Nanopore ki baze sou tout longè transcriptome sekans
Nanopore sekans distenge tèt li ak lòt platfòm sekans, nan ke nukleotid yo li dirèkteman san sentèz ADN epi jenere lekti long nan dè dizèn de kilobaz.Sa a pèmèt lekti dirèk nan relve nòt plen longè ak abòde defi yo nan syans transcriptomic.
√ Ba sekans-espesifik patipri
√ Lekti tout longè cDNA pou etid estrikti jèn yo
√ Mwens done ki nesesè pou kouvri menm kantite relve nòt
√ Idantifikasyon plizyè izofòm pou chak jèn
√ Kantifikasyon ekspresyon sou nivo izofòm
Tiyo byoinformatik tipik
Dènye ka siksè ak teknoloji Biomarker
1. Analiz konparatif transcriptom tout longè revele dinamik devlopman tij Gnetum luofuense
Jounal: Fwontyè nan Jenetik
Pibliye: Mas 2021
Mo kle: Minion |Altènatif splicing |APA |lncRNA |Transkripsyon diferan eksprime
Li tèks konplè
2. Mouvman inidireksyon nan ti RNA soti nan lans nan rasin nan heterograft entèspesifik
Jounal: Plant Nature
Pibliye: janvye 2021
Mo kle: Nanopore |Ilumina |deteksyon mRNA mobil tout longè
3. Analiz transcriptom tout longè rasin aspèj yo revele mekanis molekilè tolerans sèl ki pwovoke pa fongis mikoriz arbuscular.
Jounal: Botanik anviwònman ak eksperimantal
Pibliye: janvye 2021
Mo kle: Minion |Transkripsyon diferan eksprime |Faktè transcription |Altènatif splicing
4. Chanjman Fizyolojik Karakteristik ak tout longè transcriptom Rose (Rosa chinensis) Rasin ak fèy an repons a estrès sechrès
Jounal: Plant ak selil fizyoloji
Pibliye: Oktòb 2020
Mo kle: PromethION |Transkripsyon diferan eksprime |Prediksyon fonksyonèl |Isoforms épissé |TF ak lncRNA
5. Analiz ak konparezon konplè PacBio ak sekans RNA ki baze sou nanopore nan transcriptom Arabidopsis la
Jounal: Plant Metòd
Pibliye: Avril 2020
Mo kle: GridION |PromethION |PacBio Sequel |Illumina NovaSeq |aliyman genòm |Transkripsyon idantifikasyon |Altènatif splicing |SSR |LncRNA |Isoform quantification
Nouvèl ak Pwen esansyèl vize pou pataje dènye ka siksè yo ak Biomarker Technologies, kaptire nouvo reyalizasyon syantifik ak teknik enpòtan aplike pandan etid la.
Tan poste: Jan-08-2022