Secvențierea transcriptomului de lungime completă pe bază de nanopori
Secvențierea Nanopore se distinge de alte platforme de secvențiere, prin aceea că nucleotidele sunt citite direct fără sinteza ADN și generează citiri lungi la zeci de kilobaze.Acest lucru permite citirea directă a transcrierilor complete și abordarea provocărilor din studiile transcriptomice.
√ Prejudecată scăzută specifică secvenței
√ Citirea completă a cADN-ului pentru studiile structurii genelor
√ Mai puține date necesare pentru a acoperi același număr de transcrieri
√ Identificarea mai multor izoforme per genă
√ Cuantificarea expresiei la nivel de izoforme
Conducta tipică de bioinformatică
Ultimele cazuri de succes cu tehnologiile Biomarker
1. Analizele comparative ale transcriptomilor de lungime completă dezvăluie dinamica dezvoltării tulpinii Gnetum luofuense
Jurnal: Frontiere în genetică
Publicat: martie 2021
Cuvinte cheie: Minion |Îmbinare alternativă |APA |lncRNA |Transcrieri exprimate diferențiat
Citiți textul integral
2. Mișcarea unidirecțională a ARN-urilor mici de la lăstari la rădăcini în heterogrefe interspecifice
Jurnal: Nature Plants
Publicat: ianuarie 2021
Cuvinte cheie: Nanopore |Illumina |detectarea ARNm mobil de lungime completă
3. Analiza transcriptomului de lungime completă a rădăcinilor de sparanghel dezvăluie mecanismul molecular al toleranței la sare indus de ciupercile micorizale arbusculare
Jurnal: Environmental and Experimental Botany
Publicat: ianuarie 2021
Cuvinte cheie: Minion |Transcrieri exprimate diferențiat |Factori de transcriere |Îmbinare alternativă
4. Modificări caracteristice fiziologice și transcriptom de lungime completă a rădăcinilor și frunzelor de trandafir (Rosa chinensis) ca răspuns la stresul de secetă
Jurnal: Fiziologie vegetală și celulară
Publicat: Oct. 2020
Cuvinte cheie: PromethION |Transcrieri exprimate diferențiat |Predicție funcțională |Izoforme îmbinate |TF și lncARN
5. Analiza și compararea cuprinzătoare a PacBio și secvențierea ARN pe bază de nanopori a transcriptomului Arabidopsis
Jurnal: Metoda plantelor
Publicat: aprilie 2020
Cuvinte cheie: GridION |PromethION |PacBio Sequel |Illumina NovaSeq |Alinierea genomului |Identificarea transcripției |Îmbinare alternativă |SSR |LncRNA |Cuantificare izoforme
Știri și Repere își propune să împărtășească cele mai recente cazuri de succes cu Biomarker Technologies, surprinzând realizări științifice noi, precum și tehnici proeminente aplicate în timpul studiului.
Ora postării: 08-ian-2022