Penjujukan Transkriptom Penuh Berasaskan Nanopore
Penjujukan nanopori membezakan dirinya daripada platform penjujukan yang lain, kerana nukleotida dibaca terus tanpa sintesis DNA dan menjana bacaan panjang pada puluhan kilobases.Ini memperkasakan pembacaan terus transkrip panjang penuh dan menangani cabaran dalam kajian transkriptomi.
√ Pincang khusus jujukan yang rendah
√ Bacaan penuh cDNA untuk kajian struktur gen
√ Kurang data yang diperlukan untuk menampung bilangan transkrip yang sama
√ Pengenalpastian pelbagai isoform bagi setiap gen
√ Kuantifikasi ungkapan pada tahap isoform
Talian Paip Bioinformatik Biasa
Kes Berjaya Terkini dengan Teknologi Biomarker
1. Analisis perbandingan transkriptom penuh mendedahkan dinamik perkembangan batang Gnetum luofuense
Jurnal: Sempadan dalam Genetik
Diterbitkan: Mac 2021
Kata kunci: Minion |Penyambungan alternatif |APA |lncRNA |Transkrip yang dinyatakan secara berbeza
Baca Teks Penuh
2. Pergerakan satu arah RNA kecil dari pucuk ke akar dalam heterograf interspesifik
Jurnal: Tumbuhan Alam Semula Jadi
Diterbitkan: Jan. 2021
Kata kunci: Nanopore |Illumina |pengesanan mRNA mudah alih penuh
3. Analisis transkriptom penuh akar asparagus mendedahkan mekanisme molekul toleransi garam yang disebabkan oleh kulat mikoriza arbuskular
Jurnal: Botani Alam Sekitar dan Eksperimen
Diterbitkan: Jan. 2021
Kata kunci: Minion |Transkrip yang dinyatakan secara berbeza |Faktor transkripsi |Penyambungan alternatif
4. Perubahan Ciri Fisiologi dan Transkriptom Penuh Akar dan Daun Mawar (Rosa chinensis) Sebagai Tindak Balas terhadap Tekanan Kemarau
Jurnal: Fisiologi Tumbuhan dan Sel
Diterbitkan: Okt. 2020
Kata kunci: PromethION |Transkrip yang dinyatakan secara berbeza |Ramalan fungsi |Isoform bersambung |TF dan lncRNA
5. Analisis dan perbandingan komprehensif PacBio dan penjujukan RNA berasaskan nanopore bagi transkriptom Arabidopsis
Jurnal: Kaedah Tumbuhan
Diterbitkan: Apr. 2020
Kata kunci: GridION |PromethION |Sekuel PacBio |Illumina NovaSeq |Penjajaran genom |Pengenalan transkrip |Penyambungan alternatif |SSR |LncRNA |Kuantifikasi isoform
Berita dan Sorotan bertujuan untuk berkongsi kes-kes kejayaan terbaharu dengan Biomarker Technologies, menangkap pencapaian saintifik novel serta teknik menonjol yang digunakan semasa kajian.
Masa siaran: Jan-08-2022