Sequenza di transcriptome full-length basatu in nanopori
A sequencing Nanopore si distingue da altre piattaforme di sequenza, in chì i nucleotidi sò letti direttamente senza sintesi di DNA è genera letture longu à decine di kilobases.Questu permette a lettura diretta di trascrizioni integrali è affruntà e sfide in studii transcriptomici.
√ Bassa preghjudiziu specificu di sequenza
√ Lettura integrale di cDNA per studii di struttura di geni
√ Meno dati necessarii per copre u listessu numeru di trascrizioni
√ Identificazione di parechje isoforme per genu
√ Quantificazione di l'espressione à u livellu di l'isoforma
Pipeline di Bioinformatica tipica
Ultimi Casi di Successu cù Biomarker Technologies
1. L'analisi comparative di transcriptomi full-length revelanu a dinamica di sviluppu di u troncu di Gnetum luofuense
Journal: Frontières in Genetica
Publicatu: marzu 2021
Parole chjave: MinION |Splicing alternativu |APA |lncRNA |Trascrizioni spressi di manera differenziale
Leghjite u testu cumpletu
2. Movimentu unidirezionale di picculi RNA da i rimjiet à e radiche in heterografts interspecific
Journal: Nature Plants
Publicatu: ghjennaghju 2021
Parole chjave: Nanopore |Illumina |rilevazione di mRNA mobile à longu andà
3. L'analisi di transcriptome à longu andà di e radiche d'asparagus revela u mecanismu moleculare di a tolleranza di u sali indutta da fungi mycorhizal arbuscular.
Journal: Botanica Ambientale è Sperimentale
Publicatu: ghjennaghju 2021
Parole chjave: MinION |Trascrizioni spressi diffarentimenti |Fattori di trascrizzione |Splicing alternativu
4. Cambiamenti caratteristiche fisiulogichi è Transcriptome Full-Length di Rose (Rosa chinensis) Roots è Foglie in Risposta à u Stress di Seca
Journal: Physiology Plant and Cell
Publicatu: Ottobre 2020
Keywords: PromethION |Trascrizioni spressi diffarentimenti |Predizzione funziunale |Isoforme spliced |TF è lncRNA
5. Analisi è paragone cumpletu di PacBio è sequencing RNA basatu in nanopori di u transcriptome Arabidopsis
Journal: Metudu di a pianta
Publicatu: Apr. 2020
Parole chjave: GridION |PromethION |PacBio Sequel |Illumina NovaSeq |Allineamentu di u genoma |Identificazione di a trascrizione |Splicing alternativu |SSR |LncRNA |Quantificazione isoforme
Notizie è Highlights hà u scopu di sparta l'ultimi casi di successu cù Biomarker Technologies, catturà novi successi scientifichi è tecniche prominenti applicate durante u studiu.
Tempu di Postu: 08-Jan-2022