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नैनोपोर अनुक्रमण खुद को अन्य अनुक्रमण प्लेटफार्मों से अलग करता है, जिसमें न्यूक्लियोटाइड को डीएनए संश्लेषण के बिना सीधे पढ़ा जाता है और दसियों किलोबेस पर लंबे समय तक पढ़ा जाता है।यह पूर्ण-लंबाई प्रतिलेखों को सीधे पढ़ने और ट्रांसक्रिप्टोमिक अध्ययन में चुनौतियों से निपटने का अधिकार देता है।

√ कम अनुक्रम-विशिष्ट पूर्वाग्रह

√ जीन संरचना अध्ययन के लिए सीडीएनए का पूर्ण-लंबाई रीडआउट

√ समान संख्या में प्रतिलेखों को कवर करने के लिए कम डेटा की आवश्यकता होती है

√ प्रति जीन एकाधिक आइसोफॉर्म की पहचान

√ आइसोफॉर्म-स्तर पर अभिव्यक्ति मात्रा का ठहराव