רצף Transcriptome באורך מלא מבוסס Nanopore
ריצוף Nanopore מבדיל את עצמו מפלטפורמות ריצוף אחרות, בכך שהנוקלאוטידים נקראים ישירות ללא סינתזת DNA ויוצר קריאות ארוכות בעשרות קילו-בסיסים.זה מאפשר קריאה ישירה של תמלילים באורך מלא והתמודדות עם האתגרים במחקרי תעתיק.
√ הטיה נמוכה ספציפית לרצף
√ קריאה באורך מלא של cDNA למחקרי מבנה גנים
√ פחות נתונים נדרשים לכיסוי אותו מספר תמלילים
√ זיהוי מספר איזופורמים לכל גן
√ כימות ביטוי ברמת איזופורמה
צינור ביואינפורמטיקה טיפוסי
מקרים מוצלחים אחרונים עם טכנולוגיות Biomarker
1. ניתוחים השוואתיים של תעתיקים באורך מלא חושפים דינמיקה התפתחותית של גזע Gnetum luofuense
כתב עת: Frontiers in Genetics
פורסם: מרץ 2021
מילות מפתח: MinION |שחבור אלטרנטיבי |APA |lncRNA |תמלילים בעלי ביטוי דיפרנציאלי
קרא את הטקסט המלא
2. תנועה חד-כיוונית של RNAs קטנים משרצים לשורשים ב-interspecific heterografts
כתב עת: Nature Plants
פורסם: ינואר 2021
מילות מפתח: Nanopore |אילומינה |זיהוי mRNA נייד באורך מלא
3. ניתוח תעתיק באורך מלא של שורשי אספרגוס חושף את המנגנון המולקולרי של סבילות למלח המושרה על ידי פטריות מיקוריזאליות.
כתב עת: בוטניקה סביבתית וניסויית
פורסם: ינואר 2021
מילות מפתח: MinION |תמלילים בעלי ביטוי דיפרנציאלי |גורמי תמלול |שחבור אלטרנטיבי
4. שינויים אופייניים פיזיולוגיים ותעתיק באורך מלא של שורשים ועלים של ורד (Rosa chinensis) בתגובה ללחץ בצורת
כתב עת: פיזיולוגיה של צמחים ותאים
פורסם: אוקטובר 2020
מילות מפתח: PromethION |תמלילים בעלי ביטוי דיפרנציאלי |חיזוי פונקציונלי |איזופורמים שחבורים |TF ו-lncRNA
5. ניתוח והשוואה מקיפה של PacBio ורצף RNA מבוסס ננופוריות של תעתיק ארבידופסיס
כתב עת: שיטת הצמח
פורסם: אפריל 2020
מילות מפתח: GridION |PromethION |PacBio המשך |Illumina NovaSeq |יישור הגנום |זיהוי תמלול |שחבור אלטרנטיבי |SSR |LncRNA |כימות איזופורם
חדשות ודגשים שואפת לחלוק את המקרים המוצלחים האחרונים עם Biomarker Technologies, ללכוד הישגים מדעיים חדשים כמו גם טכניקות בולטות שיושמו במהלך המחקר.
זמן פרסום: ינואר-08-2022