バイオマーカー技術を利用したナノポア RNA シーケンスの最新の成功事例

ナノポアシーケンシングは、DNA 合成を行わずにヌクレオチドが直接読み取られ、数十キロベースの長いリードを生成するという点で、他のシーケンシングプラットフォームとは異なります。これにより、全長転写産物を直接読み出し、トランスクリプトーム研究における課題に取り組むことが可能になります。

√ シーケンス固有のバイアスが低い

√ 遺伝子構造研究のためのcDNAの全長読み出し

√ 同じ数のトランスクリプトをカバーするために必要なデータが少なくなる

√ 遺伝子ごとの複数のアイソフォームの同定

√ アイソフォームレベルでの発現定量化

1. 全長トランスクリプトームの比較分析により、Gnetum luofuense 茎の発生動態が明らかに

ジャーナル: 遺伝学のフロンティア

発行日：2021年3月

キーワード: ミニオン |代替スプライシング |アパ |ＬＮＣＲＮＡ |差次的に発現される転写物

2. 種間異種移植片における低分子RNAの一方向移動

ジャーナル: 自然植物

発行日：2021年1月

キーワード: ナノポア |イルミナ |全長モバイル mRNA 検出

3. アスパラガス根の全長トランスクリプトーム解析によりアーバスキュラー菌根菌による耐塩性の分子機構が解明

ジャーナル: 環境および実験植物学

発行日：2021年1月

キーワード: ミニオン |差次的に発現される転写物 |転写因子 |交互接続

4. 乾燥ストレスに応答したバラ（Rosa chinensis）の根と葉の生理学的特性変化と全長トランスクリプトーム

ジャーナル: 植物と細胞生理学

発行日：2020年10月

キーワード: プロメチオン |差次的に発現される転写物 |機能予測 |スプライスされたアイソフォーム |TFとlncRNA

5. PacBio とシロイヌナズナのトランスクリプトームのナノポアベースの RNA シーケンスの分析と包括的な比較

ジャーナル: プラントメソッド

発行日：2020年4月

ニュースとハイライト この研究は、最新の成功事例をバイオマーカーテクノロジーズと共有し、新たな科学的成果や研究中に適用された著名な技術を把握することを目的としています。

投稿時刻: 2022 年 1 月 8 日

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