Məhsullar

Prokaryotik RNT ardıcıllığı

Prokaryotik RNT ardıcıllığı, dəyişən hüceyrə transkriptomunu təhlil edərək, müəyyən bir anda RNT-nin varlığını və miqdarını aşkar etmək üçün növbəti nəsil ardıcıllığından (NGS) istifadə edir.Şirkətimizin prokaryotik RNT ardıcıllığı, xüsusi olaraq istinad genomları olan prokariotlara yönəlib, sizə transkriptom profili, gen strukturu təhlili və s. təmin edir. O, əsas elmi tədqiqatlar, dərman preparatlarının tədqiqatı və inkişafı və s. üçün geniş şəkildə tətbiq olunub.

Platforma: Illumina NovaSeq Platforması

Bizimlə əlaqə saxlayın

Xidmət Təfərrüatları

Xidmət Xüsusiyyətləri

Platforma: Illumina NovaSeq platforması, PE150

Kitabxana növü: 350bp daxil cDNA kitabxanası (pik paylanmadan asılıdır)

Ardıcıllıq strategiyası: Cütlənmiş Son 150 bp

Tövsiyə olunan məlumat miqdarı: 2 Gb xam data/nümunə

Bioinformatika

(1) Məlumatların keyfiyyətinə nəzarət ardıcıllığı: Nukleotidlərin paylanması, Əsas keyfiyyət paylanması, rRNT nisbətinin qiymətləndirilməsi;

(2) Ardıcıllıqla düzülmə təhlili: Alignment nəticə statistikası, Sekvensiyanın doyması, ardıcıllığın əhatə dairəsi;

(3) Referans genom annotasiyası (NR, Swiss-Prot, Pfam, COG, GO, KEGG);

(4) İfadə təhlili: İfadə paylanması (İki və ya daha çox nümunə ilə), Nümunələr arasında ifadənin təhlili (Venn təhlili, Korrelyasiya təhlili, PCA təhlili);

(5) Diferensial ifadə təhlili (İki və ya daha çox nümunə ilə);

(6) Gen dəsti təhlili: Venn analizi, Klaster analizi, Funksiya annotasiya təhlili (COG, GO, KEGG), Funksiya zənginləşdirmə təhlili (GO, KEGG), Funksiya zənginləşdirmə akkord qrafiki, İpath analizi;

(7) sRNT analizi: sRNT proqnozu, sRNA annotasiyası (Blast, sRNAMap, sRNATarBase, SIPHT, Rfam), sRNA ikincil strukturunun proqnozlaşdırılması, sRNA hədəf geninin proqnozlaşdırılması;

(8) Transkript strukturunun təhlili: Operon təhlili, Transkripsiyanın başlanğıc və bitmə yerlərinin proqnozlaşdırılması, UTR annotasiyası və təhlili, Promoter ardıcıllığının proqnozlaşdırılması, SNP/InDel təhlili (SNP/InDel annotasiyası, SNP/InDel regional paylanması, SNP statistikası).