Նանոպորների վրա հիմնված Ամբողջական տրանսկրիպտոմային հաջորդականություն
Nanopore sequencing-ը տարբերվում է հաջորդականության այլ հարթակներից, քանի որ նուկլեոտիդները ընթերցվում են ուղղակիորեն առանց ԴՆԹ-ի սինթեզի և առաջացնում են երկար ընթերցումներ տասնյակ կիլոբազաներով:Սա հնարավորություն է տալիս ուղղակիորեն կարդալ ամբողջական տեքստերը և հաղթահարել տրանսկրիպտոմիական ուսումնասիրությունների մարտահրավերները:
√ Ցածր հաջորդականության հատուկ կողմնակալություն
√ cDNA-ի ամբողջական ընթերցում գեների կառուցվածքի ուսումնասիրությունների համար
√ Ավելի քիչ տվյալներ են պահանջվում նույն թվով տառադարձումների համար
√ Մեկ գենի համար բազմաթիվ իզոֆորմների նույնականացում
√ Արտահայտման քանակականացում իզոֆորմի մակարդակում
Տիպիկ կենսաինֆորմատիկայի խողովակաշար
Վերջին հաջողված դեպքերը Biomarker Technologies-ով
1. Ամբողջական տրանսկրիպտոմների համեմատական վերլուծությունները բացահայտում են Gnetum luofuense ցողունի զարգացման դինամիկան
Հանդես. Սահմաններ գենետիկայի մեջ
Հրատարակված՝ Մարտ 2021
Բանալի բառեր: MinION |Այլընտրանքային միացում |APA |lncRNA |Դիֆերենցիալ արտահայտված արտագրություններ
Կարդացեք ամբողջական տեքստը
2. Փոքր ՌՆԹ-ների միակողմանի շարժում ընձյուղներից դեպի արմատներ միջտեսակային հետերոփոխպատվաստումներում
Հանդես. Բնության բույսեր
Հրատարակված՝ 2021թ
Բանալի բառեր: Nanopore |Illumina |ամբողջ երկարությամբ շարժական mRNA հայտնաբերում
3. Ծնեբեկի արմատների ամբողջական տրանսկրիպտոմային վերլուծությունը բացահայտում է աղի հանդուրժողականության մոլեկուլային մեխանիզմը, որն առաջացել է արբոսկուլյար միկորիզային սնկերի կողմից:
Հանդես՝ բնապահպանական և փորձարարական բուսաբանություն
Հրատարակված՝ 2021թ
Բանալի բառեր: MinION |Դիֆերենցիալ արտահայտված արտագրություններ |Տառադարձման գործոններ |Այլընտրանքային միացում
4. Վարդերի (Rosa chinensis) արմատների և տերևների ֆիզիոլոգիական բնութագրական փոփոխությունները և ամբողջ երկարությամբ տրանսկրիպտոմը՝ ի պատասխան երաշտի սթրեսի։
Հանդես. Բույսերի և բջիջների ֆիզիոլոգիա
Հրատարակված՝ 2020 թվականի հոկտ
Բանալի բառեր: PromethION |Դիֆերենցիալ արտահայտված արտագրություններ |Ֆունկցիոնալ կանխատեսում |Սփռված իզոֆորմներ |TF և lncRNA
5. PacBio-ի և Արաբիդոպսիսի տրանսկրիպտոմի նանոպորների վրա հիմնված ՌՆԹ-ի հաջորդականության վերլուծություն և համապարփակ համեմատություն
Հանդես. Բույսերի մեթոդ
Հրատարակված՝ 2020 թվականի ապրիլի
Բանալի բառեր: GridION |Պրոմեթիոն |PacBio շարունակություն |Illumina NovaSeq |Գենոմի հավասարեցում |Սղագրության նույնականացում |Այլընտրանքային միացում |ԽՍՀ |LncRNA |Իզոֆորմի քանակականացում
Նորություններ և կարևոր իրադարձություններ նպատակն է կիսել վերջին հաջողված դեպքերը Biomarker Technologies-ի հետ՝ ֆիքսելով նոր գիտական ձեռքբերումները, ինչպես նաև ուսումնասիրության ընթացքում կիրառվող նշանավոր տեխնիկան:
Հրապարակման ժամանակը՝ Հունվար-08-2022