Nanopore негизделген Толук узундуктагы Транскриптомдун ырааттуулугу
Nanopore секвенциясы башка секвенирлөө платформаларынан айырмаланат, мында нуклеотиддер түздөн-түз ДНК синтезисиз окулат жана ондогон килобазаларда узак окууларды жаратат.Бул толук метраждуу стенограммаларды түз окууга жана транскриптомиялык изилдөөлөрдөгү кыйынчылыктарды чечүүгө мүмкүнчүлүк берет.
√ Төмөнкү ырааттуулуктун өзгөчөлүгү
√ Ген структурасын изилдөө үчүн cDNAнын толук узундуктагы окуусу
√ Бир эле сандагы стенограммаларды жабуу үчүн азыраак маалымат талап кылынат
√ Бир генге бир нече изоформаларды аныктоо
√ Изоформа деңгээлинде туюнтмаларды сандаштыруу
Типтүү биоинформатика түтүгү
Biomarker Technologies менен акыркы ийгиликтүү учурлар
1. Толук узундуктагы транскриптомдордун салыштырма анализи Gnetum luofuense сабагынын өнүгүү динамикасын аныктайт.
Журнал: Генетикадагы чек аралар
Жарыяланганы: 2021-жылдын марты
Keywords: MinION |Альтернативалык бириктирүү |APA |lncRNA |Дифференциалдык түрдө чагылдырылган транскрипттер
Толук текстти окуу
2. Түр аралык гетерогранспланттарда кичинекей РНКлардын бүчүрлөрдөн тамырларга бир багыттуу кыймылы
Журнал: Табигый өсүмдүктөр
Жарыяланганы: январь, 2021
Keywords: Nanopore |Illumina |толук узундуктагы мобилдик mRNA аныктоо
3. Аспарагустун тамырларынын толук узундуктагы транскриптомдук анализи арбускулярдуу микоризалык козу карындар тарабынан пайда болгон тузга толеранттуулуктун молекулярдык механизмин ачып берет.
Журнал: Экологиялык жана эксперименталдык ботаника
Жарыяланганы: январь, 2021
Keywords: MinION |Дифференциалдуу туюнтулган транскрипттер |Транскрипция факторлору |Альтернативалык бириктирүү
4. Кургакчылык стрессине жооп катары роза (Rosa chinensis) тамыры менен жалбырактарынын физиологиялык мүнөздөмөлөрүнүн өзгөрүүсү жана толук узундуктагы транскриптому
Журнал: Өсүмдүктөрдүн жана клеткалардын физиологиясы
Жарыяланганы: 2020-жылдын октябры
Keywords: PromethION |Дифференциалдуу туюнтулган транскрипттер |Функционалдык болжолдоо |Spliced isoforms |TF жана lncRNA
5. PacBio жана Арабидопсис транскриптомунун нанопора негизиндеги РНК тизмегин талдоо жана комплекстүү салыштыруу
Журнал: Өсүмдүк методу
Жарыяланганы: апрель 2020
Keywords: GridION |PromethION |PacBio уландысы |Illumina NovaSeq |Геномду тегиздөө |Транскрипт идентификация |Альтернативалык бириктирүү |ССР |LncRNA |Изоформанын квантификациясы
Жаңылыктар жана кызыктуу окуялар акыркы ийгиликтүү учурларды Biomarker Technologies менен бөлүшүүгө, жаңы илимий жетишкендиктерге, ошондой эле изилдөө учурунда колдонулган көрүнүктүү ыкмаларга ээ болууга багытталган.
Посттун убактысы: Январь-08-2022