İstilik xəritəsi
Matris məlumat faylı matris məlumatlarını süzgəcdən keçirə, normallaşdıra və qruplaşdıra bilən istilik xəritəsinin tərtib edilməsi üçün istifadə olunur.Əsasən müxtəlif nümunələr arasında gen ifadə səviyyəsinin klaster analizi üçün istifadə olunur.
Gen Annotasiyası
Gen funksiyasının annotasiyası FASTA faylında ardıcıllığın müxtəlif verilənlər bazası ilə xəritələşdirilməsi ilə həyata keçirilir.
Gen Annotasiyası
Əsas Yerli Alignment Axtarış Aləti
CDS_UTR_Proqnoz
Bu alət məlum zülal verilənlər bazası və ORF proqnozuna qarşı partlayışa əsaslanan verilmiş transkript ardıcıllıqlarında kodlaşdırma bölgələrini (CDS) və kodlaşdırmayan bölgələri (UTR) proqnozlaşdırmaq üçün nəzərdə tutulmuşdur.
Manhetten süjeti
Manhetten planı çox sayda məlumat nöqtəsi ilə məlumatların göstərilməsinə imkan verir.Genom geniş assosiasiya tədqiqatlarında (GWAS) geniş istifadə olunur.
Sirklər
CIRCOS diaqramı genomda SNP, InDeL, SV, CNV paylamalarının birbaşa təqdimatına imkan verir.
GO_Zənginləşdirmə
TopGO funksional zənginləşdirmə üçün nəzərdə tutulmuş bir vasitədir.TopGO-Bioconductor paketi diferensial ifadə analizi, GO zənginləşdirmə təhlili və nəticələrin vizuallaşdırılmasından ibarətdir.O, topGO_BP, topGO_CC və topGO_MF nəticələrini ehtiva edən "Qrafik" adlı çıxışı olan qovluq yaradacaq.
WGCNA
WGCNA, gen birgə ifadə modullarını aşkar etmək üçün geniş istifadə olunan məlumatların öyrənilməsi üsuludur.O, mikroarray məlumatları və növbəti nəsil ardıcıllığından yaranan gen ifadəsi məlumatları da daxil olmaqla müxtəlif ifadə verilənlər toplusuna tətbiq olunur.
InterProScan
InterPro protein ardıcıllığının təhlili və təsnifatı
GO_KEGG_Zənginləşdirmə
Bu alət təmin edilmiş gen dəsti və müvafiq annotasiya əsasında GO zənginləşdirmə histoqramını, KEGG zənginləşdirmə histoqramını və KEGG zənginləşdirmə yolunu yaratmaq üçün dizayn edilmişdir.