Nakabatay sa Nanopore Full-length Transcriptome Sequencing
Ang pagkakasunud-sunod ng nanopore ay nakikilala ang sarili nito mula sa iba pang mga platform ng pagkakasunud-sunod, dahil ang mga nucleotide ay direktang binabasa nang walang synthesis ng DNA at bumubuo ng mahabang pagbabasa sa sampu-sampung kilobases.Binibigyan nito ng kapangyarihan ang direktang pagbabasa ng mga full-length na transcript at pagharap sa mga hamon sa transcriptomic na pag-aaral.
√ Mababang sequence-specific bias
√ Buong-haba na pagbabasa ng cDNA para sa mga pag-aaral ng istruktura ng gene
√ Mas kaunting data ang kinakailangan upang masakop ang parehong bilang ng mga transcript
√ Pagkilala sa maraming isoform bawat gene
√ Ang dami ng ekspresyon sa antas ng isoform
Karaniwang Bioinformatics Pipeline
Pinakabagong Mga Matagumpay na Kaso sa Biomarker Technologies
1. Ang mga paghahambing na pagsusuri ng mga full-length na transcriptome ay nagpapakita ng Gnetum luofuense stem developmental dynamics
Journal: Mga Hangganan sa Genetics
Na-publish: Mar. 2021
Mga Keyword: Minion |Alternatibong splicing |APA |lncRNA |Differentially expressed transcripts
Basahin ang Buong teksto
2. Unidirectional na paggalaw ng maliliit na RNA mula sa mga shoots hanggang sa mga ugat sa interspecific heterografts
Journal: Mga Halamang Kalikasan
Na-publish: Ene. 2021
Mga Keyword: Nanopore |Illumina |full-length na mobile mRNA detection
3. Ang buong-haba na transcriptome analysis ng mga ugat ng asparagus ay nagpapakita ng molekular na mekanismo ng pagpapahintulot sa asin na dulot ng arbuscular mycorrhizal fungi
Journal: Environmental at Experimental Botany
Na-publish: Ene. 2021
Mga Keyword: Minion |Mga transcript na may pagkakaiba-iba |Mga salik ng transkripsyon |Alternatibong splicing
4. Mga Pagbabago sa Physiological na Katangian at Full-Length Transcriptome ng Rosas (Rosa chinensis) Roots at Dahon bilang Tugon sa Drought Stress
Journal: Plant and Cell Physiology
Na-publish: Okt. 2020
Mga Keyword: PromethION |Mga transcript na may pagkakaiba-iba |functional na hula |Mga pinagdugtong na isoform |TF at lncRNA
5. Pagsusuri at komprehensibong paghahambing ng PacBio at nanopore-based RNA sequencing ng Arabidopsis transcriptome
Journal: Paraan ng Halaman
Na-publish: Abr. 2020
Mga Keyword: GridION |PromethION |PacBio Sequel |Illumina NovaSeq |Genome alignment |Transcript identification |Alternatibong splicing |SSR |LncRNA |Isoform quantification
Mga Balita at Highlight naglalayong ibahagi ang pinakabagong matagumpay na mga kaso sa Biomarker Technologies, pagkuha ng mga nobelang siyentipikong tagumpay pati na rin ang mga kilalang pamamaraan na inilapat sa panahon ng pag-aaral.
Oras ng post: Ene-08-2022