэдна без сінтэзу ДНК і генеруюць доўгія счытванні з дзесяткамі кілабаз.Гэта дае магчымасць прамога счытвання поўнаметражных транскрыптаў і вырашэння праблем у транскрыптамічных даследаваннях.
√ Нізкі зрушэнне ў залежнасці ад паслядоўнасці
√ Поўнаметражнае счытванне кДНК для вывучэння структуры генаў
√ Для ахопу такой жа колькасці стэнаграм патрабуецца менш дадзеных
√ Ідэнтыфікацыя некалькіх ізаформ на ген
√ Колькасная ацэнка экспрэсіі на ўзроўні ізаформы
Тыповы канвеер біяінфарматыкі
Апошнія паспяховыя выпадкі з тэхналогіямі біямаркераў
1. Параўнальны аналіз поўнаметражных транскрыптамаў паказвае дынаміку развіцця ствала Gnetum luofuense
Часопіс: Frontiers in Genetics
Апублікавана: сакавік 2021 г
Ключавыя словы: MinION |Альтэрнатыўнае зрошчванне |АПА |lncRNA |Дыферэнцыяльна выяўленыя транскрыпты
Чытаць поўны тэкст
2. Аднанакіраваны рух малых РНК ад уцёкаў да каранёў у міжвідавых гетеротрансплантатах
Часопіс: Прырода раслін
Апублікавана: студзень 2021 г
Ключавыя словы: Nanopore |Ілюміна |поўнаметражнае выяўленне мабільнай мРНК
3. Поўнаметражны аналіз транскрыптаў каранёў спаржы паказвае малекулярны механізм солевынослівасці, выкліканы арбускулярнымі мікарызнымі грыбамі
Часопіс: Экалагічная і эксперыментальная батаніка
Апублікавана: студзень 2021 г
Ключавыя словы: MinION |Дыферэнцыяльна выяўленыя стэнаграмы |Фактары транскрыпцыі |Альтэрнатыўнае зрошчванне
4. Змены фізіялагічных характарыстык і поўная транскрыптома каранёў і лісця ружы (Rosa chinensis) у адказ на стрэс ад засухі
Часопіс: Фізіялогія раслін і клетак
Апублікавана: кастрычнік 2020 г
Ключавыя словы: PromethION |Дыферэнцыяльна выяўленыя стэнаграмы |Функцыянальнае прагназаванне |Зрошчаныя ізаформы |TF і lncRNA
5. Аналіз і ўсебаковае параўнанне PacBio і секвенирования РНК на аснове нанапор транскрыптому Arabidopsis
Часопіс: раслінны метад
Апублікавана: красавік 2020 г
Ключавыя словы: GridION |PromethION |Працяг PacBio |Illumina NovaSeq |Выраўноўванне геному |Ідэнтыфікацыя стэнаграмы |Альтэрнатыўнае зрошчванне |ССР |LncRNA |Колькаснае вызначэнне ізаформы
Навіны і асноўныя моманты накіравана на абмен апошнімі паспяховымі кейсамі з Biomarker Technologies, фіксаванне новых навуковых дасягненняў, а таксама вядомых метадаў, якія прымяняюцца падчас даследавання.
Час публікацыі: 8 студзеня 2022 г