Celodĺžkové transkriptómové sekvenovanie založené na nanopóroch
Sekvenovanie nanoporov sa odlišuje od iných sekvenčných platforiem tým, že nukleotidy sa čítajú priamo bez syntézy DNA a generujú dlhé čítania v desiatkach kilobáz.To umožňuje priame čítanie prepisov v plnej dĺžke a riešenie problémov v transkriptomických štúdiách.
√ Nízka odchýlka špecifická pre sekvenciu
√ Odčítanie cDNA v plnej dĺžke na štúdie génovej štruktúry
√ Menej údajov potrebných na pokrytie rovnakého počtu prepisov
√ Identifikácia viacerých izoforiem na gén
√ Kvantifikácia expresie na úrovni izoforiem
Typický bioinformatický kanál
Najnovšie úspešné prípady s technológiami Biomarker
1. Porovnávacie analýzy transkriptómov plnej dĺžky odhaľujú dynamiku vývoja kmeňa Gnetum luofuense
Časopis: Frontiers in Genetics
Zverejnené: marec 2021
Kľúčové slová: MinION |Alternatívne spájanie |APA |lncRNA |Rozdielne vyjadrené transkripty
Prečítajte si celý text
2. Jednosmerný pohyb malých RNA z výhonkov ku koreňom v medzidruhových heterograftoch
Časopis: Nature Plants
Zverejnené: január 2021
Kľúčové slová: Nanopore |Illumina |detekcia mobilnej mRNA v plnej dĺžke
3. Kompletná transkriptómová analýza koreňov špargle odhaľuje molekulárny mechanizmus tolerancie soli vyvolanej arbuskulárnymi mykoríznymi hubami
Časopis: Environmentálna a experimentálna botanika
Zverejnené: január 2021
Kľúčové slová: MinION |Rozdielne vyjadrené prepisy |Transkripčné faktory |Alternatívne spájanie
4. Fyziologické charakteristické zmeny a úplný transkriptóm koreňov a listov ruže (Rosa chinensis) v reakcii na stres zo sucha
Časopis: Fyziológia rastlín a buniek
Zverejnené: október 2020
Kľúčové slová: PromethION |Rozdielne vyjadrené prepisy |Funkčná predpoveď |Zostrihané izoformy |TF a lncRNA
5. Analýza a komplexné porovnanie PacBio a nanopórového sekvenovania RNA transkriptómu Arabidopsis
Časopis: Plant Method
Zverejnené: apríl 2020
Kľúčové slová: GridION |PromethION |PacBio pokračovanie |Illumina NovaSeq |Zarovnanie genómu |Identifikácia prepisu |Alternatívne spájanie |SSR |LncRNA |Kvantifikácia izoforiem
Novinky a najvýznamnejšie udalosti sa zameriava na zdieľanie najnovších úspešných prípadov s Biomarker Technologies, zachytávanie nových vedeckých úspechov, ako aj významných techník použitých počas štúdie.
Čas odoslania: Jan-08-2022