Nanopórus alapú teljes hosszúságú transzkriptom szekvenálás
A nanopórusos szekvenálás abban különbözik a többi szekvenálási platformtól, hogy a nukleotidokat közvetlenül, DNS-szintézis nélkül olvassák le, és hosszú leolvasásokat generálnak tíz kilobázison.Ez lehetővé teszi a teljes hosszúságú átiratok közvetlen kiolvasását és a transzkriptomikai vizsgálatok kihívásainak kezelését.
√ Alacsony szekvencia-specifikus torzítás
√ A cDNS teljes hosszúságú kiolvasása a génszerkezeti vizsgálatokhoz
√ Kevesebb adat szükséges ugyanannyi átirat lefedéséhez
√ Génenként több izoforma azonosítása
√ Kifejezés mennyiségi meghatározása izoforma szinten
Tipikus bioinformatikai csővezeték
Legújabb sikeres esetek biomarker technológiákkal
1. A teljes hosszúságú transzkriptomok összehasonlító elemzése feltárja a Gnetum luofuense szár fejlődési dinamikáját
Folyóirat: Frontiers in Genetics
Megjelenés: 2021. március
Kulcsszavak: MinION |Alternatív toldás |APA |lncRNS |Eltérően kifejezett átiratok
Olvassa el a teljes szöveget
2. Kis RNS-ek egyirányú mozgása a hajtásoktól a gyökerekig interspecifikus heterograftokban
Folyóirat: Nature Plants
Közzétéve: 2021. jan
Kulcsszavak: Nanopore |Illumina |teljes hosszúságú mobil mRNS kimutatás
3. A spárgagyökerek teljes hosszúságú transzkriptom elemzése feltárja az arbuscularis mikorrhiza gombák által kiváltott sótolerancia molekuláris mechanizmusát
Folyóirat: Environmental and Experimental Botany
Közzétéve: 2021. jan
Kulcsszavak: MinION |Eltérően kifejezett átiratok |Transzkripciós faktorok |Alternatív toldás
4. A rózsa (Rosa chinensis) gyökereinek és leveleinek élettani jellemző változásai és teljes hosszúságú átirata a szárazságstressz hatására
Folyóirat: Plant and Cell Physiology
Közzétéve: 2020. okt
Kulcsszavak: PromethION |Eltérően kifejezett átiratok |Funkcionális előrejelzés |Összeillesztett izoformák |TF és lncRNS
5. Az Arabidopsis transzkriptom PacBio és nanopórus alapú RNS szekvenálásának elemzése és átfogó összehasonlítása
Folyóirat: Plant Method
Megjelenés: 2020. ápr
Kulcsszavak: GridION |PromethION |PacBio folytatás |Illumina NovaSeq |Genom-illesztés |Átirat azonosítása |Alternatív toldás |SSR |LncRNA |Izoform mennyiségi meghatározása
Hírek és kiemelések célja a legújabb sikeres esetek megosztása a Biomarker Technologies vállalattal, megörökítve az új tudományos eredményeket, valamint a tanulmány során alkalmazott kiemelkedő technikákat.
Feladás időpontja: 2022-08-08